| mature miRNA: AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT species: Medicago truncatula database: miRNEST The numbers on the right side of the alignments show a score calculated for them. When calculating the score, a mismatch is given a score of 1, bulge: 2, and wobble: 0.5. |
| Predicted miRNA targets | |||||||||
gi|27523926|gb|CA991032.1|CA991032 EST644540 GESD Medicago truncatula cDNA clone GESD-31N3, mRNA sequence AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TTGATATGGGAGTGTCATAAGGATGCTCCTCGTGCTGAGACATATTTTGATCAAGCAGTTAAAGCAGCTCCTGATGACTGTTATGTTCTAGCATCATATGCACATTTTCTTTGGGATGCTGATGAAGAAGATGAAGCAGAAGAAGAAGAAGATGAAAAATCTTTTGGTTTCTTTAACGGAGCTGCTCCATCACATCCACCACAGTTAGCTGCTGCTTCCTAAGTGCATGTTTGATATTATGATGAACTTGCCGAAATCACATTGAGCTACTAAACGTGTAACTTTTGCATATCTTGGCTTGATTTCGACAAACCACCGTGATACCGAGCTCTAAATTGCTAACTTTGTTAATTGTAATTATTATGATCTTAATTAACTTTTTGTATTAAATTTTTGGCCGATG | |||||||||
gi|260524597|gb|GT142666.1|GT142666 METC658TR JCVI-MT3 Medicago truncatula cDNA 3', mRNA sequence AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GAAAGCCAGAGTGAAGTCGATGCCAGAGACGGTGGTTCGATGCTTGTTTTGGTTGAAGAAGGAGGTGGTGGTGGATTTGACAAAAACGACGGTGGAGTTTCAAGATTCGGTGATTCAAATCATGGAAATGATAGCACCGATTTGTATTACCGTACAATGATTGAAGCAAATCCTGGAAATCCGCTTTTTCTTGGTAATTACGCAAAGTACTTAAAAGAGGTTCGTAAGGACTATGTGAAAGCGGACGAATATTGTGGAAGAGCGATTTTGGGGAATCCAAACGATGGTAACGTTTTATCACTTTACGCAGATTTGATATGGGAGTGTCATAAGGATGCTCCTCGTGCTGAGACATATTTTGATCAAGCAGTTAAAGCAGCTCCTGATGACTGTTATGTTCTAGCATCATATGCACATTTTCTTTGGGATGCTGATGAAGAAGAGGAAGAAGAAGATGAAGCTGAAAAATCTTTTGGTTTCTTTAATGGAGCTGCTCCATCACATCCACAGCAGTTAGCTGCTGCTTCTTAAGTGCATGTTTGATATTACGATGAATTTGTCGAAATCACATTGAGCCATTAAACAGATAGCTTTTGCACAACTTAGCTTGATTTCGGCAACTAACCTTGTTAATATTAATTATTATTATCTTAATTAACCTTTTGTATTAAATTTTTGGCCGATGAAAATAGCTGTAATAATGGTCTTTGTTTGCCTTATCATCAATCAATGTTGAATCGTATATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA | |||||||||
gi|157980572|gb|EX528844.1|EX528844 MTGland_A046_2007-06-01/MTGlandA046__G05_018_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Me AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CGNNNTTACGGCCGGGCTCTTCCCCCTAAAACACTTGTTCCAAAATCTTCTCTCCCAAACCCTAAGCTTCAACACTGCAATGGATTTGCTCCAATCAAATCTCTCTCGTGTTCGAATTCTTAAACTTGCCAATTATGTCTACACCAAAATAATTTTATGGTCATTTTTAGCCGTCTTGACATACAATTTTATCGTTAACATTATTAGAATTGAAAGGATATGCATGATATGTGTAAACTTATTTTATACTAACATCCAATAAAAGTTCAATATTTTATTACATCATTTTATTTTTGTAAGTGTATTTTTGTCAGTGAAATGATTCTTGGACACCATCCATTGTTGTCGGCTTCCTCGCTCTCTACAACCTTGATTTCTCACTCAACTTGAGTTCTATTCCACTATGATCTCTCACTATTCAAGAAATCGGGGAAAATTCTTCAAGAATTAAGCAATATAAGAAAATATATGACAAAATTGAGTAGAACACACATAGACATGGACGTAATAGTCGCAAATATTCTTACTATTTTTACATACTTGTTTAGACTATTTTTACTATAGAAAGATTTTATAAGGATCAAAACATATCACTTTTTTTTTAATGATGATTAATTTTTTTTAACTATATTCATATGGATCAAAAACTTATTTAACCCTTTTATATAACATAAACTATACTCTCCC | |||||||||
