| mature miRNA: TTTAATAAAGAGAGCTAAAAG species: Gnetum gnemon database: miRNEST The numbers on the right side of the alignments show a score calculated for them. When calculating the score, a mismatch is given a score of 1, bulge: 2, and wobble: 0.5. |
| Predicted miRNA targets | |||||||||
gi|158995697|gb|EX946078.1|EX946078 lk50f02.g7 Gnetum female cone (NYBG) Gnetum gnemon cDNA 3', mRNA sequence TTTAATAAAGAGAGCTAAAAG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): AATTTTCATTTGCTGAAAGTGAAATCCTTCAAATTAATATCTATTATCTTTTTTTATTGTTTTTTAATTGTTGCAACCCTAAACACCCACTAGAATATTCGGTCGGAGTGTTACTCATTATTGTTAATCTATCATCCATTGCAGCATAAACATCGCTTAAGACACACCTCTATGTTAATGTTTTTTATTTTGTTCAACACTAATGTGACATTTCAGTATAGGCCGGTATGGTGGGACTTTGGCCTGGAAAACCCTTCTAAGAAGCTGATGTTTGCATTTGCAAATAACCTATGTTTCACATCAGCTGGGAATGTGGATATGCTGGAACATAGGAACATGTACCCAAACAACTTTGAGGACAAGGGCTATTCCATGGGAGCAAAGTCCGATGTATGTGAAATGTGAATATTAAAAACCTTATAAAAATATAAAAAATTAAGGTAGCAAACCAAAACATACAAAAACCATAGCTCTACAACTTCAATGCTTTTAGCTCTCTTTATTAAATAAAATAATTTTCCTGATTGACTAAGAAAGAAAAAGGTTGCAGAATTCTTGTTGATCTAATGTAGTTTTGACTTTTAAAAATTTTTTTCAATGATTTGTTTCCATTAAGGTTCGAATTGCATTTTTGTATTCAAACCCAAAGTCCAGATTTGCAGGTTTAAAGTGTGAATTTGTGGAACACGTTCCCACACATTTTTAAAAGGTGTTGAAGCATCCACGCTGCAATGATGTCTGGGTGGTGTCTCTGTGGC | |||||||||
gi|158998357|gb|EX949071.1|EX949071 lj92b05.g7 Gnetum gnemon leaf (NYBG) Gnetum gnemon cDNA 3', mRNA sequence TTTAATAAAGAGAGCTAAAAG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): AAGCAACTGAAAGCAGCAGTCTAAGCACCACAGGACATGTTTCTTCCGAGGGAAAGGAGAGTATGCCAACGGATTACAGAGTTAAAAAGAGAATAGATTGCAAAAGTGCTTGCAAAAGGAGATGCAAAGCAACAAGTTACAAGGATAGATGCAAAAGAGCTTGTGGGGTTTGTTGCCAGAGGTGTAATTGTGTGCCTCCTGGAACTTATGGTAACAGAGAAGCCTGTCCTTGCTATGGCCGCATGAGAACTCATGGCAACAGACTCAAATGCCCTTAATAGCCCTACCACATCTTCCAAAGCAGGGTTTATTATGGTTTTCTGAAATTTTTTTAAATAGCTTAATTATATGTTAATTAGATGCGAAATACGTTACTTTAATAATATCATGTGTGGGTTAGGGCTTGTGAGGGAAAAAATTAATACAGGGATTATATCTCTCTGTTTATTGAGAGTCTGGGGTTACCCAGCTCATTGGTAAGAGTCTTGGCTTAAATGCCTGTATTAATAAAGAAAACCCGATTTGTTCAATCGGGTTTTCTATGTTTTTGAAAAAAATTTGTTAACCAGCTGAAGTACATTTGAAACGCCTTGTTTTAATAATGTCATTTGTGGGTTGGTAGGAAAAAAATTATTACATTGATTGTATCTCTCTTTATTAAGAGTCTTGGCTAAGCCAGCTCACCGGTAAGAGTCTTGGCTTGAATGTCTGGGTTAATAAACAAGTCTTGATTTGTCCAAAAAAAC | |||||||||