mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTGGCTGTTGTGGTGTGCAA GCCACACTGCAACACCTTACA GGAATACAATTGTCTAACTTTTTATTTTTGGTCTGGCTGTTGTGGTGTGCAAAACTCCGTACATTGCTATTTTGCCACACTGCAACACCTTACAGATGTGGAAGATGTGAAATTTGTCATCA GGGGGATAACCATTTTAACTGTATTTTTTGCAGCCCGTACCTTCTTGGGAATACAATTGTCTAACTTTTTATTTTTGGTCTGGCTGTTGTGGTGTGCAAAACTCCGTACATTGCTATTTTGCCACACTGCAACACCTTACAGATGTGGAAGATGTGAAATTTGTCATCAATTATGACTACCCTAACTCCTCAGAGGATTATATTCATCGAATTGGAAGAACTGCTCGCAGTACCAAAACAGGCACAGCATACACTTTCTTTACACCTAATAACATAAAGCAAGTGAGCGACCTTATCTCTGTGCTTCGTGAAGCTAATCAAGCAATTAATCCCAAGTTGCTTCAGTTGGTCGAAGACAGAGGTTCAGGTAAGGATGACTGATAGGAAATGTTGGTAGTTGTGAGTCACATCGTTGTCTACAAATCCATTTAAATGGTATTGGAGGGTGAGTAAAACCTTGAACGGATAACTTATGTTGAAAAACTGTAAAACCATTTCACGCCTGCAATGAATAGATCTAATTCTTTCTGTCCACAATGATTTGTGTCCTAGACATAATTGATCAATTGCAATTTTTTTTTTTTTTGACCGTCTTTCCAGGGTAGAGGAAGCTAAGGATGACCTN 3 2 5' arm Macaca_mulatta mirnest 100 hsa-mir-3064 2e-42 -31 (((.........)))...(((((((.((((....((.(((((((((((((((((....((.....))..))))).))))))))))))))...)))).)))))))..((((......)))).. (-31)