miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse




mature miRNA: AGAGTTAATTAAGTTTTTAGT
species: Medicago truncatula
database: miRNEST
The numbers on the right side of the alignments show a score calculated for them.
When calculating the score, a mismatch is given a score of 1, bulge: 2, and wobble: 0.5.

Predicted miRNA targets
gi|14873546|gb|BI268010.1|BI268010 NF115E03IN1F1022 Insect herbivory Medicago truncatula cDNA clone NF115E03IN 5', mRNA sequence

AGAGTTAATTAAGTTTTTAGT
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TCTCAGTTAATTGTAAACTCA

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
GCACCGAGGACTTTATGGTGTATTTGACAAGAGAGTTTCATTTGGAGCAAGTTCATGCATCAAACATTCTAAACATATGGGGTGGTATTTCAAACTTTGCACCTTTACTTGGAGCCTTCATTTCTGATACCTACACAGGTCGCTTCAAGACTATAGCTTTTGCTTCCTTTTTCTCACTATTGGTAAGAATTTATTTTAAGATTTAATTCATATAATGAAAAATATCTTACTTTAAACCTAATTTCTAAAATGACACTTATTAATAGTAATTTAGAGTCTGTTTTAACGCTTCAATATATTAGAAAGTAACAAAACAAAACTGGCTTTATAATTGTCACTAACAATGTTAATTGACTCTTTTTGTTTTTGACTCAAATGTTAATTGACTCTTGAGACTTGGGAAGATATAAAGATACCGTATAGTGGTCATTTCTTAGTATTGAAGAAGCCACAGAGCTTTTATGTACACTATTATTGTTTCATTTACTCGA



gi|27523926|gb|CA991032.1|CA991032 EST644540 GESD Medicago truncatula cDNA clone GESD-31N3, mRNA sequence

AGAGTTAATTAAGTTTTTAGT
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TTTCAATTAATTCTAGTATTA

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
TTGATATGGGAGTGTCATAAGGATGCTCCTCGTGCTGAGACATATTTTGATCAAGCAGTTAAAGCAGCTCCTGATGACTGTTATGTTCTAGCATCATATGCACATTTTCTTTGGGATGCTGATGAAGAAGATGAAGCAGAAGAAGAAGAAGATGAAAAATCTTTTGGTTTCTTTAACGGAGCTGCTCCATCACATCCACCACAGTTAGCTGCTGCTTCCTAAGTGCATGTTTGATATTATGATGAACTTGCCGAAATCACATTGAGCTACTAAACGTGTAACTTTTGCATATCTTGGCTTGATTTCGACAAACCACCGTGATACCGAGCTCTAAATTGCTAACTTTGTTAATTGTAATTATTATGATCTTAATTAACTTTTTGTATTAAATTTTTGGCCGATG



gi|157981566|gb|EX529838.1|EX529838 MTGland_A059_2007-06-22/MTGlandA059_E05_020_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

AGAGTTAATTAAGTTTTTAGT
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TCTCAATTAATACAAAATCCA

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
AACAACTATTAAAATTAAGTAAAGACTAAACTTAAAATGCCTCGATTTTATAGGTACTAAAAACATATTTAACCCAACAAAAAAAAAGTCAGATGTGGCATCCACGTGTGCTTCACCGTTTGCTCAATCAGCAACAATTAACAGCGAGGACCTATTTTGCTAACGGAAAAAAACGTTGGGGACCAAAAATTTAACAAAATGTATGTAGGGACTAATGTTGGAAACACACCTATCTATTTATAGGGACCTAAAACATAATTAACTCTTTTTTTTATTAGTTCCATTTTTAATATTAGAGCACGACCTCCAATTTAATTGGAACACCGATGTTTAAATGAGTTTGTTTGTACATGTCACTCATTATGTAACTAATACTTAATAAACCGTAAATATCTTCGACCTAACAATATTAAATGGGTCCGAAAAATAACTCCATATCATCAAATTTGTAAGAATAATTTGTCTATTATTCATAATTATCTAATTTTTGAAATATTAAATTAATTCAATTATAATTTATCTTATCTTATTACTATCATTTTCAGGGAGATTAAGCTCAAACACAAGACATATAGGGGAAATTCTGATCAATGGTCACAAACAAGAACTGTCTTATGGGACCTCGGTACAAATTTAATTTTGAACACTTC



gi|13366828|gb|BG448047.1|BG448047 NF105A08EC1F1055 Elicited cell culture Medicago truncatula cDNA clone NF105A08EC 5', mRNA seq

