mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGTGTGCATGCATGTACATA TCTATCTGCCTGTACGACAT GTGGTTGGGTTATCTATCTGCCTGTACGACATGTAACTATTAAGCAAGTGGGTGTGCACGTGTGTGCATGCATGTACATAATCTTATTA ATTCTGCTCNAAAACTGCTGCGGNANCTCGGNCCGGGCCCTTAGNACGCGTAATACGACTCACTATAGGGAATTCGACGTCTANATCCCCGGGGGCAGNAAGNATAAAATTAAAGTACAAAATAGTGCTTACATGTTACTTAACATTTTCAGCATTGAACCAAAAGTGCATTGCATTTTGGCAATCTTATCAAATATAACCAAATAGGTTTGTATCTAAATTTTCTTTGTACTAATATACTCCACTTTTGTGAATCATACTTGAATGTTTTCATAGACTTGCAATTATGTGACAGGCTATAAAAATATGTGAAGTTCGAAAAATATGGAAATTAAGCAATATGAAGTGCTTCCATATCAAGTCCTTTGTTACAGTTACCACTTCTGGCACTGTTCTGTCTCAAACTGTTTCTGTTTGTTTTTGTACTGCATCANATGTTGGTATCTATAATAATTTGTGTCTTCAAAATTTTTATAGAATAAAATNGAGCTAAGAAAAAATATTTTTCAATATTTAAATATGTGGTTGGGTTATCTATCTGCCTGTACGACATGTAACTATTAAGCAAGTGGGTGTGCACGTGTGTGCATGCATGTACATAATCTTATTATTTTTTAAATNAAAATTACTGCATTGAATTTAAAAAATACAAATA 3 1 3' arm Gryllus_bimaculatus mirnest 100 100 -25.5 ..(((.(((((((.(((.(((.((((((((.((((.(((((.....)))))...)))).)).)))))).))).))).))))))).))). (-25.5)