| mature miRNA: ATTTGGGACGGAGGGAGTATG species: Medicago truncatula database: miRNEST The numbers on the right side of the alignments show a score calculated for them. When calculating the score, a mismatch is given a score of 1, bulge: 2, and wobble: 0.5. |
| Predicted miRNA targets | |||||||||
gi|157980601|gb|EX528873.1|EX528873 MTGland_A047_2007-07-07/MTGlandA047_B06_023_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): ACGGCCGGGGCATGACAAATATTTATCATTGATGAATATAACAAAAAACCACAGGAGACACCTGAAAAAATAAATTATTAAACTTTAACAACAATGACAATGACGATGAATACCCAAGTTTAATAAAAAAATACTTCTATCTTTGAGCTTAAAAAAAAAATTACTATACTATGTAGATATTCAAAGTCATAACAATGACGATTGTAAGGCTACTAAGGCTAATCCGTAGGACTCTTCGGTGTTCAAATATATAGTACATACATGCCAAAACAAGTTAAAACATAGAAATATAGGTCACTAACTCACATATGTTGAGTGAGAAAATTCTTTTCTACACACATTGCGAAATGTTGAGTGAGAAAATTCATTGTGCACTATATGTCACTATGTTTAATGTGCACACATTGCAAATTGTTGAAGGAGAAAATTCTCTTATGTTATTGCAATTTGCAACAAGAAAATTCCAACAGTTTTAAGCTTATTGTTGAAGGAGAAAATTCCAACAAGAAAATTCCAACTATTGCAATGTGCACACATTGCAAATTGATAGAAGGAGAAAATTCTCTTATGCACACAAAAACTCATAATTTTTTCGTAAACTAAGAGCCTGTTTGGTTAATATGATAACATTATTTTATCCTATCATATGATTGGTACATTCATCAATTTACCCTATCTTCTTTTGCCCATTTGCTAGTCTCTTTGTGTCTTCCGCATCAAACGGGCCGTAAAAGTATCCATCACACGCAACTGCGGAGATTAATCACCTCGAGANAATTAAGAACATGTAAATTTTTTTGGATAAAAATATATACCATTTAGTTTAGTTATTTAGAAAAAATATACTACCTCCGTCCCTAATTATAANACCCTTTTGAAAAAAAAATTGTCCCTTTTTATAAGACCCCTTTGTTATTTCCAACTACATTAATTATTTCTTTACATACATGTCCCTATTNNNATACATCTTTTCTNCANCANNNTAANNANNTGTNAAANNNAACNNTCTCTCTANNNNAAATNTAAANANAGNAT | |||||||||
gi|157984741|gb|EX533013.1|EX533013 MTGland_B044_2007-06-23/MTGlandB044_C01_006_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): ACGGCCGGGGGNNCTTTGAATTTATGAATCTATTATCCGTCAATGTTTCAAATACCTCTGAAAAAGTTAGAATCTATATGCAACCTACGAGCGTAAGTGTATCTTTTTATAGGATGGACAACTCTAAACACTTAAACATGTAGGAACTCCGGTGTAATAGTTGCAACTGACAGCTGTAGGGCTATGAACTCGTATATCTGAGTGAATAAGATCCCACATGTAGCTACCCATGTGATCAACAAGTGCAACTCGACATCAGATATGTAGTAAAATCCCACGAACTCATCACTTAAATAGAAAATACTAAAAGCTGAATAAGACTTGACTATTAGTAATTCTAACAAATAAATAGAGGGGGTTCGAACTGCCACTAACATTCTGCAAACAAAATAAGTAAACTTTGTTCTGTTGCAAACAAATTAAATTGCAAAACTCTACATCCTCATCTTTATTTATTTTTACTGTTCCCAAATACTCTCTCCGTCCCATAATAATTGAGCAATTTGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAANCNNGT | |||||||||