AGAGTTAATTAAGTTTTTAGT
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TCTCAATTAATTAATTAATTA

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
AAATAACATAACTTGGTAGTTACATGACATCATTTTTGTAAAGATAGGTCATTTGGTTAACAAAAGCAATATTTAGACTTGTTTTACCCCTCAATTTAGGACGTGTCATTTGTAGAGGATGTCCAGTTTGGATTTTTCCACAACATACTATCTTCTTATATTAAGGAGGAAGAGAGATAGCATATGTCAGAACAATACCATTTTATTCAAATTCTGCTACGCTATTTGACATCACTGCTGTATACATTTAATCTCATTATGTTTTCTATATGAGTAGTGACAATATCATTATTAGTTTTGGCTATTAATTAATTAATTAACTCTAATGTTTGGTTTTCAGATTGCACTGCACTTCCAAAAGAATTGGTTGTGCAGTCCTTATTTTCATCCGAACCAATCTTTAAGTCTGTGTCGTCGGTTTCTTAGTTCTATTATGGCTGGTGATTCCTCTGCAATCTTCAATGGAAATGGCAATGGCAGCATCAACCTACAGAGGACTTACCAAGTGGTTGTGGCTGCCACCAAAGAAATGGGCATTGGTAAGGATGGGAAATTACCATGGAGACTACCTACTGATCTCAAGTTTTTCAAGGAGATAACTACCTACAACATCCGAGCCCTGGGAAAAAAANGCCNTTGNTATGGGAANAAA



gi|148767100|gb|ES613794.1|ES613794 MTGland_B014_2007-05-07/MTGlandB014_G01_002_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

AGAGTTAATTAAGTTTTTAGT
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TCTCAATTTATTTAAAAATCT

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
GTATGTGGTTTATAATATGAACCACATACATTATTAAATGAATGAACCTAAAGTAAATTTTGCTTATATTTAAAAACGGATGGAGTAGAGAATAAAATTGGGGGTTGAATTTTTTCACTGAGACATCATTAACATGTCAAATTATTTTTCATCTGAGTCTAAAAATTTATTTAACTCTTGTTGTATATTGACCATTCAACTAATAATATTCAATTATTTAAAAAAAAAACCTCATAATATTCAATATCTATAGTAAAATCGTAAATATATTTTCAACTACAGTCATTATATTTCTCTAAAAAGAAATTGCAGCCATTATATTAATGGCGTTCAAGGAATAGCAACGATGCTGCAATTACAATGTTGCTGGGAAAAAAAAATTAATTCGGAGGAAATTCCAAGATTGTCCAACAGTTAAATAAATAACTTATATAGAATTTACCTCCAATAGTAGGTTACCAATGTACAACGACCTACAAACACATGTCATTTTGAT



gi|148764837|gb|ES611531.1|ES611531 MTGland_A008_2007-04-03/MTGlandA008_F11_043_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

AGAGTTAATTAAGTTTTTAGT
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ACCCAATTAATTCAAAAACTA

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
TAAAAAGTGTGATTTATTTTTATAGGGACTAAAAACAAAACTGCAGATATTTATAGGGATCAAAAACTTAATTAACCCATAAAAATATATATCATTTCATTATTACTAAAATATATTTTATATAATGATTTTCTCTTTATGTATTTCAAGTGTGTGTAACTAAAAGGTGTGTTCAAATGCTTATGTCAAACTCATAATTGTTTTTGAACAAGTTATGTCAAACTCAAATTTAAAAGTTAAAATATAGTTTTGGTCCCTG



gi|5069576|gb|AI737597.1|AI737597 T110076e KV2 Medicago truncatula cDNA clone pKV2-P8 5', mRNA sequence

AGAGTTAATTAAGTTTTTAGT
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TTTCAATTAATTAAAAAAACC

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
AAAATCTATGTTCCAAAAAAATTAATTAACTTTTGAAGTTTATTTGGTAACTGATTGTGTAGCTTTTTGTGTATGTTACATCTACATTTGTGTCCACTTTGTCATTTTTGTTTTGTCCTTTGTTTGTTGGTTCTTTCTTTGGTTGTGAGCGTGTTTCATGCTCAGNTGCTTTTTATTCTCTCTGCAACAACCCAACACAAGATAATGGAATCAATCTGAATTTCTCTAGTACAAACCATTCACAGATCTCAACGATCTCACTCACATTTTCACCTTTCAATACTAAAGTTTTTACCTTTATAGTATGCTTTTTCAGTTGGATTCAAATTCTCCAACTTGGTTGACATACGAAAGCTATTTTG



gi|22089059|gb|AJ498616.1|AJ498616 AJ498616 MTPOSE Medicago truncatula cDNA clone mt--acc955206g07, mRNA sequence