gi|9688709|gb|AL388958.1|AL388958 MtBC51H01F1 MtBC Medicago truncatula cDNA clone MtBC51H01 T3, mRNA sequence AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GAATGTCTAATAGAAGCTGCCGAGGTTCAGAGGTATACCGTAAATAGTGAGTTAATGACGATCATAAGTCGATATCGCATGAGTCGATAAGATTTATAGACTTTATTAAAATTGAATGCCAACCAAGATTTGAAAGGTCCAGAAATATAACGTAAATAGTTAGTTAATTACCAATAAATTGACAAAACCAATACTACAAAAAAGTGTTTATTATTTGAAGACTTAATGGAATTGACAAGATGAGTGAGGTTCTTTGATGTTGGTTAATAATAATTTATATCTTCAATCGAAAGATGCTTTTATTAATAGACATCTATTTAAGTACTACAGATTAATTAAACCTCTCAAGTTTTATATATAAAGGTTACAATGAAATTTATTTTTCTTTTTATTTTAATGTACACGTGGTATTTATTTTGCTTTAAAATAAAACAAATTTATTTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA | |||||||||
gi|14876528|gb|BI269644.1|BI269644 NF012D03IR1F1029 Irradiated Medicago truncatula cDNA clone NF012D03IR 5', mRNA sequence AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GATAAAAGGAACCAGTACAATCTTCGAGATGCAGTTTCCCGTTCCACCACTCAGGTATATCCAAAGTCATGGACTGCTATCTATGTTCCACTTGACAATGTGGGAATGTGGAACTTGAGGTCAGAATTTTGGGCACGACAATATCTTGGGCAACAGTTTTATATGCGTGTATACACAACATCAACATCACTCAGAGATGAATACCCTATTCCTAAGAATGCATTACTTTGTGGTAGGGCAACTGGAANACATACTCGACCCCTTTGATGACTTACTTAGCTACCACATGAATCAATATTACTTACTTAATTAGCCTTTATTAGAAGAATATGATCAAAAAAGCAGCGTACCTTGTCTGCTTCTTCTTTTATTGNTCCGATTGCTTTCATTAATTATTGATGTTGAACTATAAATGACCCCTACTCGAGGNCACATTCTTTCTCATAAGCAAACAGAAACAATATATTATATTCCATTTAAAAAAAANAAAAAAAA | |||||||||
gi|157984506|gb|EX532778.1|EX532778 MTGland_B041_2007-06-07/MTGlandB041_B11_047_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TACGGCCGGGNNAGGGACCATTTACTTAATTAACCCTAAAATTAAATGTAACACCAACACTTTTGATCAAAGGTGCGCCCGGTGTGTGACATTGACACAGGTACCAACACTTCTGATTAAAGGTGTGTGTTTGGTGTCCAACGTTTCAATTTACTGAATTCTTACATACTACACATGAAGCAGCAAAACAAAATTACTAACACATTGAATACACGTACCTGAGAAGATATCACTTGGCTCAAAATTTCACCGTCACTTCTCACCTAAACCAAAAATAAATAAATAAATAAAATAATCGATATGCTAAATCATACCAG | |||||||||
gi|148764837|gb|ES611531.1|ES611531 MTGland_A008_2007-04-03/MTGlandA008_F11_043_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TAAAAAGTGTGATTTATTTTTATAGGGACTAAAAACAAAACTGCAGATATTTATAGGGATCAAAAACTTAATTAACCCATAAAAATATATATCATTTCATTATTACTAAAATATATTTTATATAATGATTTTCTCTTTATGTATTTCAAGTGTGTGTAACTAAAAGGTGTGTTCAAATGCTTATGTCAAACTCATAATTGTTTTTGAACAAGTTATGTCAAACTCAAATTTAAAAGTTAAAATATAGTTTTGGTCCCTG | |||||||||
gi|57567965|gb|CX540940.1|CX540940 s13dNF08E05GS039_465166 Germinating Seed Medicago truncatula cDNA, mRNA sequence AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GAACATATACAATAAAAGTTAGAATCCTATGATCTAGTGTACCTGTTAAATGAATAATACACTTAATTAACCTT | |||||||||
