| mature miRNA: GTGAATTCAGTTTACGTACGTT species: Medicago truncatula database: miRNEST The numbers on the right side of the alignments show a score calculated for them. When calculating the score, a mismatch is given a score of 1, bulge: 2, and wobble: 0.5. |
| Predicted miRNA targets | |||||||||
gi|157984819|gb|EX533091.1|EX533091 MTGland_B045_2007-06-07/MTGlandB045_B10_039_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med GTGAATTCAGTTTACGTACGTT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TNACGGCCGGGGNGTGTCNGTGGGANCTTAGGTCAAAATTTGGGGTATGACATTCTTGTTATGGGTTCTCAGTTCTGATTTTGTGGTTTCCTTGTTCTGCGATTCACAGTTCTACGATTTTGTAAACTCAGTTTAAGTAGGTTCATGTAAACTCAGTTTAAGTAGGTTCATGAGTTTACATGAACCTACTTAAACTGAATTTAAGTTAACCTTGCCAATGTAAATTAAAATCGTAATCGTACAGTGCATCAGTGCAGTTGAAGGAAAAAAATTGAAACTAGCAAATAGAAGAAGAAATTCACTTACTTATATCCAATTGAGTATGGATGAAAAATATTTTGATTCACTCTTTAATTTTCATGGAGATTGATATTGAACATCAAATTGTTTGATCGATCGCTTTATGGGGTGAAAGAGGGTGAAACTCGCTGACAATGAATAAAATTAGAGTTTTAAGAAAATTTATATAAAAGGGCGATTTTGATATTATAAAAAAATTTAAGAAAATTTGGGTGTAACCAGAAAAACATGGGGCGTAAATAGAAAAACTCATCAAAATATTATGTATACNACAATGACAACATAGATATAAATAAATTTACCTCATCTGNNNA | |||||||||
gi|157981275|gb|EX529547.1|EX529547 MTGland_A055_2007-06-26/MTGlandA055_G04_010_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med GTGAATTCAGTTTACGTACGTT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GCCGGGNNCTACTTAAACTAAGTTTACATGTACATACTTAAACTGATATTACATATAATCATTGAACAATGTTGAACTTTTAGATGTACACTTAAACTCAGTTTACATGACCTACTTAAACTGAGTTTACATGACCTACTTAAACTGAGTTTAAGTATGTATACTTAAACTAAGTTTACATGAGCTACTTAAATTAAGTTTACATGATCTATTTAAACTGAGTTTAAGTATCTACACTTAAACTTAGTTTACATGACCTACTTAAAATAAGTTTACATGTACATACCTAAACTGAGATTACGTAGAATCATTGAACAAGGTTGAACTTTTAAATTTACACTTAAACTTAGTTTACATGACCTTCTTGAAATAAGTTTACATGTACATACTTAAATTGAGATTACGTAGAATCATTGAACAAGGTTGAACTTTTAAATTTACACTTAAACTCGGTTTACATTAACTACTTAAACTAAGTTTAAGTATGTACACTTAAATTTAGTTTACATGACCTACTGAAACTAAGTTTACATGATCTACTTAAACTGAAGAAGAATTTTAGGGTGTAACCAAGAAAAATGGAATATGTTTTTTGAAAATTAAATTTTATGGAAGGATAATTCTGTCATTTTGGGGTGCAACCAGGATTAAACAGGGTGTAATTAGAAAAACTCTAAGACAATATGCATTAGGTATGGNTTGAAATTTTTGTCATGCATCAGCCGTTGAATGACATACTCGTTATTATTAATGAAATGTTATAAACATATTTCTTTAAAAAAAAAAAAAAATGAAGAAGTTGAGTACGAATAATAATTAGATTTGTGGACTTTATTTTTTAACCATATAAATTAGTAGAAAAACCTTGTTGACTGTTTTTAAAACCNCAACTTTGTTTTTTTCAATAACGAAGACTCNNANTAGTAACTTTACACNTACNTNAGAANCNTTGNGNGATAAAAAAACTACTGNACNATCATAAANATATCTACNTNTCNNCAAANANNNNNANNANTTTCTA | |||||||||