AGAGTTAATTAAGTTTTTAGT
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TTTTAATTAATTAAAAAATAA

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
AAAGAGAAACAAGAAATCTCTTTCTTTCTCTCTGCACAATTATCGAGTAGTGTTATTTTTTTTAATAAAAAATTAATTAATTTTTTTTTTTTTATATAAAAACTGAAGAGAAAATTCTTTTACAGCGTTATTTTTTTCCCGGGAAAAATTAACACAGCTCCGCCATGGACGGAACCGGTAATCGAAATCCACCACCGACTTCCACCGTCGGAGATAATTCTCCACCGCCGGAGCCATCACCGGAGAGTCTCCGCCATGTAAGCCGTATGATCAACAGCAACCATTACACCTCACCTTCTCGAACAATCTACTCCGATAGGTTCATTCCGAGTAGATCTGCTTCGAAATTCGCTTTGTTTGATATCAATACTCCGACGGAAGGACGCGATGATAGTTCCAGCGCTTATACGACTCTTCTTAGAACGGCGTTGTTTGGACCGGATGTTGCAGGTCCGGTTAC



gi|151389778|gb|EV259656.1|EV259656 MTYDY51TF JCVI-MT1 Medicago truncatula cDNA 5', mRNA sequence

AGAGTTAATTAAGTTTTTAGT
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ACTCAATTCATTCCAAAGTCA

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
GATGCATTTGAATATAGCATAATAACCAACCATGGCTGGTGCAAGCACTGGTTCCTTCCCTATCTACCACAGACTCTTCAACCTTTCCTTTACTACCCATTCTTCCATTTCACACATCACCCTTAACTTCCCACACAGAACAACAACAACAACAACCATTTCTTCAAAACCCTTCAATCTAATCTCTCAATTATTCAACCCTCTTCATCCACCTCCTTCATTTTCATTCTATGAAGAAGAACAACAATTCTTTGAATCTGAATCTGAATCTGAATCTGAATCTGAATCTGAAACTGAAACTGAAACCTTACTTAACTCAGACCTAAATCAGGAAGCAGAATCAACCCAATCAAGAAGACTCTTTGTTGGAAACTTGCCATTTTCACTGTCTTCTTCACAATTGGCTCAACTCTTTGGAGAGGCTGGAAATGTTGTGTCTGTCGAGATTTTGTATGATGACATCACAAATAGAAGCAGAGGATTTGCTTTTGTTACAATGGGGAACGTGGAGGATGCTGAAGAAGCAATTCGAATGTTTGATGGCACTACAGTTGGAGGCAGGGCTATTAAGGTAAACTTCCCAGAAGTGCCCATAGTAGGAAAAAGGGTACAAATGGGCTCAACCTATAGAGGTTATGTAGATAGCCCTCACAAGATCTATGCTGGAAACCTTGGTTGGGATATGACTTCCCAGTATCTTAGAAAAGCCTTTGCTAAGCAACCAGGCTTACTGAGTGCCAAGGTCGTCTACG



gi|157981705|gb|EX529977.1|EX529977 MTGland_A061_2007-06-22/MTGlandA061_C08_030_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