gi|148764487|gb|ES611181.1|ES611181 MTGland_A004_2007-04-02/MTGlandA004_F04_011_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CNNNNNNNNNNNNNNTTACGGCCGGGGGGTTAAATATGTTTTGGTTTCTATAAAATTGACACCTTTACTTAATTTTAATAGTTCTTTTAGTCTCTAAAAAAAAATTGNACTTAAAATTATTTCCTCCTCAATTCAAATTTGTTTAATTTATGCTTAAACTTTTGAGTTTTTGTACAATTTTTTCAGACGTGTTAAGAATATTACTAAAAGTTCCTTTGCAAAAAATTGTCGCAAAATTTGATTTTTACGTCCAAATTTTGTTAATTTTATCTTTAACTTTTGTCGTTTTAAAAAATTTATATTTAATTCGTTTTATGTTAAAAAAATTTAAATTTTAGTAAATGAACCTTTCATAGTGTTATAAACTTGTCTAAAAAAAATCGTTAAAAAATTTAAGAATTTAAGGATAATTAAACAAACTTTGTTGTAACAGGGACTAAAATTANAAGTAATTTTCTTTTGCAGGAACTAAAAAACCTATTAAAATTAAGTAAGGACTAAACTTAGTAGTTCGTAATTTTATAGGGACTAAGAACATATTTAACCCTTTTTATTATAATAAAAAATTACTATATATTTGATGATTTTTTTTTTGGTAATTCATGTTTATTTTANATATTGATATTTGATGATATTCTTGTCTAAATATCGTTTTGTGGTTGAATTTGGTGGTCTCTTACATAATTATGTTGGGTTCTATTTATTANAATTCTCNAGATTCATTCNAAATTCATCTCANATTCTCCAAACGGANCTTTTGACAGTTTAC | |||||||||
gi|157982772|gb|EX531044.1|EX531044 MTGland_B018_2007-05-21/MTGlandB018_F02_003_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TTACGGCCGGGCATCNGCATTTTTAATCCCTAAAATGCTTAAAAAGTGTGATTTTATTTTGTAGGGACTAAAAATAAAACTGTGAATATTTATAGGGATTAAAAACTTAATTAACCTTTTTTTAAAATGCGATAAATATTATGAAAAAGAGTGATTACTTGCTCAATTTTTTTTTTAAGCAAATTTTTTTATAAATAAAAGTAAAATGATCCGGGGCATTAGACCTGACCCAGGTACAACCAAAACGGGGATACAACATGATAATACAGACCATGCAATCAACCTTAGTCAATCCTAACAAAACTAACACAAACACACGGATGCAACTAAGCGAACCCGCGTACGAGCACGCAACCAGATTACAAAAAAAGATGTGAAGTGAACACTCGNAAGAATCGAAAAGGGTTTTAAAGTAGATGAATGGATCGACCGCCAACACGGTATCAAATCCATGTACCATCAACCCCCTGAACAAAGTAGCAGGCATAGGAGCTCTTTCGAGCCAAACACTCTGAGATCAATCACAAGAACTAAGACGAAAAATAAGACAAACCAGTTCAGAGGTAGGCCTGACGACTTGAGACCTACATATATCAACATACCTGAAACATCAGAGAATCAATCACAAAACCACGAACTCNACCAGTTTCANACGTGTTTGAACCCATATCGAGGGANGAGTTCAACACGTTAGTTACCANCATCCCTTTTGGGTTTATANAACCAGACCCTTTTGAGTTTACGAAACAAATCNCCGCAAANNGTCCACATCTGATACCACCCNNNATCTCCGATCCGAAANNTAAAAACAAANNNNA | |||||||||
gi|27408944|gb|CA922014.1|CA922014 EST639732 MTUS Medicago truncatula cDNA clone MTUS-47E11, mRNA sequence AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CACGTAACTTATACATAAACACTTACATGATACACGCTTATATATAAGTGCTTAATTATATGCTTAATTAGTCCTCCTAAGCTTAATTCAGTTGGTTTGGACAATGCATAATATATGCAAGGTCTGGGGTTTAAACCCTGGCCACCACAAAAAAAAAAAAATATTAAAAGTGCTTGATTAAGTTGTTAATTCAGGGGAGGGAATTCAAAAAAGGAATGCTCTGCTCATTCCTGAAAAAGTTTTGGGGATCAAATTTTGTCTTAATTTGTGCCAAACGCTTAAAGTTTCCCTTAAAGTACTTGATGCCCCAAACACTTGCTTCTGAGTAGCTTGTGTTGTCATGCTTGTTGCTACCTAAATCAAGATCCCTATAGTTGTAATATGCAGCTCTTGGAGACTTTGAAACATAAGGAGTCATGTATCCATAAAGCATTCTCATCCACTTTATATGCTTGTTGGATTCTTCAATACTATTCACTTCCCACTGGACAAAGTATTGTATGTTGAACAAGTTTCCTTTTCTATGTGGAAAAGGGATTTCAGATTCTGAAATTTCATTCAGTCTTCCACCATAAGGTTCCATTATAAGTAGTGCTAATGTGTCTTCTTTTAGAAGCATTTTCCAAATACCTTCTAAACCAGTTTCTGGTATAGGCTCTTTTACATAATCGGATTTCGCTTTGAATGGGCTTTTG | |||||||||