gi|157981176|gb|EX529448.1|EX529448 MTGland_A054_2007-06-25/MtGland_A054_D11_045_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Me ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): ACGGCCGGGCTATTTAAACTGATCTAAAAATCTCAAATGGCTGCCAATTAGCAATTAATCATCAGCATAAACTAAACAAACAAGCAGTTTTAGAACTTGAGTTGTAGATGAATAAAAACGTACTCATTTCGTCTCATAGTAACTGAATCATTTTACTTTTTAATATAATATTAATTATTTTTTCCCCTTTATAACTCTAATTAATACTACTTTCATCGCTCTCAATTTAATACTCCATCCGTCCCAAATTGTATGTCACTTTGAAGAAAAAAAATTGTCCCAAATTGTATGTGTCTTTACAATACCAATGAATCATTAATGTTACTTTTCCTATTATATCCTTCGCTATTTATTGCATTCTCTACTTCCAAGTCATTTATTTATCTTTCCCATATCATTTATTAAGGACAATTTTGTAAAACGACTCATAATATATCTTTCCCACATAAAATTAATTACATTTCTTAATACGTGTAAAATGCCCAAAACGTCATACAATTTGGAACGGAGGAAGTATATTTTACTTTGCATTTATGATAGCAGATAACAAGTTTGATTATTTGAGGTTTGATTACATGACTAATGGTGTCTTTGTAATCAATATTGGGTCTTTGGTAAAAACATTTGACGACAAGTCTTGCTTTATAGCGAGAGATAGAACCATCAGATTTCTTTTAAATCGAAAATCTCGTTTGTTACCAATAACATTGTACAATGTGGGGCTGGTGGAACAAGTTCCCAAGTCCCATTACACATGAAAGCCATGCAAGCTTACCTGCGCCGCTAATTCAACAACATACTCCATAATTTTCACGACACAACAAACAGGAAATCATTTGGTGCTTACTTAATTTATTTTGGTCCAAACATTATCTCTTGAACATTC | |||||||||
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gi|10699638|gb|BE999362.1|BE999362 EST431085 GVSN Medicago truncatula cDNA clone pGVSN-15P6, mRNA sequence ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): ATATTTCTTGTGGTAACCAATGGACGTGAGTAGTTTCTGACATTAATTTCTTCTTAATGTTATATACATAATATTCCCTCCGTCTCAAAATAAAAAGTAAAATTGACTTATATTTTAAAACAGAGGGAGTATTTCATTACCTCGTGGTAACATTGATTTGTTGTTGTTTGACTTTGCAGAAGAATGTAAAGATGATGGTGATTGTCCAACAAATATGTGTCTCCCTTCTCTAGTTTCGAAATGCATTAATTTTATTTGTGAGTGCACACATTCGATGAGTACTGATTAATATTAAAAATACCTATATGTTATTAAAAAGCATATATTTCAATGGGGTTTACTTTCTTGGCAAGTTTCCTTTTCTTAAAAAATAATAATTTGTAATAAGTATACAATTTATTTGTACTTCATAATTTTCCTCACAGTTTGATTTATATTTTTCTTGCCTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCTCGTGCCGAATTCGGCACGAGGATTCTTTGGATGACGCAGCCATGAAGCAAAGATTTGGTGAGAACATGGGTCAGCTCTTGGACCCAAATCATGCCTCAATATTGAAGTCAGCTGCAGCTGGTGGTCAGCCTTCAGGGCAAGTTTTGCATGGCACTGCTGGTGGGATGTCTCCACAAGTTCAAGCTCGTAGTCAGCAAC | |||||||||
