mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCACCATTTGAAATCGGT CGATTTCTCCTGGTGTTCAGA ACACAGGCTGACCGATTTCTCCTGGTGTTCAGAGTCTGTTTTTGTCTAGCACCATTTGAAATCGGTTATGATGTA GAAGAATTTGAGAAGAAAAGTATATTCTTGAACATGTTGGGTTGGGAAAGGGGGACAGTGCAGGGATGGGGCTGTGTTCAGTAGAAACTCAGAGGCTTGAGCAGAGCCAGGGTTTGTGATGGTCTTCCTATGGACAGGTAGCAGCAGCCACCAGCAGGAACCTGTTGGTGGGGCCTTTCAGTGTGTGACTGGGCAGCACTGGGTTGGGTACGTGATCGCAGTCGGCAGCGGGAGGGCCGTGGACCGGAAGGACTCTCTCATCACACCAGCACTGTCCACCTGCTCCTACGCGCCGTGGAACATTCAGCTGCAGTTGCTGAGTAGGTGAAATCAGACTTGCCACCTGTACCATCAAGGTGTGGACCCCACTGAGCACCACCGGACCCATCTCTTACACAGGCTGACCGATTTCTCCTGGTGTTCAGAGTCTGTTTTTGTCTAGCACCATTTGAAATCGGTTATGATGTAGGGGGAAAAGCAGCAGCCACAAGGTCTCGTGCCAAGTCTGGTCAGCAGCAGCCTGTGGCTTCCTGGAAGATGGATGGGCAGAGAGAGGGGGAAGGGAAGGTACACCTTTTCCTACTGACTTCCTTAACTACATCTACAATACTTTATGCACAGGTAATAGATCATTTAGTGGATTTTTAGAAACAAATCACCATAGTGTACCTAATGTCCTCAGTTTGCTAAAATGTGATAGTGCTGTAAACTCCAAATTGATTTCTGTTAAATTATCTTTCTGTTCATGCATCCTGACCTTAATAAATATTTACTGTATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 3 1 3' arm Bos_sp. mirnest mir-29 4e-18 eca-mir-29c 3e-37 -24.4 ..(((...(((((((((((...(((((((.(((...........))))))))))...)))))))))))...))). (-24.4)