gi|9688710|gb|AL388959.1|AL388959 MtBC51H01R1 MtBC Medicago truncatula cDNA clone MtBC51H01 T7, mRNA sequence AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GAATGTCTAATAGAAGCTCCCGAGGTTCAGAGGTATACCGTAAATAGTTAGTTAATGACGGACTCATAAGTCGATATCGCATGAGTCGATAAGATTTATAGACTTTATTAAAATTGAATGCCAACCAAGATTTGAAAGGTCCAGAAATATAACGTAAATAGTTAGTTAATTACCAATAAATTGACAAAACCAATACTACAAAAAAGTGTTTATTATTTGAAGACTTAATGGAATTGACAAGATGAGTGAGGTTCTTTGATGTTGGTTAATAATAATTTATATCTTCAATCGAAAGATGCTTTTATTAATAGACATCTATTTAAGTACTACAGATTAATTAAACCTCTCAAGTTTATATATAAAGGTTACAATGAAATTTATTTTTCTTTTTATTTTAATGTACACGTGGTATTTATTTTGCTTTAAATAAAACAAATTTATTTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCGAGGGGG | |||||||||
gi|8748265|gb|BE204972.1|BE204972 EST397648 KV0 Medicago truncatula cDNA clone pKV0-18P2, mRNA sequence AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): AAATTTTAGTATAACAGTAGAGTTATATATTATTACATTATTCAATCAAATAAGGGAACATAACGAAACGTGACATGTAATCAAGAAAGGATGTATGTATAGTAGTAATAGGAGTGCCTATCCTATCTATGAGAGCCAAACCAACAGGTTTTAGAGAAAGTAGCCATAAAGTTCCAAGTAGCAAATACAGAAGTTCCAAGGATTAGTAGCGTCGGTGGTCGGACCTGTGAGAACAACTCGGAAATACCTAAAGGGAAGCAGGGCGTTGGGACCAACTACGGGCCAAGATGCAAATTGACCAGGTTTACATACTGTCCTGTCGTTTTCATGGACCCTCAAGTCCCGCCAGCTCTTTCCGTCCGCTGATCCCTGATAATTTCACGACAATATTAATTAATCCTTCACATTACATATGAAAGATATTTTTGTGGAATCAGAAATAAAAATATATTTATTAGAAGATACATTATTTAATATAGGATTTAAAGAATATGCACAATAAAGTAAACCACTTTTAGATTGACATCTGACGGAAAATTTACCATTTCGTTCCGTCAT | |||||||||
gi|27406448|gb|CA919518.1|CA919518 EST637236 MTUS Medicago truncatula cDNA clone MTUS-14F9, mRNA sequence AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TTTAATACTAACAAGGAATCAAATTTGAAATTTTAAGAGACAACAGAGGTGTCTGCACTGCATTACAAGATCAATCCAAACACATACTATTGTATTACAACCAAACACATACTAATTACAAAATCTAGCAAACCAAATTCATAGCCGATCACACATAATACCGATGATAAACCAAATTTAGTACAAATTAATTAACCTTGATATTTTATTAGCTTGAAAGTCCCTTAGTGAATCACTTCTCTAATCTCTAGGGACAATTTGGTCATCAACATTTACAATCACAGTTATATTGTTGAGTGCAATCAGCAAATCCCTTGCCTGAGTCTGCATCAGGACCTTCAGTCCTAAAAATGGAACAACTCCATCCTTCACCACACTTGCAGAATGTTTCACTGCCATTGTCAGTGCTAGTCTCAATTTCAGGTGTCACAGCTCCACCATCAAGTGTGCAGGTGCAATTTTCACCGCATTTAACAAAAACTTTGCCAGCATCAGGTCCAGTAGTCCTAGTTATAACACATGTCCAGCCTTTACCAGTCTTGCACACCACATTTCCCAATCCCAGGCCTGAGTTTTTGTCTTGAACTATCACTTTCCCTTGCTCTTGAGTGCAGCTTTGGGACTCCATATTCTC | |||||||||
