mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTACCAGACATGGTTAGAT CTAATACTGTCTGGTAATGCC CTTCCAGCCTGTTGATAGGCGTCTTACCAGACATGGTTAGATGTAATTATTGGTGTCTAATACTGTCTGGTAATGCCGTCCATTGAATGGCATTA AGCTTTACCTGCGTGGCACATCCTGAAACTGACACATGAGCTCACCTGTGTGTAAAAGGAAACAAAAAAAAAAGCTGTGGTTTCCATGGTGAGTTATCACAAAAGTCCGGGTACTTTTTGGAGTGTAAAGATGTCGAACATAAACTGATTTTGTACGCTGTTGAATATATAACAACAAACTTTTCCCCAGTGTGAGAAAAGAAATGTCAATTTCATACGTACAGCCTTTCAACAGACAAAAGAAACAAAGACAAATAATAGACATTGGGTGAGCAGAAACCTAATATTTGTGTAAGGAGGCAGAATGAGAATTACCCCGCAAACATTGAGCCACACCTTTATTTGCCCACCCAGCTCCATTATCCAAACCATAGGAACATTTGTGTTGGCGTCACATATTTGTGTATCAACGCAATAATACTGAGAGATTAGAAGAGAAGGAGTTTGCCAAGCGTAGTTTGCTTCTTTCCTTAGTCTGTTCACTCTTGGTTTTAATTCTTGCCGTGTGTGAGTGGTCAGTTTGCATATATGACTGAATGAATGTCCAGTGTCGCATCGACAGAACCTGTAATTGTGACAAAAGAGGAACTGCTTGTTTCACCCTGTTTCTGCTACACTACTCTGTTTCCTCCAGCTCTCGTCTTCCTCTTTTGCACAGGTGGAAGTTCAGAGGTCACCCTTCCAGCCTGTTGATAGGCGTCTTACCAGACATGGTTAGATGTAATTATTGGTGTCTAATACTGTCTGGTAATGCCGTCCATTGAATGGCATTACCTTCTGCTCTCTTCCTTCCCCTTCTCTTGCTGTGGTGCAGTATATTGACAAAGGGCAGTCCAGGGAAGCACACAGTCATATTTATAGTAGTGGCAGATTGGGTTGAATGATGATGATGACTATGGAACTATG 3 0 5' arm Solea_senegalensis mirnest 100 tni-mir-429 2e-39 -32.3 ......(((..(((((.(((((.((((((((((..(((((((............)))))))..)))))))))).).)))).)))))..))).... (-32.3)