mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTTGTTTGTTTTGTTTGTTTT AACAAATAAAGACTTCAATTA GTTTTTTTCTGTTGTTGTTTGTTTTGTTTGTTTTAGTGTTGTGAAATGTTAAAAACAAATAAAGACTTCAATTATAAAAAAAAA GTTTTTTTCTGTTGTTGTTTGTTTTGTTTGTTTTAGTGTTGTGAAATGTTAAAAACAAATAAAGACTTCAATTATAAAAAAAAAGAAGTAAAGAGCTGACTGTGCAACTAACAAAGATTANAATGCGAAAGCAAATGTTTCAAGAAGCGTTCCTTCTAAACTTGAAGGTGGACAGACATTGATCCTGGACAGCTGAAAGTCAAAATATGTGACTTAGTTAGCGGCACTCTTGCTGCAGCTCACAGCTGCGTTCCTCAACAAGGAGATAAAACCCACCCCANATTAGCCAGCTAGGGGAAAACATAACATTTAGTATATCATCAAACTGGATGCATAACTGTCCTCATACTTTACACATATTGTCATTGTTGCACAGACTGTTCANATCTGCTGCCAAAAAGTATGCTGCTCCAGTTTCTGTGTGTGTGTTTTGCCTGCAGGACATTCCTGGGGATGGAAGTGTCAACTGGGCATGCTCANATGTTGGATCTGATCCGAGCTGTTGACAGGACGATGACAGAGTTTCGCCTGGAGACTTTCTACAAGGATCCATCCTTCCACGTGAGTCTGGCCTGGTG 4 0 5' arm Ptyochromis_sp._redtail_sheller mirnest 100 100 -18.4 .(((((((.(((.((((....(((((((((((((((((((....)))))).)))))))))))))....)))).))).))))))) (-18.4)