mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATGCTGGGTTGAGAAGTTAC AATGGTTGCAACTCAGTTATTT CTTACGGAAACAATGCTGGGTTGAGAAGTTACAAATTTAATAAAAAGGTACAATAAAAATAAAGATGAAAATTCAGCATTCATCTTATTGTAATTTCTAATTTTAACTTTTACAGTAATGGTTGCAACTCAGTTATTTCTTTGCAG GCTTTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATTTTTGTATTGGTTGATATGGCAAGGTAAGGGGCAAGATCCAGTAATACAGAAACTTGGTGTCTAAATCAGTAAATGAAAATAAACTTTCAGAAATAATTCTACATGCTATATTCAGAACTTACGGAAACAATGCTGGGTTGAGAAGTTACAAATTTAATAAAAAGGTACAATAAAAATAAAGATGAAAATTCAGCATTCATCTTATTGTAATTTCTAATTTTAACTTTTACAGTAATGGTTGCAACTCAGTTATTTCTTTGCAGAGAATTCTAGCCTTTTTGGTTTTACCAAATTAAAAGTTCGATTTTAAGACGTATTGGTAAATTTCCAAAATCATTTTAAAAATGATTTCTAAATTCCTAAATGTCATAATGAACCACTCAAAAGACCCAGTTCCAAGAGAAGGAACCAATTAGAGT 5 1 5' arm Torpedo_californica mirnest 100 100 -27.2 .....(((((....(((((((((.((.((((((((.((((((.(((..(((((((.......(((((((.........)))))))))))))).))).))...)))).)))....)))))..)).)))))))))..)))))...... (-27.2)