| mature miRNA: GTGCTCTCTATGCTTCCGTCA species: Solanum melongena database: miRNEST The numbers on the right side of the alignments show a score calculated for them. When calculating the score, a mismatch is given a score of 1, bulge: 2, and wobble: 0.5. |
| Predicted miRNA targets | |||||||||
gi|261627711|gb|FS070953.1|FS070953 FS070953 library SmFL Solanum melongena cDNA clone SmFL07E03 5', mRNA sequence GTGCTCTCTATGCTTCCGTCA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): AGGGAAGAGGGAAAATTGGAGTTGACAGAAGATAGAGAGCACATATGATGAGATGCTAGATGGAGGAAATTGGAGTTAAATTAAAGCATTTCACTTCATTTGTGCTCTCTATGCTTCCGTCATCACCTTTACCCAAATTCTCATCCTCCTACCCCTAAATCATCTATATCTAATTTTAGGTTTTCTATAAAACGAATGGTAGGGTCATCAGAAGAAAAATATGTGCAGTAATCTCATTATTTTATGTATATAAGTATTCCATTGATTGATTTGCTACAAATTAATATTACTGCTTTCTAATTAGTCTGCCCCAACTTCCATTTCAGAAATTGTCGGTTTACAGGTCCCTCTAACAGCGTAATGTTAATTTGTCTTAGTAATCTATGCTCTTGTATTAATTTTATGAGTTTAATTTGCAGCCATATTTGGAATGGATTTTTTTAATTGTTGAGAGAAAGATAAAGTGCTTCTTCTTAATTTGATCGACTCAGGTGAGTAATTCTTGTTTGAATTACTGTAATTGTAGGTTCAATGTCAAAATTGTGATCTTAAATTTATGATAGAATTTTATATTGGACTATTTATGTTTTACAATCTGAATTGCGGTAAACAAGGAGATGTTTGTTAACCTCTCTCTATATCTCTCTATCTATGGTATAGATTGTGGCATCGGATTAAATTTAAATAAATTTATGTATAAAAATAAAAAAAAACTGAAAGGTTGAACTCATAGAACTTAAATCCTAGATTCACATCTCAAGTTATTGAAGTTTAACGAGTAGACACCAGATACATATTAAATCTGATAGTCCATTGTACATTCAG | |||||||||
gi|261663772|gb|FS083556.1|FS083556 FS083556 library SmFL Solanum melongena cDNA clone SmFL25K14 5', mRNA sequence GTGCTCTCTATGCTTCCGTCA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): AAGAGGGAAGAGGGAAAATTGGAGTTGACAGAAGATAGAGAGCACATATGATGAGATGCTAGATGGAGGAAATTGGAGTTAAATTAAAGCATTTCACTTCATTTGTGCTCTCTATGCTTCCGTCATCACCTTTACCCAAATTCTCATCCTCCTACCCCTAAATCATCTATATCTAATTTTAGGTTTTCTATAAAACGAATGGTAGGGTCATCAGAAGGAAAATATGTGCAGTAATCTCATTATTTTATGTATATAAGTATTCCATTGATTGATTTGCTACAAATTAATATTACTGCTTTCTAATTAGTCTGCCCCAACTTCCATTTCAGAAATTGTCGGTTTACAGGTCCCTCTAACAGCGTAATGTTAATTTGTCTTAGTAATCTATGCTCTTGTATTAATTTTATGAGTTTAATTTGCAGCCATATTTGGAATGGATTTTTTTAATTGTTGAGAGAAAGATAAAGTGCTTCTTCTTAATTTGATCGACTCAGGTGAGTAATTCTTGTTTGAATTACTGTAATTGTAGGTTCAATGTCAAAATTGTGATCTTAAATTTATGATAGAATTTTATATTGGACTATTTATGTTTTACAATCTGAATTGCGGTAAACAAGGAGATGTTTGTTAACCTCTCTCTATATCTCTCTATCTATGGTATAGATTGTGGCATCGGATTAAATTTAAATAAATTTATGTATAAAAATAAAAAAAAACTGAAAGGTTGAACTCATAGAACTTAAATCCTAGATTCACATCTCAAGTTATTGAAGTT | |||||||||