mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTACTCCCTCCGTTCCTAAA TAGGAACGGATGGAGTATTTG TCAACCTTGCTACTACTCCCTCCGTTCCTAAATGTCTTTGTAGAGATTCCACCAAGAACTACACAAGAACTCGGAGCAAAATGAATGGATTTATACTCTAAAATATGTCTATATACATCCCTATGTAGTTTATAGTAATATCTCTAAAAAGACTTATATTTAGGAACGGATGGAGTATTTGTTAATGAA AACAGATACAACATAAAGATGCCAACATGATGGTATCAACCTTGCTACTACTCCCTCCGTTCCTAAATGTCTTTGTAGAGATTCCACCAAGAACTACACAAGAACTCGGAGCAAAATGAATGGATTTATACTCTAAAATATGTCTATATACATCCCTATGTAGTTTATAGTAATATCTCTAAAAAGACTTATATTTAGGAACGGATGGAGTATTTGTTAATGAAAACCACGACACGTGTTAGTTCTTGTGTTATACAGTCAAGATACAACTCAAGTTACACACTGATACCATGCCCAGCTCAACACAAGGGGCAAGGTCAGAACAGTAACACAACAGCGACAACAAGCACAAACAACAAAATCCCCTCCTCTCTTCAGTTAGCTTGGGTATTTGTTTTCAACTCTATGGTGTCTAAATCCTACAAAGAATGGATCGAGGACACCTTTATATATACAAACAGAACACAGGTTGTGTGCCTGCATATGATTAAACGAGGGACGAGGAAGTATGCATATATAGCACTGTAGTTGCTTCTTTGGCCTG 3 0 5' arm Hordeum_vulgare mirnest MIR1122 4e-30 tae-MIR1122 7e-19 -50.8 (((.....((...((((((.(((((((((((((((((((.(((((((...((...((((((((.........(((......((.((((((.(((........))).)))))).))..)))...))))))))...))...))))))).))))))....))))))))))))).))))))...))...))). (-50.8)