mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGTGTGTGTACATATATAT ATATATATATACATATATGTA TGACATATTAAATTTTATTTATATGTGTGTGTACATATATATATATATATATACATATATGTACTTTAAACTTTATACAGC ATGCCAAGGAACTGTGCTAAATGCTTTATAAGTTTATTTCATTTGATTTTCACAACAACCCTGCTCATTTTACAGTTGAAGAAACTGAGGCAAACAGAAGTTAAGTGACTTATCCGGGGTCACAGAGCTAGTAATTGTCTGAGGCTGGATTTGAACTCAGGTCTTACTTACTCCAGACCTGGGACTCTGTGCCACCTAGCTACCTAAAAAAGAAATACATCAGTAAAACATTTGAAATAAACAAGCTCAGAAGGTAATATAAAATGGATAACCTTATTGCTGACATATTAAATTTTATTTATATGTGTGTGTACATATATATATATATATATACATATATGTACTTTAAACTTTATACAGCACATTTACAGTTTTATATGCAACCCTCCTTTTTGTTCTTTGTTTAGGGAATTATTCATATTGAGATTTCATTTGTTCAGTCATTTTTCAGTAGTGTCTGACTCTCCATGATCCCATTTGGGGTGTTGGCAGAGATATTGGAGTGGTTTGCCATTTCCTTCTCCAGTTCAGTTTACAGATGAGGAAACTGAGACAAACAGGGTTAAGTGACTAGCTCAGGGTCACACAGCTAGTAAGTGTATGAAGCCAGATTTGAACTCAGCCAGATAGGTTTTCCTGACTCCAGGCTTGGAACTCTATCCACTGTGCCAACTAGCTGCTTTTGATGTCTATTTTATAATGAAAAGTTTGGATGTTTTCTTGCTTTCAAAATAAAAAAGAATAAG 4 0 5' arm Macropus_eugenii mirnest 100 100 -16.5 ........((((.((((..((((((((((((((.(((((....))))).))))))))))))))...)))).))))...... (-16.5)