gi|9681862|gb|AL382111.1|AL382111 MtBC04H03R1 MtBC Medicago truncatula cDNA clone MtBC04H03 T7, mRNA sequence AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GGTGAAGTTATTACTGAACATGAAAATCACATAGAAGGAACTGAGTGGGGTAATCATGTTATGCCATCAGAAACTACTGGTTTTGTAAATAACAATGACAATCTTAAACCAAATACTCAGCATGAGATTGTAAATAATAGAAAAGAGCACTTAAACATGGGGGCTCAGCTCATGCTTGTAAATAGCGACAAAAGGCCTGAAAATGAGGAACATCTTGAAGAAAATGAAGATGAATTTGATTGAAGGTAATCTCTCAGGAACATCTTGAAGAAAATTAAGATGAATTTGATTGAAGGCATGGAAATATTCTTTCATTTGGCACTAGAGGCTTAATTAACACTGTTTATATGATGGTTGAAGAGGTAGAGAAGCTTGAGGAGTAGTAGCTTGATGACTACTATGCAAAGTTGTGGATACTGCTTTGAGTTTCCTTTTCTGCTTGACATTGTAAAGGACAGACAAAG | |||||||||
gi|7566987|gb|AW692251.1|AW692251 NF049C11ST1F1085 Developing stem Medicago truncatula cDNA clone NF049C11ST 5', mRNA sequence AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): ATTTATACTCTTGAGTACAATGGATTCAAAAAAAAGCAATCCTCATTCTAGGCCTATTTGCTATGGTTCTTATTTCCTCTAGGGTTTCAGCGAGGGTCTTAACTGAGACTTCCTCTAATACCAAAACGGGTGAACTATATAATATTTTTCATTTTTCTTTATTCATGAGAATTTATTTATAAGTATTTTGTATTTTTTCCTCTTTTGAATTTTATAAGTATGCTTGTAAGTAATGTTGGATGATTATTTTGGAGAGCCTGATTATGTGGTGGGATGTCCTTTATGCTAGGTACGGGTCTATGATGGCTTTGTCTCTTTTGGGCATTGTTCTTGGTTAGGGGAGTCTGACCTATGGCTCATTCATTCTCTCTCATCTCATCTAACTAATTTATTTTAATCATCATCCAATATTTTTTTTTCATCTAAAGGCACAAAAAATTTAATCTACACAATTTTTTTTCCATGAAACTTATTCCAATAAAAACACAAAAAATTATATCTCAAACTACTATGTTTTTGTTTTCTTAATAAGTGTGAATTTGTGTTTTTTGTTTATAAATTAGGACGGAGGGAGTAGGAACTAAACTAGAAATTCTGTGATATTGTAGAGATTAAAAACATATTTAACCCTTTTAAAATTTAATCTATATTTAAT | |||||||||
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gi|14872203|gb|BI267301.1|BI267301 NF101B12IN1F1101 Insect herbivory Medicago truncatula cDNA clone NF101B12IN 5', mRNA sequence AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GATTTGTGTAGTTTATTTATACTCTTGAGTACAATGGATTCAAAAAAAAGCAATCCTCATTCTAGGCCTATTTGCTATGGTTCTTATTTCCTCTAGGGTTTCAGCGAGGGTCTTAACTGAGACTTCCTCTAATACCAAAACGGGTGAACTATATAATATTTTTCATTTTTCTTTATTCATGAGAATTTATTTATAAGTATTTTGTATTTTTTCCTCTTTTGAATTTTATAAGTATGCTTGTAAGTAATGTTGGATGATTATTTTGGAGAGCCTGATTATGTGGTGGGATGTCCTTTATGCTAGGTACGGGTCTATGATGGCTTTGTCTCTTTTGGGCATTGTTCTTGGTTAGGGGAGTCTGACCTATGGCTCATTCATTCTCTCTCATCTCATCTAACTAATTTATTTTAATCATCATCCAATATTTTTTTTTCATCTAAAGGCACAAAAAATTTAATCTACACAATTTTTTTTCCATGAAACTTATTCCAATAAAAACACAAAAAATTATATCTCAAACTACTATGTTTTTGTTTTCTTAATAAGTGTGAATTTGTGTTTTTTGTTTATAAATTAGGACGGAGGGAGTAGGAACTAAACTAGAAATTCTGTGATATTGGANAGATTAAAAACATATTTAACCCTTTTTA | |||||||||
gi|8748427|gb|BE205132.1|BE205132 EST397808 KV0 Medicago truncatula cDNA clone pKV0-20O16, mRNA sequence AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): AATCTTTTCTCTCACTGTAACACGGTCGGTGGTTTGCTATAATCCAAATTACTCTGTCGTTTTCAATTCGTTTTAGTTTTAGACTTTTATGTGAACTACTATCTTAATTAATCCATTCCCTCACTGATCTCCAATCACAACCAAAACAACTTCACCACAACACTCTAATGGGAAACTGTTTTGTTAAGTCGGAGAAATTAACGGCTGAGATTATACCTCGCGACGTAGCTAAAGTCTATCCAACCGTCCGTTTATACGGTTCACCAAAAAGCATTCTCACTACTTACATTCGTTTCGCTCTTCTTCACAAATCCGTTTCATTGGATTTCGTTCCCTCATCCGAAACTCTACGAGATCATTTCGGATCCGACCCGGATGGACACGTCACTCTTCAAGTTGGATCCGAAAGTGTTACGGGTTCGCGGGAGAAGGTGTTGCGGTTTATGGAGGCGCGGTTTCCGAATTTGGTGACGGCGGCCGGCGGTGGTGGTGTGGAAGAGGGAAAATTGCCGGTGATGGTTACGCTGACGAGGTTGCAGCATAAGAGTATGTTGTGGCATGTGGAGAGGGTTTTGAGGTGGGCGGAAGATCTTGTGAAACGTGGAGGG | |||||||||