gi|20291750|gb|BQ154691.1|BQ154691 NF095E08IR1F1067 Irradiated Medicago truncatula cDNA clone NF095E08IR 5', mRNA sequence ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TGATNCGCCAGCTCGAAATTAACCCTCACTAAAGGGAACAAAAGCTGGAGCTCCACCGCGGTGGCGGCCGCTCTAGAACTAGTGGATCCCCCGGGCTGCAGGAATTCGGCACGAGGCAACTTTTCAACGGCGGGTCCACCTAACTCAATAGTGAGTGGCTATTTTAATAATCAAAACTCTTTTTTCTCTGATTTTGCCACTGCTATGATCAAGATGGGAGATATTAAGCCACTCACTGGATCAAATGGAGAGATTAGAAAGAACTGCAGAAAACCCAACTAATATTTAAGTTTGAACTGATATTAATCGTCCAAGATATACACATACAAAATTGTATTATATAGATGTGTGGGTGCACTTGCGCAAAATAAGTTGTTAAGCAAGTTTTGATTATCATTTTAATTATGTGTGCTTCCGAGGGTCTTGTATTGTCTTAGTTATACTCCCTCTGTCTAAATTGTACTCCCTCCGTCCTAAATTGTATGACGTTTTGGGCATTTCACACGTATTAAGAAATGTAATTAATTTTGTGTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCGAGGGGGGGCCCGGTACCCAATTCGCCCTATAGTGAGTCGTATTACAATTCACTGGCCGTCGTTTTACAACGTCGTGACTGGGAAAACCCTGGCGTTACCCAACTTAATCGNCCTTGCAGCACATCCCCCTTTCGCCAGCTGGCGTAATAGCGAAAAGGCCCGCACCCGATCGCCCTTNCCAACAGTTGCCCAGCCTGAATGGGCNAATGGCNAATTGTANCCGTTAATNT | |||||||||
gi|161110418|gb|EY478289.1|EY478289 METBC36TF JCVI-MT3 Medicago truncatula cDNA 5', mRNA sequence ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GGATCTAAAGGAGAGAAAATATGGCTCAGTTTCTCATATTTGTTTATACTTTGATCATTTTTATTTCTCTATTTCTAGTTGAAGCGTCACCGCGTATGACATTTTTCACACCATTTTAAATTTTCCCAATTTATTTTTATACACAATATTGTATCATCTTTTAGTAACTTTTTTTCTTAATTGAGAATGCAGTTCAAAGACCCTGTGTTACTGTCGCTGATTGTCCACCGGTAAAAAAACCTCTAAAGATGTGGTGTATTAGACAGACTTGTTTTTATGGTTTTGGAAAACGCCCCGATCTTTAAGTGAATAATAATATTATGTGCGCGTCATAATAGTAACACGATGCGCTCTTTTTTTTCTTCCTTTTGTATTATCCCACTAAGTTTTCTGCTAGCAAGGATTTTAACGACATTGTTGTCTGTAATATGTATCCCTTAGTAATATAATACTTCCTCCGTCCCAAATTGTATGTCGTTTTAGGGAAAAAAATTTAACCTAAATTATATGTCGTTTTACAATCCAATACAAGATTCATTTATCTTTTCATATAGTTAGTAAGCCCATCTGTAAACAAATATGAGAATTTATTTTTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAA | |||||||||
gi|148765239|gb|ES611933.1|ES611933 MTGland_A013_2007-05-02/MTGlandA013_G11_042_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GNCNTTACGGCCGGGNNNTGTCCTCAACATTAACATGCAAAACAACATTGCAAAGCAAAGAACAACACTCCCTCAGCAAGTCTTCCTCTCAAGCATGTAAATGTCGCTTCCACTTCCAATCCTACCCACATTCACCCCAACCTAACTGACACATCTACGCAACAGTCAACACCCTTTGTCTCCGCCAAGTCATAAAGCCGCTTAAAACTAACACAAAAAGCTACATCATCCACCCACGTGTGTCCGTCCAAAAGAATGAACGCATTCCATCACCCACCACCATTTGCGATTATCGTCGTTCGTCAAACCAACTTTTAACCCCTAAACTTATCCACTCATTCAACTGAATTTACCGTGATAAAAATTATTGAAGCAGTAATTATTTTTAAGGGTACTCCCTCCGTCCTAAAATATAAGAAAAAAAATTCATTTTTTTTGTCTCAAAATATAAGCAAAAAAGATCAACTTTTATGCTATTATTATGTTTTTTCAAATAAATCATTTTTTCCAATGTAAAATTAAATGCAAATTGCATTCAATTTGTTCTTCTTTTTGTTTTCTCCATAATTTTTAACAGATGAGAATTATTTTTACATCTTTCCATGAAACTTATTCCAAGGAGAACTACCTCAAATCACTAAGTGTTAGTTTTCTTAATAAGTATGAATTAGTGNTTTTTCTTATAAATTANAACGGANGGAGTATACCGCAGTGCTAATTGCTATTGATGATAAGTTTTTATGATAATCCAGTGATAAATTTACTTCCTATTTTNNTATTTTTA | |||||||||
gi|9683085|gb|AL383334.1|AL383334 MtBC13E04R1 MtBC Medicago truncatula cDNA clone MtBC13E04 T7, mRNA sequence ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): AAGAGATAATGTTGCAGGATCACATGGTAACTTTTTTAGGATTGTGCAGACCCAAACTGGTGGTAACTATAACATTCAATGGTGCCCTACAGAGGCGTGCCCTAGTTGTAAGGTTCAATGTGGGACTGTTGGTGTTATTCGTGAGAATGGCAAGATTCTTTTGGCCCTTGATGGTGGTGCCCTTCCAGTTGTGTTCCAGAAAGAATGATTATTAGTACAATGGTGAAGTTTCTTTATGTGGTGCAGTTTTCTTTGTTGCTCTAAATGTAAGGTTAATAAACATATACTCCCTCCGTTTCAAAATACATGTCCATTTTGGTGAAATTGCACTAACCAAAAAACCAAATAAATTTTGTTATTTTTGATGAAAAAAAAAAAAAAAA | |||||||||
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gi|260522082|gb|GT136958.1|GT136958 METBT29TF JCVI-MT3 Medicago truncatula cDNA 5', mRNA sequence ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GGAGTGAATGATTGAACCCTAATCCCCCAAATCAATTTCTTATACTCTCCGGCGACGGCGACGGCGACCACCGCGCGCGTCTAAGCTCCGGCGAGCTTCGTTCACTCCTTCGTCATTTCATCGTGTTAGGCTTTAATTCTTGCATCCATGGAGACGGTCGACTGGTCTAAACTCCCAACAGACCTTCTCAATCTGATATCACAACGAATCGACGATGATGAACTCGATCTCATTCGCTTCCGATCAGTTTGTTCAACATGGCGCTCTTCCTCCGTCCCAAATCATCATTACATTTTACCCTACAAGTTCCCAGTCTTCAAATTACCATTCATCTCTGAGCAAAACGACAAAAACCCTCCATTCTGTCACCTCTCCAAACAAAATATCTTCCTCATCAAACCACCACAGCAACAACAAGAACAACAAACCCTACTTCGCCCTTGGTTGATAAGAGTTAGCCAAAACACGCGTGGCAAAACTCGATTTTTCCACCCACTTTTCTGTGATTCCCCTCTTCCTC | |||||||||
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gi|260526924|gb|GT144154.1|GT144154 METCO50TR JCVI-MT3 Medicago truncatula cDNA 3', mRNA sequence ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CGGTATTGTTGATCGATTTGGTCGAAGATTCCTGTTCATAACTGGGGGTATTATGATGTTTGTCTGCTTGATTGCTGTGTCCATTGTGCTAGCAGTGGTGTCTGGTGTTGACGGTACAAACGACATATCCAAGGGGAATGCAATATTAGTATTGGTGCTATTATGTTTATATTCTGCTGGTTTTGGTTGGTCATGGGGTCCTCTAACATGGCTTATTCCAAGTGAGATTTTCCCAGTAAATATAAGAACCACAGGACAAAGCATAGCTATTGCTATACAATTCATAATAGTATTTGTGCTATCACAAACATTCTTGACAATGTTATGTCACTTTAAGTTTGGAGCCTTCTTGTTTTATGCTGGTTGGGTTGCTGTGATGACTCTTTTTATTATATTTTTCTTGCCTGAGACTAAAGGAATTCCTTTGGATTCAATGTACACCATATGGGAAAAACATTGGTTTTGGTGTCGATTTGTTAAAGGAGAAGATCGTCAAGAAAATCATCCATGAAGTTTGTAAGTAAAGGATGAAAAATTATTTATGTTTTGTGTAAATTGTATAATTTGAAACACCATTTACCACTTTAAATATTAGTTATACTCCCTCCGTCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA | |||||||||
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gi|148765678|gb|ES612372.1|ES612372 MTGland_A019_2007-05-07/MTGlandA019_D07_029_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): ACGGCCGGGCCCNTCATTCATTTATCCAGCTAAAATAGCAATTGCATACTAATCAGGGTTTTAAGAAAATGTTAACGACATCAAGAATCTTTACACAGCTGCATTTGAGTAGATTCTTTAAAACCATTTTTCAGTACATGATTTTAACCATGATAAACAAACACAATATACCTTCCTTTTAAAAGAATTACCCAGGAAACAATTACCTACGAAGGTATTACCTGGGAACCTTAATCCTTGGCAAAATCCGCAGGAAACAGGTTTCAGAAAAGAAAGGCTTCATCTCAATGAAATAAATGAAGGCAGAGAGTTGAAAATGATCTTATAAGTGCACACGGCTGCATATTGTTTTCAATCGTGTTTCATGCCTCATTAAACAAGTAAAAGCTAAAATTAGAATTTAAAGAGATATGGCAGAACAATTATACAAATGTTCTCCAAAAAAGTAACTCAATGAATTGACTAAGTGCATTTTTTTAGAGGAAGTATCCCTTCAAATTATGAAATTGAGGAATGCTATTCTCGGAGATGAAAGTGAGGAATGCTTACATGGCTCCCTGTCTACTTCTCCCTCCGTCCCAAATTGTATCACGTTTCCAGATTGTGACGTTTTGAAAGAAGAGATATTATGATTTTTTACAAAATTGTCCTTAAAAAATTATATCGGAAAAATAAATGAANGAATTGAAAGAAGAGATAGTAATAAATAGTTNAGNNNTAATNNNAAAGTAACATTAATATTTTATTTGTATTGTAAGCGACGTATAATTTGAGANAATTTTTTTTTTTTNNNAAGNGANNNATAATTTGGGANNGANNNAGTACNAANAAAAAAANT | |||||||||
gi|14872060|gb|BI267222.1|BI267222 NF099D03IN1F1030 Insect herbivory Medicago truncatula cDNA clone NF099D03IN 5', mRNA sequence ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TCTATCTAAGCGTTATTACAACAGAAACCTTATTGCCTCCGTTTCAAATTCAACAACGATGAACGACTAATACGATAATTTAACCTTAAACCTTAAAAGCCTTGTTTTGTTTTGCGACTTTTAAGTTGAAAGTTAAAGAACAACACAAGAAACAATGGCGGGAATAGCTATACTTGTAGATCTATGGAGGAAGAATCATAATTCTGCTTTTCAATCTTCTGCTTCCTCTTCTGCTGCTGTAGCTGCAGCTGCTTCTTTTGCTGCTGGTACCACTTTTGCTTCAAGGGCTTTCTTTGGGATACCAGTTGCATATTGTGATGCTGGCGCCACAGTATCTGAAGATCTTATTTCTACTATACAAAGTGCTTCTGAAAGGATTTACAATTATGATGCTGAAAGATTTAGTACAAAAACGTACAATGTCCAACCTAAACCTCTATTCTCTGCTTTTGAGTTGAGGTCACTTGCAATGACTTCAA | |||||||||