AGAGTTAATTAAGTTTTTAGT
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ACTTAATTAATTCATAAATTA

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
GGNNTTNCGGCCGGGCNNGGACATGTTCTATATTGCTCCGAATCAAAGTGAAATGATATTGTTCTTGGGATGCGACTCAACAAAGCTACTCAGAGTGCTGCAAAGGAACACAATCGGTTGCTTTTGATTTTTGCTTTTGATTTTTCCAGATTTGTTTTCATGGTTGCGAGGTAGAAGATGAAGTGAAAACAAATTTAATGTTGAGAGACTATGATAGAATCGGTGTTCCTCTCTGATTTAACGGTCAAAACTTACTTTTTCATGGTGGAAAAGTTTTATACTTTCCCATCCTAAGTGCCACCATGCAGTTATGTTTATTTGGACACAAATACGGCATTATGTATTGTTCATTGTATTTATCTTATGATCAGTAACTTTTTTACTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTAACTTTTTAAATATATAANANGATTTTNNCAACACAAAATTTGAGTTGTTGTTAGCCAATTTCACTGCTGAATTAGCCAAAACAATGTACAATGTTAACCATTTTTTGAACATAAGGNGTACTTATTAGTTAGGTATAAGTTAATTAGTATTAGCTGGAAGTTTGTTACACTAAGGNAATTTGGGATCAGTGTATAAAGTGTATCATATTCTTCATTCTATTATTTTCAAATAATTCAACTTTTTATTTATTTCTCTTAGTTGGGTTCGATCATGATTTAAGTAGAAAACTAAATGAAAAATTATATTAAAACACACATTGGATGCAAATTCGGGACACCTGATACCGTTACATTTTTTTGGTAAATTTTTAATATAAAAGAGGANTGTGTCAATAATCAATAATCATTTTTTAACATAAATTGAATATTAAATACTTAATTAATTCATGATGATACTACTATGCAATAATGATGATAAATTGATGTTTTGAAGAAAAAAATGATTTTTTGAATTANTCCNTANACCNNAACTCNTAGACCAGAATAAAAATCTCTCNNGAAANANTTNANNTATCCTTTTGNCTGCTNGGAGNTNNA



gi|9679869|gb|AL380117.1|AL380117 MtBB50E06F1 MtBB Medicago truncatula cDNA clone MtBB50E06 T3, mRNA sequence

AGAGTTAATTAAGTTTTTAGT
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TTTCAATTAATTTAATAATTC

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
CACCCCTACTTTCTGCTCTCTTCTCCCCCTTCTTAAACCTTTTAGGTTTGTCTTAGGAAACCACACCCTTGTTTTTTTTTTCCTTAAAAAAAACATTTACTTCCCGTGTGGTTCCTCTTGTTTTTTTAAATTCCTCTTCATATGAAATTCTCTTAATAATTTAATTAACTTTGAATATTGATGCTGAACATCTTCATATTGTTCATGGCTTCACAGTTCATGGTCTCCAGTATCTTAGTGGGAAATCCTACGTTCCCGCGATTTATTATAGCAATTCTTTCCCT



gi|89243656|gb|DY615443.1|DY615443 AC0512 NOLLY Medicago truncatula cDNA 5', mRNA sequence

AGAGTTAATTAAGTTTTTAGT
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TTTTAATTAATTAAAAAATAA

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
GATTCGGCACGAGGAAGAAACAAAGAAACTCTCTCTCTCTATTTCTTTCTCTCTGCACAATTTTCGAGTAGTGTTATTTTTTAATAAAAAATTAATTAATTTTTTTTTATATAAAAGCCGTGCAAAAAATTCTTTTACAGCGTTCTTTTTTCCCCGGGAAAAAAATTAACACAGCTCCGCCATGGACGGAACCGGTAATCGAAATCCACCACCGACTTCCACCGTCAGAGACAATTCTCCACCGCCTGAGCCATCACCGGAGAGTCTCCGTCATGTAAGCCGTATGATCAACAGCAACCATTACACCTCACCTTCTCGAACAATCTACTCCGATAGGTTCATTCCGAGTAGATCTGCTTCGAAATTCGCTTTGTTTGATATCAATACTCCGACAGAAGGACGCGATGATAGTTCCAGCGCTTATACGACTCTTCTGAGAACGGCGTTGTTTGGACCGGATGTTGCCGGTCCGGTTACGCCGGAAAAAACCGACTCGCCGTCGATGACATTGCCGAATAGGAATATTTTTAGGTATAAGACGGAGACGAGACAGTCCATGCACTCGCTTTCGCCGTTTATGGATGATGATTTTGTTCCTGGTGTTAATCATAGTCCGGTTAAGGCTCCTAGGAAGGTTCCTCGATCGCCTTATAAGGTTTTGGATGCACCTGCTTTGCAAGATGATTTTTATCTGAATCTGGTAGATTGGTCTTCACACAATGTGTTGGCTGTTGGTTTGGGTAACTGTGTCTATCTCTGGAATGCTTGTAGCAGCAAGGTAACTAAATTATGTGATTTGGGGGTTGATGATTGTGTTTGTTCTGTTGGTTGGGCTCAACGTGGTACTCATCTTGCTGTTGGAACTAACAATGGTAAAGTTCAGATTTGGGATGCAGCAAGATGCAAGAAGATAAGATCAATGGAGGGCCATCGGTTACGTGTCGGGGCCTTGGCCTGGAGTTCATCTCTTTTGTCTTCTGGTGGACGGGATAAGAATATTTATCAACGAGATATACGCACACAAGAAGATTTTGTTAGTAAACTGTCAGGACACAAATCAGAGGTTTGTGGACTGAAGTGGTCATATGATAACCGTGAGTTGGCATCTGGAGGAAATGACAACAAATTGTTTGTTTGGAATCAACACTCAACCCAGCCTGTCCTCAAGTACTGTGAGCACACAGCAGCTGTTAAAGCTATTGCATGGTCTCCTCATCTTCATGGACTTCTTGCATCTGGAGGAGGAACTGCAGATAGATGTATTCGTTTTTGGAATACAACCACAAACTCACACCTTAGCTGTATGGACACTGGAAGTCAGGTTTGCAATCTTGTCTGGTCCAAAAATGTCAACGAACTAGTAAGCACACATGGGTACTCCCAGAACCAGATTATTGTTTGGAGATACCCCACTATGTCAAAGCTGGCGACTCTTACCGGCCATACCTATAGGGTTCTCTATCTTGCCATCTCTCCAGATGGACAGACTATTGTAACTGGAGCTGGAGATGAAACGCTTAGGTTCTGGAATGTTTTCCCTTCCCCTAAATCACAGAATACTGAAAGTGAAATCGGAGCATTATCTCTTGGAAGAACTACTATCAGGTGATTGATCCTGGCGTTGCAGCCCAATCATGTGGCATATTTCTAAGTTTGGGTTGCTGTGTAGAACTAAATTTCTGAGCGGAGAACACCATGGTGGAAAAACCTTGAATATAAAAACACCACCAAAGTAGCATCTTTACCAACTGGGAGAGCCTTGGAGGGAGCTATAAAAGTTTTGATATGGCTGCCGGTGATATTCCTGCATTCATGTGTAGTCTCATTTTATATTGAAAAGATGATAACAAATGGGTAATTTATTGTCTTGGACTTATACATGCATTGATGGAGTTGTAGCCAAGTTTTTTTATTACTCTTTTTTTCTTTCTTCTTTTTGATAGTGCTCTCCTGCATTATTTATATAATTTTAAGATGCGTTAACAGAGAAAAAAAAAAAA