gi|157980678|gb|EX528950.1|EX528950 MTGland_A048_2007-07-07/MTGlandA048_B07_031_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): ACTNTTTTGGTATTTCNGTGCATTGATGGACTATTGTGACTAATCGTTGTACATTCAGGAACNAAAATGATTNTTTTCTCTTAAACAAATCACTTTTTTTTAGTACTTGTAACATTTTCNTGTAGGAACAAAAATACTGACGGAGAATTTTACAAAGATTAAAAATGTTGATGAAATTTTTACAAGGACTAANAAGTACGACTTCTATTAGGAAAATATTTATAAAAACTATTTACTTAATTAACCTTTTTTACTAAAAATTGATAACAGTTGAAAAGAAGAAAAAATTAATAGGTTAAACTACACCGAGGTCCTTTAAGCTATTTAATTGTAATAAATTGGTCCTTTAAGTTTTTTTTTCGTACCACTTACGGTTTTTAAGTTATTTGATTGTTTTGTTTTAAGTATCTTTCNTAACGCTTANGTCTTTTAAGTTAATTAATAGTAACTTTTAAGTCCCGAATAACTTATATNGTTGAGATAAAAAATACTCCNAATTTTTCNGGTTAAAAAACTTAAAAACCCTAATTGGCATGAGAAAACTTAAAACNNATTTATTACNACTTCANGCGGAGAGTGTGAAGGAGTGCTTTATATTATTACATAACATTGTTTTGCANGAACACGTTCATGACANTNGGAGATGGCTATTAGATCATATTCNNGG | |||||||||
gi|20308366|gb|BQ165698.1|BQ165698 EST611567 KVKC Medicago truncatula cDNA clone pKVKC-11A11, mRNA sequence AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): ATAGGAAAAAAACCAAAATTTGCTAACTTTTTATAAACAATAAACTTATTTAACCCTTGAGGATTTTTTTTTTCCTCTACTCCCCTCTCTCCAAAGCCCTCCACACCCATCCAAATTCCCAAAGAGACCCTTAAAGCATTTGAGTGAAGGACTGCACTAAATTCAAAGGCTTTCACTTTTCCTTTTTGTAAAAACAAAATAAAATTCACCTTATTATGGTTCACGTCCACAAGTTTCATACTAAGGAGTACACCATTTCTAGCACAAGATATCAAGGATCACTAAACAATTATAGAACGAAATATACAGACTGTATATTTCATTCACCTATAAACACAATTCTATAGTTCAAAGCAAGAATTATTTTGATATGCAAAGCTGCATATAAGTTACCTTACCTAACAAATACTTGTGACACGAAATGGATTATTTTCTCTTGGGTGGAGGGAAATATGTTGGAATAACATTAACTTACTTTACAAGACCTAAATTGAGGATACCCCATGAAGTATTTGGCCAAGATTTCTCTTTTGCCTTCATTAACAAAACTCTAGTCCATGCAATCCAACCTTCCCAAGAAATCCTTTTATCCCAATGACATCCCCATTCAAGCAAAAGAGTCAATCCTCTCTCAGCTTCTTTCTCACCCTCTTCAAATCTACCCTTTGTCAAATAAACTTGACTCAACACCACATATGGCTCTCCCACAA | |||||||||
gi|260521385|gb|GT139141.1|GT139141 METCI01TF JCVI-MT3 Medicago truncatula cDNA 5', mRNA sequence AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CAATGACCAAACCAAATCTCTTCTCTCACTTTAACGCGGTCGGTGGTTTGCTATAATCCAAATTACTCTGTCGTTTTCAATTCGTTTTAGTTTTAGACTTTTATATCAACTACTATCTTAATTAATCCATTCCCTCGCTGATCTCCAATCACAACCAAAACAACTTCACCACAACACTCTAATGGGAAACTGTTTTGTTAAGTCGGAGAAATTAACGGCTGAGATTATACCTCGCGACGTAGCTAAAGTCTATCCAACCGCCCGTTTATACGGTTCACCAAAAAGCATTCTCACTACTTACATTCGTTTCGCTCTTCTTCACAAATCCGTTTCATTGGATTTCGTTCCCTCATCCGAAACTCTACGAGATCATTTCGGATCCGACCCGGATGGACACGTCACTCTTCAAGTTGGATCCGAAAGTGTTACGGGTTCGCGGGAGAAGGTGTTGCGGTTTATGGAGGCGCGGTTTCCGAATTTGGTGACGGCGGCCGGCGGTGGTGGTGTGGAAGAGGG | |||||||||
