mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTGGCTGTTGTGGTGTGCAAA TGCCACACTGCAACACCTTACA ATTGTCTAACTTTTTATTTTTGGTCTGGCTGTTGTGGTGTGCAAAACCCTGTACATTGCTATTTTGCCACACTGCAACACCTTACAGATGTGGAAGATGTGAAAT GAGAGCAGCTTTAAAAGGTACTAAAAGCCTTTTACAAATTGGTGAGTACTGGCACATAAGATCTAGAGCAGGAGCAACTTCTCACACATAGTCAGTGGGAAAAAAAAGCAGTGCTTTGAAAGTTCCTCCCTCACCTACACAGTAGTCGTCATGTCGAGACCTGCCAGAGAGAGACACATTCTCAAGTGAATCCTGGCTTCTTGGAAGCGCTTGCCTAGACGAGACACAGTGCATAAAAACAACTTTTGGGGGACAGGTATGTTTTTCTTGCAGCTGCGGTTGTAAGGTCTTGGCAAGACAAGCAGTGTGGCCAGAATTTTGAACTTCTGATGAGTGTGTAACGCAAAGGACCATGTACATTTTTGATGAAAGGTCCTCAAAATGAGAGCACACGAGGAGGTTGCTGTGAACTTTTAAGTGGCCCTACTGCGCAGAAGCATTCAGATGTCACTTGATGATCTGTAAGGGGACTTGCTAATTTGGGAATGTTAGGAAATACACACGTCCTTTTGACACGCTCCATCATTGGGTGGGTAATAAGGTATACAGATGACGTGTGCTTTTTCTTTTTTTTCTTCCCCACCTTCAACCTCAATGGTATTCCTACAGGGAATGGATAACCATTTTAACTGTATTTTTTGCAGCCCATACCTTCTTGGGAATACAATTGTCTAACTTTTTATTTTTGGTCTGGCTGTTGTGGTGTGCAAAACCCTGTACATTGCTATTTTGCCACACTGCAACACCTTACAGATGTGGAAGATGTGAAATTTGTCATCAATTATGACTACCCTAACTCCTCAGAGGATTATATTCATCGAATTGGAAGAACTGCCCGCAGTACCAAAACAGGCACAGCATACACTTTCTTTACACCTAATAACATAAAGCAAGTGAGCGACCTTATCTCTGTGCTTCGGGAAGCTAATCAAGCAATTAATCCTAAGTTGCTTCAGTTGGTCGAAGACAGAGGTTCAGGTCGATCCAGGGGTAGAGGAGGCATGAAGGATGACCGGCGGGACAGATACTCTGCGGGCAAAAGGGGTGGATTTAATACATTTAGAGACAGGGAAAATTATGACCGCGGTTACTCTAGTCTGCTTAAGAGAGATTTTGGGGCAAAAACTCAGAATGGTGTTTACAGTGCTGCAAATTACACCAATGGGAGCTTTGGAAGTAATTTCGTGTCTGCTGG 3 2 5' arm Capra_hircus mirnest 100 hsa-mir-3064 1e-37 -27.6 ....((....(((((((.((((....((.(((((((((((((((((....((.....))..))))).))))))))))))))...)))).)))))))....))... (-27.6)