gi|89245151|gb|DY616938.1|DY616938 AC2591 NOLLY Medicago truncatula cDNA 5', mRNA sequence ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CTAGTTTCTCATATTTGTTTATACTTTGATCATTTTTATTTCTCTATTTCTAGTTGAAGCGTCACCGCTTCAAAGACCCTGTGTTACTGTCGCTGATTGTCCACCGGTAAAAGAACCTCTAAAGATGTGGTGTATTAGACAGACTTGTTTTTATGGTTTTGGAAAACGCCCCGATCTTTAAGTGAATAATAATATTATGTGTGCGTCATAATAGTAACACGATGCGCTCTTTTTTTTCTTCCTTTTGTATTATCCCACTAAGTTTTCTGCTAGCAAGGATTTTAACGACATTGTTGTCTGTAATATGTATCCCTTAGTAATATAATACTTCCTCCGTCCCAAATTGTATGTCATTTTAGGGAAAAAAATTTGACCTAAAGTATATGTCGTTTTACAATCCAATACAAGATTCATTTATCTTTTCATATAGTTAGTAAGCCCATCTGTAAACAAATATGAGAATTTATTTTTCCACTCTCGATGCATCTTGCACGTCCTTCAAATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA | |||||||||
gi|157980308|gb|EX528580.1|EX528580 MTGland_A043_2007-05-31/MTGlandA043_E06_020_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GGCTCNAAAGATTAAGTTATAATATATAAAGGGTTGGCTTGNTAAATGTGCAATGTGCATTCCGCAATGATGCTTTAGTGTATGGNANCTNCNAATCTTCATTTGATGCTNNCTATTACTATGAGCANGNGTATCTGTATNNGCAATAGTAACATGATNGNCGATATTTGTCTNNGTGTGAAACATTTNGGANAATATTTTTGTTTGATATNCACTCTAGAGAACCTTTAGTTGAGAAAAACTTCTTTTAAAGAAACTTCTTTGAGAATATTTTTGNGTGAAAATTCTTGAGTCATTTTATAACAATCTTATAATATGGTATATCACTTTGCAAGTTGTTTAAACCGTAAACATGGACCTATTCATATAAACGTATTATATGATGTGTAACTTATTTGCGTATGTTTTAACTGGTCAGACCCGTGCGACGCACGGGTCGATGGTCTAGTAACAATTAATGCTAGATAATTTGCGGGAAATATTAGGTTTAGTGGTAGCATGACCTAATAAGCAGTAAAGGATGAGGCAAAACCATTTCCNAAAATCTCTTACTCCTTAATCTTATTAGGTTGCAACAACTTAACCCTAGAAATTTGGCTCCAAAATTGCAGCATTAAATGCTAAATGAGATAACCCTAAAAAGTAAACACATCCTTCACTTATACTCCCTCCGTCCCAAATTGTATGACGTTTTGGTCATTTCACATGTATTAAGAAATGTAATTAATATTGTGTGGGGAAGAGAAATTATGAGTTGTTTACAAAATTATCCCTAATAAATGGNATGGAAAAGATAAATGAAATAATTGAAAGAAGAGAGAGTAATTAATAGTTAGGGATATAATAGGAAAAGTAACATTAATATTTCATTGGTATTGTAAAGCGACNNATAATTTGAGACNAATTTTTTTTCCAANGCGACNTACANTTAGAACGG | |||||||||
gi|148766664|gb|ES613358.1|ES613358 MTGland_B006_2007-04-04/MTGlandB006_F05_019_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CNNNNNNNNNNGNNTTACGGCCGGGNNNNTTCAATATCTCAATCCGACATCATTCGATCAATCCAAATGAATTAATGTTATTAATACTTACATTTAACAATTCAATATTTAATTTGAAGCTATGGAGAAAAATAATCAAAGAAAAATTTTAGAACAATTAAAACAAAAAAATTTAGTGTATTTTAGAGGGACTAAAAACATATTGAATCTGTTTTTTGATAGTGTATCATTTTCCATCATGCATTTTAATACTCCATCCGTCCCAAATTGTAAGACGTTTTGGCCATTTCGCACGTATTAAGAAATGTAATTAATATTGCGTGGGGAAGAGAAATTATGAGTTGTTTTACAAAATTATCCCTAATAAATGGTATGTAAAAGATAAATGAAATAATTGAAAGAAGAGAGAGTAATTAATAGTTAAGGATANAGTAGGAAAAGTAACATAAATATTTCATTGATATTGTAAAGCGACATATAATTTGGGACAAATATTTTTTCCAAAGCGACATACAATTTGGGACGGAGGGAGTAAGTTTTTGTAAGAAAAAATCACATTGATTAATAATGATGAAAGTTTGTTCTCCTTGAAAACCCANTGGATTGACGGTGATGACATTTTAATGTGAGGTTCAAACTCGAATCCTTACATTCCCCATTCTTGTGTGTATATGTTGGTCACTTGACCAATAGATTAAAAAACTAAAGAANGATATAATGAGAATAAATAATATAATTATAATACTTTAATTTTTTTTTTTATTCNAAAATTAATATGTAATGATACTATATAATGTGTCACTACCNNNA | |||||||||
gi|148765902|gb|ES612596.1|ES612596 MTGland_A022_2007-05-02/MTGlandA022_C09_038_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GNNNNNNNNNTNACGGCCGGGCACCTTCCCACTTAAATTTGACTTTGCAACATGCACCAGGGAGTTATCCTGTAGGTTAGTTCCACTTCCAATTCTAATGANGTTAACATCACCTATCCATAATGTTAAGTTCAAATATGATTGCCGGTTCGCCGCATGTAATTATTAAGTAGTATAGAGAGAGACTCACAGAGATTTCACATTTAATCTACTTTTCAAGTTCAGAAAAATGCAACTTCCCATGAAAACATTGTTTCAAAATATATAAGAAAGACACTTTATTGAAGTTGCACAAAATAGTTGTCTTTGTTTTACAATAAGCGTATCTCATATGAAAATTGATTTTGTTTAGTTAAACACCTTAATTTAGCATTTATAACTAGAAGTGCTTATGTATAAGCTATTTTTATAACAAAAGATAGAATAAAATGAAACTATTTTCATACAAATTACTTCCTCCGTCCCTAATTACAAGATTCTATAACACATATTTTCATATAATTCCGTTCTTATTTACAAGACCCTGTGACACATTTTACGCACATTAAAAAAGTATGTAGTATAATTAATGTATATGTTTTGTGAGTCACTATTACCAAATTTTAAAAAAAAAGGTAATGAACACATGATAATTTGAAAGGAGTCTTATAATTAGGGACAAAGTAAGTATAAGCTATTTTCATAAGTTGTCCTAGAGAGCATATGGAAATAAGCTGAAAACAGCTTATAAACATGTCATANNNTGNTTCTATAAGCACTTAAATTTTTTTATGTCNGTAGATAAACTCAAATAAACAAATCCAAACATACCCNTAAAGCATTACTACGACTACCNANAATTTGATNGNNAAAGCAT | |||||||||
gi|260527674|gb|GT142024.1|GT142024 METBY87TR JCVI-MT3 Medicago truncatula cDNA 3', mRNA sequence ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TCTTAGATGGAGTACAACATGATTGACAATCCTAATTTCGTTTGATTCAGACATACTCCCTCCGTTCCAAATTATAAGAAAAAAAAAAACTCATTTTCTTTGTCCCAAATTATAAGCAAAAAAAACCAACTTTTATCATATTTAATTACGTTGTTTCAAAAAATTATTTTTTCCAAAACCTAATCTCGCATTGAACATGTGACAATTAAAACCCTGCAACCATGTTTAAATATCTTCTTGTATTTACTTTCAACCTCTATGGAGACGATAACTTACAACTTAATTACTTGTTATGATTTGGTCCGCTTGCCGATTCAACCCATCAATATTCACCATGCTTTTTGGTTTATCTATCAATATTTTCTTGAATATGGTCAAAATAAAATTCATATATTTTGGAGACAAAATATGTCTATTTAACTTTAAATATCTTGTGCCCTTGTGAGCTTAGCTATGTTGGTAGGGACAATGTATAGTATATGCAAGGTCTGAGCTTCAAACCCCGGCCACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA | |||||||||
