mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTGAATGGTTTAGTGAGATC TCAAACTTGATCATTTAGAGG CGCTACTACCGATTGAATGGTTTAGTGAGATCGTTGGATTCTGATTTAAGGAATGGCAACATTTCTATAATTGGGAGAAGACAATCAAACTTGATCATTTAGAGGAAGTAAAA GTTTTATTCCTAGCTAGAAATGCCCTTATAGGGTGCTAAATCACTGTCGTGTCAGGAATAGTGGACTTTTAGGATTCCACTTGAACGAGGAATTCCTAGTAAGCGCAAGTCACTAGCTTGCGCTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGTTTAGTGAGATCGTTGGATTCTGATTTAAGGAATGGCAACATTTCTATAATTGGGAGAAGACAATCAAACTTGATCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTATTAGTTTCTAAACGATTGAAATGTAATTCGATTCAAAATTATGGCTGATATGCTATAATCGTGCTTGGTTCGAGTCTGGCTGGCCAATAATTAAAAGAACAGAAGATCTGTACCAATATATTAAGTAAATTACTAGTATTGTTCACTGGGAATAACTATTTATTTCAAAGTGTGTATATTATCGGTATGCACATGAGTTATTGAACAATCAATTCGACCCGTATTACGAGTAATATA 5 0 5' arm Schmidtea_mediterranea mirnest SSU_rRNA_eukarya 7e-49 100 -35.1 ...((((.((..((((((((((.(((..(((.(((...((((((((..(((((((....)))))))..))))))))...))).)))..))).)))))))))).)).))))... (-35.1)