mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCATCATCAAGATTCTCAC GAATCTTGATGATGCTCCA TTGCAAGTCCTTTTGTGTTGTATAGTCGTTTATTGCCGATGCAGCATCATCAAGATTCTCACTTCCAAAGAACTTTGGCAGATGAACAGAAACAAAGAAAGATTTAACTCTTAACATCACCGGCCGTGCATTTGCATGTGAATCTTGATGATGCTCCACCCGCAAACAACGATTGTCAATATTTCCATGCACAAGA TTTTTTTTTGCAAGTCCTTTTGTGTTGTATAGTCGTTTATTGCCGATGCAGCATCATCAAGATTCTCACTTCCAAAGAACTTTGGCAGATGAACAGAAACAAAGAAAGATTTAACTCTTAACATCACCGGCCGTGCATTTGCATGTGAATCTTGATGATGCTCCACCCGCAAACAACGATTGTCAATATTTCCATGCACAAGAACCCCTTTAGCCTTCAATTCCATGCCCCATCTTTTTACCTCCTCTATATGCAAACCAACAAACCCACGAGCAAGGAGCTGATGTGGCATGTTGCCATTGGTTAAGGCCAAAAGGGAATACGTGAAGGGGATGCCCGAGAAAGAATCCTACAACCTTGTTTAACTCAGAACTTTATAACAAGACAAAACCCGTTTTCAACATTAAAAATATAATAATATTTTTTTATATCAGATGAGAAGAAAGAAAGAAAAAAAAATCTAATAAATGGAATCAAGAACTAACGAGTTTCAGTACTTTGGTAAATCAAAGATTTTTAGTTAAGTGGATCAGATTTATTTATCCGGCGAGATTCTGACAAAAACACACTCCCTCTGGTTGTGTGTGGTGAGACTAACATATAGCAAGTACCACCTCATGTCAGATTCCGGCGAAGATCACATAAAAAGAAAGAGAACCCATTTGGTTTTTTCACTTCTTTTAGCTACATCAGCTCATCAAACCTTTATAAGAATATTATTTAAAAAAAAAAACTAGAATGAGAGGAAGAGTGCAAGCTTGGTTGA 1 2 5' arm Populus_trichocarpa_x_Populus_deltoides mirnest mir-172 7e-75 ptc-MIR172b 2e-75 -50.3 .((((.........((((((.(((((((((..((((...((.((((((((((((((..((((...((((......((((.((((...(((..................)))...))))....))))....))))...)))))))))))))))))).))...))))..))))))))))))))).....))))..... (-50.3)