mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGTATATATGTATGTGCGTG CGTATGCATGCATTTATACATAT CATACATACGCACGTATGCATGCATTTATACATATTGGTATATATGTATGTGCGTGAATGTATGC TATAAAGAAAAAAAAAAAAATTATTATCCCGATACTCCCTTTAACATACATACGCACGTATGCATGCATTTATACATATTGGTATATATGTATGTGCGTGAATGTATGCGTGTATATATATTATATATATATGATATTCAGTTTTTGTAGGCATGATCGATCTCACGAAAATTGTCGATATAGAATTTGAAGAATTTTATTCGTTACGTCTTGCAAATTTTGCAAATTTATATAATAATAACTTTTCAGAATATCTATCTAAGATGCG 3 2 3' arm Apis_mellifera mirnest 100 100 -24.3 (((((((...(((((..((((((((.(((((......))))).))))))))))))).))))))). (-24.3)