mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATACTGTCTGGTAATGCCG TCTTACCAGACATGGTTAGA CCTTCCAGCCTGTTGATAGGCGTCTTACCAGACATGGTTAGATGTAATTATTGGTGTCTAATACTGTCTGGTAATGCCGTCCATTGAATGGCATTACC AGCTTTACCTGCGTGGCACATCCTGAAACTGACACATGAGCTCACCTGTGTGTAAAAGGAAACAAAAAAAAAAGCTGTGGTTTCCATGGTGAGTTATCACAAAAGTCCGGGTACTTTTTGGAGTGTAAAGATGTCGAACATAAACTGATTTTGTACGCTGTTGAATATATAACAACAAACTTTTCCCCAGTGTGAGAAAAGAAATGTCAATTTCATACGTACAGCCTTTCAACAGACAAAAGAAACAAAGACAAATAATAGACATTGGGTGAGCAGAAACCTAATATTTGTGTAAGGAGGCAGAATGAGAATTACCCCGCAAACATTGAGCCACACCTTTATTTGCCCACCCAGCTCCATTATCCAAACCATAGGAACATTTGTGTTGGCGTCACATATTTGTGTATCAACGCAATAATACTGAGAGATTAGAAGAGAAGGAGTTTGCCAAGCGTAGTTTGCTTCTTTCCTTAGTCTGTTCACTCTTGGTTTTAATTCTTGCCGTGTGTGAGTGGTCAGTTTGCATATATGACTGAATGAATGTCCAGTGTCGCATCGACAGAACCTGTAATTGTGACAAAAGAGGAACTGCTTGTTTCACCCTGTTTCTGCTACACTACTCTGTTTCCTCCAGCTCTCGTCTTCCTCTTTTGCACAGGTGGAAGTTCAGAGGTCACCCTTCCAGCCTGTTGATAGGCGTCTTACCAGACATGGTTAGATGTAATTATTGGTGTCTAATACTGTCTGGTAATGCCGTCCATTGAATGGCATTACCTTCTGCTCTCTTCCTTCCCCTTCTCTTGCTGTGGTGCAGTATATTGACAAAGGGCAGTCCAGGGAAGCACACAGTCATATTTATAGTAGTGGCAGATTGGGTTGAATGATGATGATGACTATGGAACTATG 3 1 3' arm Solea_senegalensis mirnest 100 tni-mir-429 2e-39 -32.3 .......(((..(((((.(((((.((((((((((..(((((((............)))))))..)))))))))).).)))).)))))..)))...... (-32.3)