mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTAGATTGAATAGT TATACAGTCTACTGTCTTTCC CATGGATGCTGTCCTTGGGGCTGAGGTAGTAGATTGAATAGTTGTGGGGTTGTGTAACCTCTTTTTGAGATAACTATACAGTCTACTGTCTTTCCCAAGGAGACAGCCAGGTC GGGGGACAGCACAGGGCAGAGCAGAGGGCGATCCAAAGGCTGGCGAATTGATTACGTGTGTGTTTGTGTTTTAAAGTGTCCTCCGTCTGTGTGTTTGCCTCCGGTTTTTCGGTCATACGCAACTGCAAGTAACGTGAGTCTATTGGCTGTGTGAGAGCAGACGTCCCTCTGTCACCCTGTGTACGGACAGACGCACTCACGCCAGTAGGAGGGGATTGTGGGAAGGGGGTGTAGCTCTCAGAGGGTGTGCTCTACTCCACTCTTTTCCCTTCTTCCCGCCATCACGGCCCTCTTCTCCTCCAGTCCTCCGGCCCAGCCCGCCGCTCACGTACAGGCTCCAGGACAGCAGGCTCTGACAGGGTGGTAAACAGTCTTTCTGTGGCTTTCCGTACCGAACAGGTGTCTCTTTGTAGACTGGCAGGAGGAAGGATAGGCCTCTTCGGTTACTTTCTGACCTCAGAAGGGTCGACCGCGCCAGAGAGCCGTTGTTGTGTTCAGGAGAGTTACCTTTGTGGATCTTTGAAGCGGAAGCAACATGGATGCTGTCCTTGGGGCTGAGGTAGTAGATTGAATAGTTGTGGGGTTGTGTAACCTCTTTTTGAGATAACTATACAGTCTACTGTCTTTCCCAAGGAGACAGCCAGGTCAGCCACTCGCCGACTGTCACCTCCAGATGGGCAACCATGCCGTCCAATCAAAACGCACGCTTGCAAGCAGCAATCAACACAATGCACTATGTCGAGCATTGTTTTTTTGTTTGTTGCTAGAGCAGGTTAATTAGGTCTACCAGGACGTGAAGGTGTGGTGTGTCTGATTTGGGTTCTGTCAGGGTGAGGTAGTAGGTTGTATAGTTTGGGTGGACGGGATTGCACCCTGCTCAGGTGATAACTATACAGTCTATTGCCTTCCTTGAGGAGCTCACTGAACACTCATCAATGCTCAACACACTCTCATGATGGTATCACGTTTATTTGTAGATTTCAGAAAGACAGGAGCGAGTAGATATGTGCTGCAAAAAGGAAAGGGATGAATTGACTGAAATGACAAAAAATATGTACATCTCAATAAAGTTATATATGCCCC 2 0 5' arm Sebastes_rastrelliger mirnest let-7 9e-36 tni-let-7e 2e-42 -41.6 .......(((((((((((((..((((((((((((((.((((((((((((((....))))))........)))))))).)))))))))))))))))))))))..))))...... (-41.6)