gi|9681862|gb|AL382111.1|AL382111 MtBC04H03R1 MtBC Medicago truncatula cDNA clone MtBC04H03 T7, mRNA sequence

AGAGTTAATTAAGTTTTTAGT
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TCACAATTAATTCGGAGATCA

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
GGTGAAGTTATTACTGAACATGAAAATCACATAGAAGGAACTGAGTGGGGTAATCATGTTATGCCATCAGAAACTACTGGTTTTGTAAATAACAATGACAATCTTAAACCAAATACTCAGCATGAGATTGTAAATAATAGAAAAGAGCACTTAAACATGGGGGCTCAGCTCATGCTTGTAAATAGCGACAAAAGGCCTGAAAATGAGGAACATCTTGAAGAAAATGAAGATGAATTTGATTGAAGGTAATCTCTCAGGAACATCTTGAAGAAAATTAAGATGAATTTGATTGAAGGCATGGAAATATTCTTTCATTTGGCACTAGAGGCTTAATTAACACTGTTTATATGATGGTTGAAGAGGTAGAGAAGCTTGAGGAGTAGTAGCTTGATGACTACTATGCAAAGTTGTGGATACTGCTTTGAGTTTCCTTTTCTGCTTGACATTGTAAAGGACAGACAAAG



gi|83668789|gb|DW019197.1|DW019197 EST1228158 MTY Medicago truncatula cDNA clone MTYBG10, mRNA sequence

AGAGTTAATTAAGTTTTTAGT
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TTTCAATTAATACAAAAGTTT

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
CGGCCGGGTGATCTTATATACTGGTGGTATAAACACTTGTGAGATTGTTTTGGAGAGTTTACAAAATCAACTTATGGCATGCCCATTTGCTATTTTCAGCTTATTTCCATAAGCTTTCCAGAGGCTTATGAAAACAATTTCTAGCTTATATGAAAACAGTTCGACTTTATTTTATCTTTTATTATAGAAGTAGTTTATTCGTAAGCACTTATATGATATAAACTTACACTATAAGCGCTTGATTAAGTTGTTTATCCAAACATGACTCTAGGCAAACCGAACTTTGAAAACATAATTAACTTTGATTCAAACTAACTAAACATCTAGACTTTTACAAAGACTTACAACTAAAATCTCATTTGACAGAAGGTAAAGTCAGTTTTCACACTATTCATCGCAAATCCAAACAAATGCTATATTGGAACAAACTCTCTGTGACTTGCATCATGTCTTTTA



gi|13596413|gb|BG581349.1|BG581349 EST483082 GVN Medicago truncatula cDNA clone pGVN-64J3 5' end, mRNA sequence