gi|11931941|gb|AW696136.2|AW696136 NF102E03ST1F1021 Developing stem Medicago truncatula cDNA clone NF102E03ST 5', mRNA sequence AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GTTTCCATTCAGAGCTTGACCTCGAAGCTAACACCAATGACCAAACCAAATCTCTTCTCTCACTTTAACACGGTCGGTGGTTTGCTATAATCCAAATTACTCTGTCGTTTTCAATTCGTTTTAGTTTTAGACTTTTATATCAACTACTATCTTAATTAATCCATTCCCTCACTGATCTCCAATCACAACCAAAACAACTTCACCACAACACTCTAATGGGAAACTGTTTTGTTAAGTCGGAGAAATTAACGGCTGAGATTATACCTCGCGACGTAGCTAAAGTCTATCCAACCGTCCGTTTATACGGTTCACCAAAAAGCATTCTCACTACTTACATTCGTTTCGCTCTTCTTCACAAATCCGTTTCATTGGATTTCGTTCCCTCATCCGAAACTCTACGAGATCATTTCGGATCCGACCCGGATGGACACGTCACTCTTCAAGTTGGATCCGAAAGTGTTACGGGTTCGCGGGAGAAGGTGTTGCGGTTTATGGAGGCGCGGTTTCCGAAATTTGGTGACGGCGGCCGGCG | |||||||||
gi|20282207|gb|BQ145148.1|BQ145148 NF003F12GS1F1102 Germinating Seed Medicago truncatula cDNA clone NF003F12GS 5', mRNA sequence AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TGATNCGCCAGCTCGAAATTAACCCTCACTAAAGGGAACAAAAGCTGGAGCTCCACCGCGGTGGCGGCCGCTCTAGAACTAGTGGATCCCCCGGGCTGCAGGAATTCGGCACGAGGAACATATACAATAAAAGTTAGAATCCTATGATCTAGTGTACCTGTTAAATGAATAATACACTTAATTAACCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCGAGGGGGGGCCCGGTACCCAATTCGCCCTATAGTGAGTCGTATTACAATNCACTGGCCGTCGTTTTACAACGNCGTGACTGGNAAAACCCTGGCGTTACCCAACTTAATCNCCTTGCAGCACATCCCCCTTTCNCCAGCTGGCNTAATAGCNAANAGGCCCGNNCCGATCGCCNTTNCTAANANTTNCCCACCCTNATTGGCNAATGGCAAATTGAAANCCGTTAATATTTACNTTAAAATNCNTTNCCAAANTTTTTGNTNAANCACCTCNTTTTTTAANNANTNCNGCANANNTCNCNNNNNTTCNCTTTTCATTCAANNNTANNCCCTNCCATNCNGGNNTNNTCNNCCCCTCCNTNCCTNNNTCCCTNTNNNANCTNTCCCANNCCNNCGTCCCCCTTCNTTACCNCNCCCCTNTNTANTTCNNNATTNCCNNCCTATNCNCNCNNNNTCCCNCCNTTCCTTTTACCCTNNNTNTCCCNCCCGTCANNTCNTCCATTTCTATCCTNCCTCNNCNTNNACTTCANNGCNNNCTCCNANTTNNNCNTNTCTCCNCCNNCNTNNTCTTATCACTGCCNTNTACCCCCTATCACTNNNCNANCTCCANTAATCCNNNCCN | |||||||||
gi|13781792|gb|BG646680.1|BG646680 EST508299 HOGA Medicago truncatula cDNA clone pHOGA-9B21 5' end, mRNA sequence AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TAAAATGGTGTAGTCAGGTGGAGGTTTTGTCGCACCCGTTCTTTGGGTTGTTTTATGACGCATTGTGGATGGAATTCGACTTTGGAAAGTTTGGGTTCAGGGGTTCCTATGGTTGCATTTCCTCAGTGGACAGATCAAACCACTAATGCGAAGTTAATTGAAGATGTGTGGAAGACTGGGTTGAGGATGGAACATGATGAGGAAGGGATGGTGAAAGTTGAGGAAATTAGAAAGTGTTTGGAAGTGGTGATGGGGAAGGGAGAAAAAGGAGAGGAACTAAGGAGGAATGCTAAGAAATGGAAAGATTTGGCTAGGGCAGCTGTGAAAGAAGGAGGGTCTTCAAATAGGAATTTGAGGAGTTATCTAAATGATATTGCATGTATAACTCAAATTTAGTTAACTCTTTTTTCCTCTGTTTTTTGAGAAAGTGTTTAGTAGTACTTTATCTCAGAAAAGGAACATCACAATCTCTTCATAATAAAGAGTAGTCAATCACAATCCACTTTGTCACAATCAAGGGAGGTGTGACTAAAAAATAGGAAGTGAACAATAAACCATCCAATAAACATTTACTGATGTTTGTCGTGAAAATTTTGCTATGCCTATCTCTCGCTAGAAATAGCATTTTCAG | |||||||||
