mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCTATGCATATACCTCTTT AGAGGCATAGGGCATGGGAANA GCTGTTCCTTTTTCCTATGCATATACCTCTTTGAGATGTAACTTTACACAGAGGCATAGGGCATGGGAANATGGGGCTG AGGAGAGACTCATCTGGAGCTTTACAGGTAAGTCCTCTACACGCCTGACTCATTTTATAAACTGATCTATTTAATTTAAACTAAGAAAATGTGATCCAAACATTGACTTTTTGAAAAAATTGATTATGAATGTTAAGTTTTATATTGAACAACAAAAGTTGTCTGCTTCTAGTTGAGAAGAAATCTCACCTATAGAAAAAAATATGTGATTTTTTTGTTGTGTTGTACATGCAGTCATGTATCTCAGTGGCTTTTTTTTATCCCTGCCCTCCAGGTTGCACGTGCAGCGGCAGGCAAGCAGGGCTCTTTGCACTCGCTGTTCCTTTTTCCTATGCATATACCTCTTTGAGATGTAACTTTACACAGAGGCATAGGGCATGGGAANATGGGGCTGCAGAGGTATTCCACCCGTCAGTCAGCCATTTCATCATCCTCTACCGGATGACAGCTGACCTCAAAGCGCGCACACACATGCACCCTGGGCTCCAGCTTCCTGGGCACGACAGAAGTGAACACTGACCGCAGTGATT 3 1 5' arm Thunnus_thynnus mirnest mir-202 2e-20 fru-mir-202 3e-19 -27.4 .....((((..(((((((((.(((.(((((.(((((......))).)).))))).)))..)))))))))...))))... (-27.4)