| mature miRNA: TGAGTTAATTAAGTTTTTATG species: Curcuma longa database: miRNEST The numbers on the right side of the alignments show a score calculated for them. When calculating the score, a mismatch is given a score of 1, bulge: 2, and wobble: 0.5. |
| Predicted miRNA targets | |||||||||
gi|87138202|gb|DY382813.1|DY382813 CL__Ea0001C08.r CL__Ea Curcuma longa cDNA clone CL__Ea0001C08 3', mRNA sequence TGAGTTAATTAAGTTTTTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): AGGGGGAGAAACAGACAACGAGATCGACAAAGGTAAGTCAGGTACGATCTCTTCCTCCCGATAAAATGTTTAAGTTCGTTAAACTTTTAACAAAAGATTGCTACAAATTAGAAAGTGAAAATAAAAATTTAAAAGTAATTCTAGCTAAGTCTTGTCCCTTAGAAGAATTAGATTAATTAAAAATAGCAAATGAAAAATTGAAACTTGAAAATGATGATTTGAAAATTCAAGTAGATAACTTGAAAAACTATGCATGTTCATCTAAAACCAATTTTAGAAGATTTAATAATTTAAATTGGTACTTTAAATATCACCCGGGACAAATTAGGAACATTTCAAGAAAATATGTCCCTAAAAGCTTTTTAATTAATCCAGTAGGGTGGAACCTATATTGGGTTCCTAAATCATGCCTAAACTAAATTGTAAAATTAGCGCTTTAAGTGAGAAAATTAAACAAAGAATTTCCTTATGAGGCTTTGTCAAGGAAGTGGTTGTTGCTCCAATAACCAAGAAGGCCTAGTGCCTCGCTACGACCTGGAAGCCAAAATATTGAAATAAATGTTTAATTAACTTACTAATAAAGCATTAATACAAGAATTAATTAGTGCTTTAAAAAGGTTATTCAAAACATTTTATTTTAGAAATTTACTTAGAATTTTTTTTTCCCCTAAGTCATTTTTTTTGCGCTTAAAAATTCTCAAAAATTTTAGGATTTTTTTTCTTACTTAGAGAAATTCTCAAAAATCATTTCTTCCTAAGT | |||||||||