mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATGTTATTTTAGAATTAGG TAATTCTAAAATAACCTCAGG CGTGCGATGTTTGTGACCACCCTAATTCTAAAATAACCTCAGGAGCTCTGTAATGACGAGTCGAGACTATAGTACTATGATGTTATTTTAGAATTAGGGTGGTCACAACCGTGCGAT CGACCCACGCGTCCCCCTACCGTGCGATGTTTGTGACCACCCTAATTCTAAAATAACCTCAGGAGCTCTGTAATGACGAGTCGAGACTATAGTACTATGATGTTATTTTAGAATTAGGGTGGTCACAACCGTGCGATGTTTGGTCAATCGGTTGTATTTTATTCGAATTGTATCTGGGAATCACCCTCTTCCAGACACACGATAATCGCGAACACTTAGCTATGATGCAACGTATTCTTGGGGAGGTGCCAGTTAGGATGGCACGCAAGACTAAAACAAAATACTTCTACCGTGGTAAGTTAGAGTGGGATGAGAAGAGTTCGGCAGGTCGTTATGTCCGTGATAATTGTAAACCATTAATGAGGTACAAACAAAGTGACGAATCGGACCACAACCAGCTCTTCGATTTGATTTTTAAAATGTTGGATTATGAGCCGTCTCAGAGGATAACGTTGAAGGAGGCAATGTTGCATCCCTTCTTTGATAAAATCGCCCCGCATCAACGTTTGGGTGAACATGGCGCTGGTGACGTCAGAAGAGATAAAAGCCTGTCGATGTCGCGATGAGAGAGAGGTCTCGTGTGTTTTTACACCTATTTCATCATTTTGCAACAGTCATGTATTTGAGTATCGGACAATAAAAAAGCTGTTTTTATTCTGATTTGTACAATTTGGGTTTGTGACATGTTTACGATGTGTATATGAGTCGCTATCTGATTTCAACTTGTTCTATTTTCTACCCATCTTAAGTCCATANGTTTTATTTATAAGGGTAATTTAATGAATGTTACGAGTTACGTGTACATATTAAATAATAAAGATTTATTTTTTAAANAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 3' arm Tribolium_castaneum mirnest 100 100 -51 ((((((....(((((((((((((((((((((((((((.(((..((..(((((.(((....)))....)))))..)).))).))))))))))))))))))))))))))).)))))).. (-51)