AGAGTTAATTAAGTTTTTAGT
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TCTCAATTAATTAATTAATTA

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
CTTCAGATCTAACCGGAAAACAACCTCTAAAAACAAAACACAGTCGTTTTGAGCTCCGACCCGGAAAAGCGGGCGATTTGACCCGCTCCCGCTCCAGGTAAAGGCGGCCGCGAAACCCGCTATGGACCCGCTTTTCCCTAACGCGCGAATCGGTGGCGCTTGGACGCGGAGGCGTTTTTGGCCGCTCCGCACCGCGATCGCGCCGGGAGCGGCCGCTATTGAGTGCATATTGAATTGACATTTTGGGTCAGACTTAGGAATCCGAAAAAGTGAATACTATTTGGTCTTAGTAATCGGCATGAAACCGGGAAAAGAAATTTGAAGTGCAATGAAACAAAAAATAACATAACTTGGTAGTTACATGACATCATTTTTGTAAAGATAGGTCATTTGGTTAACAAAAGCAATATTTAGACTTGTTTTACCCCTCAATTTAGGACGTGTCATTTGTAGAGGATGTCCAGTTTGGATTTTTCCACAACATACTATCTTCTTATATTAAGGAGGAAGAGAGATAGCATATGTCAGAACAATACCATTTTATTCAAATTCTGCTACGCTATTTGACATCACTGCTGTATACATTTAATCTCATTATGTTTTCTATATGAGTAGTGACAATATCATTATTAGTTTTGGCTATTAATTAATTAATTAACTCTAATGTTTTGGTTTTCAGATTGCACTGCACTTTCAAAAGAAATTGGTGTGCAGTCCTTATTTTCATCCGA



gi|157982986|gb|EX531258.1|EX531258 MTGland_B021_2007-05-17/MTGlandB021_D06_021_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

AGAGTTAATTAAGTTTTTAGT
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AATCAATTAATTCAAAAATCT

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
TTACGGCCGGGCATATTAGTTTAGCCTTTTGAATTAATAGACACTTTAACCATTACTTAATAAATTATAATAGGGAAAAAAATCTAAAAACTTAATTAACTAAATTACAACAAATTAACTTAAAAGAAAAACAAACAAAGATATAAAAAAAGATAATGAAGAAAAGAATAGTTAAAAGAACTACTTTGTAACCTCAGTTGTTATATTAAATTTTCTCTACTAACTAATCCAACCCCCCACGTAATTAATTTTCGACCACAAAATCTCTACCCCGAAATCCTCGCGTGGAATCCAAAAAGCAACACTTCCCGTTGGATCTCTCAACCACCACACAATGTCATACCCCGACTTTGTCAAATCCAC



gi|11931051|gb|AW686707.2|AW686707 NF041D02NR1F1000 Nodulated root Medicago truncatula cDNA clone NF041D02NR 5', mRNA sequence

AGAGTTAATTAAGTTTTTAGT
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TCTTAATTAATTTAAAATTTT

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
TATTTTTAAAATTTAATTAATTCTAAAAGATAAAAATAAAACCTCCAACCACCTAAAACCACGTCCAAATTAATCTCACTTTACTAGTAGTTTTCTTCATATCACTCATTATAAATAGTAGCATATGAAACACTCTCATTTAACCTTAACAAAAAAGCTAGAGATTCCTCTATAGCTATTTGTCTATTACTTGCTTTTCACACACTGTGTTCTTCTTCTTCCTTCACTATTCATCATCATGTCTTTGCTTTCAGATCTCATCAACCTCAATCTCTCAGAATCCTCTGAAAAGATTATTGCTGAATACATATGGGTTGGTGGATCTGGTATGGACCTTAGAAGCAAAGCCAGGACTCTACCTGGTCCAGTGAGTGACCCTTCAAAACTTCCTAAATGGAACTATGATGGATCAAGCACAAATCAAGCTCCAGGACAAGATAGTGAAGTTATCTTATATCCACAAGCTATTTTCAAGGATCCATTTAAGACAAGGCAACAATATTCTTGTGATTTGTGATGTTTACACCCCAGCTGGTGAGCCACTCCCAACAAACAAGAGGTACAATG