mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTATTGATGTTGTTGTTGCTG GTAGAGCAATCATTTATATCT TAAATATTGACAGAAAACAACAGTAGAGCAATCATTTATATCTTTCAATATGGGGGGATGACGATATCACCGCAGCGCTCCTTGATTGATTATTATTATTGATGTTGTTGTTGCTGTTGTTCTGTAGGTTTGATT GGCCGCCCTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTCTTTGTACGAACAAAATCACCATCTTTTATAAAAACTCTTTAAATTTTTACAAAGACAAAATAAAACGAAGCCTTGAAAATTGCGGATATTATAAATATTGACAGAAAACAACAGTAGAGCAATCATTTATATCTTTCAATATGGGGGGATGACGATATCACCGCAGCGCTCCTTGATTGATTATTATTATTGATGTTGTTGTTGCTGTTGTTCTGTAGGTTTGATTGCAGTTTGTTCATCAGTGGCGGCGGCGAGGGCGACAGCACCATCACATCGATATCATCTTCATCGATATCTGTGAGGAATCGACGGTTGTTATGATGATGCAAAACTTCAGTGCCCTCCTCATTGGTCTGTATAAGATCGACAATATTCTCTCCAGGGAAATAATGCTGCTGGAGAGATGCAAACAGATTCTCATCGCGACTGATCGAATCATCACTGTCGGAGGAGCAGTGATTATTGTCTGCAGGGGGAGTTGCAAGGAACTGCATTATTTCCTCGTCATTATCTCCGGGGAATTTCCCAATTTCCGGTCTGTTCGGTGCATGCTCAACTGATTGGGACTGTTTCTGATCGGTCAGCCAACTTTGAAAGGTGTCCCTGCAGTCATTTATTAGGCACTTGGCAGAGCAATATTGACCATCCCAACGGCTGTCTTGGACGGGTTTGTTTGTACAAGACTCATATTTACAAGTTTCTATTGGATTGGCTACGTAATTGAGGCTAGTTTCAGACGAATAGTCGTTGTTATTGA 2 2 3' arm Schmidtea_mediterranea mirnest mir-598 0.0001 100 -34.5 (((((....(((((..(((((((((((((((.((((.(((....(((((..(((((..((.((.......))))...)))))..))))).......))).))))))))).)))))))))))))))..)))))... (-34.5)