mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTGAATGGTTTAGTGAGACC TCAAACTGTATCATTTAGAGG CGCTACTACCGATTGAATGGTTTAGTGAGACCTTTGGACTGGAACTGCCTTGCTCAGCAATGAGTGAGGCAGAATCTAGGAAGCTGGTCAAACTGTATCATTTAGAGGAAGTAAAA GGCACGAGGTTAGTTTTACCCTACTGATGAAACGTTGTTGCAATAGTAATTCAACTCAGTACGAGAGGAACCGTTGATTCAGACATTTGGCATTTGCACTTGGCTGAAAAGCCAATGGTGCGAAGCTACCATCTGCTGGATTATGACTGAACGCCTCTAAGTCAGAATCCACGCTAGAAAGCAACGACACTTATCCCCAGAGGTTGCAGGCGAGTAGCCATTAGGAATCTTGTGAAACTTTGTCGTGCTGGGGATTGATTTTTGAAATTCTTGATCATCAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCAAGTCAGCAGCTTGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGTTTAGTGAGACCTTTGGACTGGAACTGCCTTGCTCAGCAATGAGTGAGGCAGAATCTAGGAAGCTGGTCAAACTGTATCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTACCGAATGGCTTTTCTCTTGGCCTTTCTCTGTGAACTGTCTGGCCCGGCGGAGCGTGTCTCCGTCGGGTGGGGGTTTGCCAGGTACTCGTCGTCTTCTTCGTCGAGAGGGTGGCAATCAAAGTTGGGCTCCGCGCTTCCCACGCCCCGTACATTTTTTCAAACCTAACACTTTGTAAATTTTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAA 4 0 5' arm Suberites_domuncula mirnest SSU_rRNA_eukarya 0.0000000000004 100 -46.9 ...((((.((..(((((((((.((((..((((......(((((.((((((((((((....))))))))))))..)))))......))))..)))).))))))))).)).))))... (-46.9)