gi|61673304|gb|AJ864434.1|AJ864434 AJ864434 Medicago truncatula cv. J5 root Medicago truncatula cDNA clone MtPfEs122, mRNA seque AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): AAAAAATTACAACAACAAAAAGAAGAAGAAGTTGATGATGATGAGCTGAGTTGTAGAGAGGAACTTGAGAATAATATGAATGGGAAGATAGTAAAATGGTGTAGTCAGGTGGAGGTTTTGTCGCACCGTTCTTTGGGTTGTTTTATGACGCATTGTGGATGGAATTCGACTTTGGAAAGTTTGGGTTCAGGGGTTCCTATGGTTGCATTTCCTCAGTGGACAGATCAAACCACTAATGCGAAGTTAATTGAAGATGTGTGGAAGACTGGGTTGAGGATGGAACATGATGAGGAAGGGATGGTGAAAGTTGAGGAAATTAGAAGGTGTTTGGAAGTGGTGATGGGGAAGGGAGAAAAAGGAGAGGAACTAAGGAGGAATGCTAACAAATGGAAAGATTTGGCTAGGGCAGCTGTGAAAGAAGGAGGGTCTTCAAATAGGAATTTGAGGAGTTATCTAAATGATATTGCATGTATAACTCAAATTTAGTTAACTCTTTTTTCCTCGGTTTTTTGAGAAAGTGTTTAGTAGT | |||||||||
gi|11905724|gb|BF641566.1|BF641566 NF068B04IN1F1032 Insect herbivory Medicago truncatula cDNA clone NF068B04IN 5', mRNA sequence AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CTTTTGTAATACCGATTTGTGTAGTTTATTTATACTCTTGAGTACAATGGATTCAAAAAAAAGCAATCCTCATTCTAGGCCTATTTGCTATGGTTCTTATTTCCTCTAGGGTTTCAGCGAGGGTCTTAACTGAGACTTCCTCTAATACCAAAACGGGTGAACTATATAATATTTTTCATTTTTCTTTATTCATGAGAATTTATTTATAAGTATTTTGTATTTTTTCCTCTTTTGAATTTTATAAGTATGCTTGTAAGTAATGTTGGATGATTATTTTGGAGAGCCTGATTATGTGGNGGGATGTCCTTTATGCTAGGTACGGGTCTATGATGGCTTTGTCTCTTTTGGGCATTGTTCTTGGTTAGGGGAGTCTGACCTATGGCTCATTCATTCTCTCTCATCTCATCTAACTAATTTATTTTAATCATCATCCAATATTTTTTTTTCATCTAAAGGCACAAAAAATTTAATCTACACAATTTTTTTTCCATGAAACTTATTCCAATAAAAACACAAAAAATTATATCTCAAACTACTATGTTTTTGTTTTCTTAATAAGTGTGAATTTGTGTTTTTTGNTTATAAATTAGGACGGAGGGAGTAGGAACTAAACTAGAAATTCTGNGATATTGGANAGATTAAAAACATATTTAACCCTTTTTAAATTTAATCTAT | |||||||||
gi|157983447|gb|EX531719.1|EX531719 MTGland_B027_2007-05-25/MTGlandB027_D06_021_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med AGGGTTAATTAAGTTTGTAGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CTCTTGTTTTAATATATATTTTTTCCATAAAAGAATAAGTATAAGTATTATTTTAAATTTTTTATTATATATTTGAACTTCAAGGATTATTAGTTTTAATAAGGAGTATATTTTAAAATTTTATAGGGACTAATAATATAAGAAATTTTTTAGAGGGACTAAAACGAAAAGTTGACATATTTATAGAGACTAAAAACATATTTAACCCTTAATTTTTCTGTGATTTTCAGCTACTGGAGGACTCATCCAGGAATAATATGGGGAATTCTAGGTTGGTGGGGAAATATGGGAAATGCATTTGGTGTGACTAATATTCCAGGGTTTAGTCCTGGTTTAACCTTACCACAAGCACTTTCCAACACAAGAACTGATGGTTTAGGAGCACTCTACAGAGAAGGAACTGCTTCATTTCTTAACTCCTTGGTGAACAACAAGTTCCCTTACACAACTGACCAAGTTAAGGACAGGTTTGCATCATCACTTCGCTCCAACAAGGCTGCTGCAACACAAGCTCACCTTTTCAAGATGGCAAATGAAGGAAAAATGAAGCCTAGACCATGAAATTGATCATAGTCATCATGATCCTAATTAATTAGTTTGTTTGATTTTGGTGTGTCAATTTATTAAGAACATTATATTAAGGTTTTTGTTAGTTTGTGGTA | |||||||||