mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAGTGCTGGGATTAAAGGAAT TTCTCTGTTTAACAGCACTGGC TCAAGACAGCGTTTCTCTGTTTAACAGCACTGGCTATCCTAGCTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCGCAGAGATCTGCCTGCCTCTGCTTTCTGAGTGCTGGGATTAAAGGAATGTGCCACCA GGTTTTTCAAGACAGCGTTTCTCTGTTTAACAGCACTGGCTATCCTAGCTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCGCAGAGATCTGCCTGCCTCTGCTTTCTGAGTGCTGGGATTAAAGGAATGTGCCACCATCACCGGGTTTAGGTTGTTTTTATCTGGAATTTGGCAAGATATATATTTTGATATAAACTATGCTTTATGTGCATCATAATTACTGTTTAAAGCTATTTGTCATATTATAGTATAAATTGTGAGCAATTTCTCCATTTGCAAAATGTTATACTCACTTCAACCATGGCACAGGAGGCAAAGCACAATTTCAGAGTAACCAAATATTAGTATTTTGCTTATTGCTAAACTACCCAATTTATCAAAACACAATTTATCACTCTAACCAAGTTCAAGACTGGAACATTTCTTC 4 1 3' arm Peromyscus_polionotus_subgriseus mirnest 7SK 0.000000007 mmu-mir-3470a 0.0000000000001 -35.6 ........((((((((.((.((..((((((((((((...)))))..(((((.(((((.((.(((.........))).)).)))))..)))))......))))))).)).)).))))))))....... (-35.6)