mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGCTGGACTGGGCTGGGCTG GCTCAGCCCAGGCTCCAGTCTGG TAGTCTTGCCTGGGCTGGACTGGGCTGGGCTGTGGGGAGCATTCCCCTTCAGGGGAGTTTCCACAGCTCAGCCCAGGCTCCAGTCTGGCTAGAAAG GGGTCTGAGACTTGACTGAATATATGGTTAATTATAGAAACAACAATTTTAACAGTTACTCTGTTGACTGCTCTTTATGACTATACTTGTATGCCAGGAGGCAGCAGCCTATACACCATTAGACTCTTTACAAGCAACCAATGAACCAATTGCAGTGGATGCAGTCGTCACAGTAGTCTTGCCTGGGCTGGACTGGGCTGGGCTGTGGGGAGCATTCCCCTTCAGGGGAGTTTCCACAGCTCAGCCCAGGCTCCAGTCTGGCTAGAAAGCATCCAGCCCATTCCTTGCCTCAGTGCTACCTTTTTCTGGGCAAGTAGCCAAGAAGTGACTTTATACGCAGTGAGTAATTCAGATAAACTTAACAGCTATAGCTGCCGAAGAGTGGAGAAGGTTGACCACCATTGATTTAATTCTCTAGCGTAAAAGCAATGGAGAGCAGTGTGTGCATGAGCCCACAGTCACCTGTGTTTCTGGGAGCTCTCACAGTGGTGGATTCATAGGCACTTGGGCTGTACTTTGAATGACACACTTGTGGCTTTATTAGATTCACTAGTTTTTTAAAAATTGTTGTTTGTTTCCTTTCATTAAAGGTTTAATCAGACAGATCAGACAGCATCATTTTGTATTTAATGACAGAAACGTTGGTACATTTTTTCATGAATGAACTTGCATTTCTGAGCAAGAGCCTACAAAAAGCACCTGTTTATAAATGGAAAGTTCTGGCCTCTGGGAGGCCCAGTACTCTGTTGGAAGTT 0 2 5' arm Macaca_mulatta mirnest 100 100 -59.4 ...(((.(((.(((((((((((((((((((((((((((...((((((....)))))))))))))))))))))))))..))))))))))).)))... (-59.4)