mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGGGGGTGGGGGGGTGGGGGC CCCCACCCCCTCCCCTTCAT AGCCCTGTCTTGTTGCCCCCACCCCCTCCCCTTCATCCTCCCGCTGCCGCTGGCTGCATGTGGCTCCTGTGGGACATGCACGGAAATTCGCGCCCCAGGAAACGGGGGTGGGGGGGTGGGGGCTTCCAACAAAACC TCGGTTATTGGCTGGGGTGCCCTGGTGTGGCTGACCAGCCGCTGGGCCTGAGAGAAGCCCTGTCTTGTTGCCCCCACCCCCTCCCCTTCATCCTCCCGCTGCCGCTGGCTGCATGTGGCTCCTGTGGGACATGCACGGAAATTCGCGCCCCAGGAAACGGGGGTGGGGGGGTGGGGGCTTCCAACAAAACCAA 1 1 3' arm Capra_hircus mirnest 100 100 -58 ......((.((((((((((((((((((((((((..(((((((((.(((((((....)).)))))....)))))....((.(((....))).))...))))...))))).))))))))))))))....))))).)). (-58)