gi|157984269|gb|EX532541.1|EX532541 MTGland_B038_2007-06-05/MTGlandB038_C04_014_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med GTGAATTCAGTTTACGTACGTT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TTACGGCCGGGCTCTTCNNAAACCATAATTCTCCAATCGATCGATTGTGTTCTGCGAAGATTTTCAAAACCATACTTTCTCACGTCCATTCATGATTTCAAAGCAAATTCGAAGCAAATCAGGTTAGCAAGTGTTGTTCTTCAATCGATTGTGTTTTTCTTGTTATGAGTTCTCAACTCTTGCGATTAAGTTAGGTCATGTACACTCAATTTAAATTTAAGTAGGTCATGTAAACTCAGTTTAAGTAGGTTCATGTTAACTCAGTTTAAGTAGGTTCATGTTAACTCAGTTTAAGTAGGTTCATGTAAAGTTTACATGAACCTACTTAAACTGAATTTAAGTTAACCTTGCCAATGTAAATTAAAACTGTAATCGTACAGTGCGTCAGTGCAGTTGAAGGAAAAAAATTGAAACTAGCAAACAGAAGAAGAAATTCACTTACTTATATCCAATTGAGTATGGATGAAAAATATTTTGATTCACTTTTTAATTTTCATGGAGATTGATATTGAACATCAAATTGTTTGATCGATCGCTTTGTGGGGTGAAAGAGGGTGAAACTCACTGACAATGAATAAAATTAGGGTTTTAAGAAAATTTATATAAAAGGGCAATTTTGATATTATAAAAAACTTTTAAGAAAATTTGGGTGTAACCAGAAAATCATGGGGTGTAAATAGAAAAACTCTTAGATGACTCATTAAATGCATAGTATATATAAAGTCGGGGTTGAACAACCCACAT | |||||||||
gi|157980038|gb|EX528310.1|EX528310 MTGland_A040_2007-06-23/MtGland_A040_C09_038_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Me GTGAATTCAGTTTACGTACGTT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TACGGCCGGGANCTAAATTGAACATAAGTAAACTTAATTTACATTAACCTAAATTGAACGTAAGTAAACTGAATTTACACTAACCTAATTTGAATATACGTAAATTTGAATTTACATTAACCTACATACGTAAATTACACTAACCCCTTTTATATACATACACGTAAACTTAATTTACACTAACCTCTCACTTAAAATCAAATTGACAAGCATATCTCATACCAAAACAAACAATAAACAAATAGAAACTCATCGAAAATGAAATTCATGAAATTCACTAACCTTTATGAATATAGTACATATCAATAACAAAGATGTTGATTCAGATCTTGGTTGCACATCTATGGTGATTTGTGGATGAAAGGGGATAAGTGTTCAGAATGATAATAAAAGATGGGTTTTTAGAAATTTACATGAAGAGGACAATTTTGTTATTATTGTAAACTTTTTAATTAATTTGGATGTAACTTATTTTTTTTTTGGTGTGACTAAGATCAGTCTAATAATATATCACGACGGCTATATATACTTAAAGAATAATATTCTGTTATTTAATAGATTGCATGATCAAGTGAACTACTTGATTCCACTGGAAAGAAAGTGATCTACTTGATTATTAAATAAACATATTACTAAATAATAATATATAACTCACTTGAATAAAATATATATGTCAAACATACCATATTTAAGTTTTACCAGTCATAATATAAATAAAATCTTATACAATAATTACCTCTATAGCTCATTCAACACATACCAAATGTGCAAGCTCCAACGGTAGAACATAGTAANAACTATTTCTTCCATTANNTANTTCTATATAAAGTATATGATATAATAGTCTGGAAAGANACATATATATAGTCCAAAGCTGCAGTCACTTTCTCCATTGTCTCCCATGTCCNATTGGCCNNCNCCACCATTTANNCTACTTGCATTATNTTTTATNNNGNNGNCNTNNTTNNNNNNNT | |||||||||