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gi|148765720|gb|ES612414.1|ES612414 MTGland_A020_2007-05-03/MTGlandA020_A03_016_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TNACGGCCGGGCCTTTGNNGGTGAGATTATTTTAGGTTTTATTTTGATCTCTTAAATTATTTCTATTCTATTTTGACCTATTAAATAACAAATGCCCAGTCATTGAGCTGTGTTTTATTAGGACTTCTCACTATCTATATTCTATATGAGGAAGTATTAATGGTAAGCTATAAAAATGAAGGATCATGTTCCTTAAAAACAAATGAAGGATCATTAAGGAACATGGTAGAAAATACTTGANATGATCGATAAGAATTCGCAATTGTTGGCAAATTGTAATCCTAATAAACCAATAATACTCTCTCCTTTTCTTTTTATAAAAGCATGTAACAAAAATCGTTGTTATTAAAAAATAATTAAATATGGTTTTTGTTCATATAAATATTTAAATTTTTTCGTTATAGTTTCTCTAAAAATATTATTTTTGGTCGTCAAAAAATATACATTCTCACTTTTAATGTATACTTTTGAGTCAACTAATATGTAATACTCTCTCCGTCCCATATTANATGACTTANTTGACTCCGACACACGTACCAATGCATATGTTTTATCTTTGATATCTTCAATTCTCTACTAAAAAAAATTATGAAAATTTAATATTTTAAAAATATTCATTAAGACGAATCTAACAACATCTTACATGATATTATTTATCTTTGTGAATTAGTAGAAAAATATGGTCAAAGTATGTTAAGTCAATAATGTATATCGTCAAATANGTCATCTATTGAAGGGACAGANAGAGTATTATCTAAAATTTTAAATGANTTTTATAANAANATTTANAATATTATAAGATAGCNNANAGTTTGTANGGCATCAAGTA | |||||||||
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gi|57567938|gb|CX540913.1|CX540913 s13dNF08A01GS005_465112 Germinating Seed Medicago truncatula cDNA, mRNA sequence ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GCCTCCTGCCGAATTCGGCACCAGGCTAAGTATATGTTTTGGGATTCAATTCATCCTACAGAGAAGGCATACCACAACCTCTTCTTGGCTTTCCAACCCACCATTGATTTCATTGTCAACAACTAGAATAATGAATGAGTTCCTTCATATATACTCTTTCCATCCCAAAATATAAGCAAAAATAAGTTAATATAAATTGATGTATTTGGTACAAATTTTGAACAAAATGTATTGACTTTTGCTGATTAATTTTTGGACGGAGGGAAT | |||||||||
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gi|9665568|gb|AL365815.1|AL365815 MtBA02E09R3 MtBA Medicago truncatula cDNA clone MtBA02E09 T7, mRNA sequence ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): ACATTGATGAAAAACATGGTGTCAGTGACAATGTATGCACCGTCTTTTAACACGCATTCTTTCTCAATGAATCAAAGGTTGTTGGTGCTTGATGAATTGAGTAGTAGTAAAAATGTTGTTGGAGAATCGACATCAACATACCAAGTTGAAGTGGCAATACCAAATTCACCCATTCTTGCACCTCCGGGATATTATTTACTATTTGTGGTCCATCAAGAAGTTCCAAGTCAGGGTGTTTGGGTCCAACTACTCTAATTTTCAACTACATTATGTATTATTATAGTTTATATCCTTGTTCTTCTTTCTCTAAAATATTTATTGGTGTAATTTAAATGTAAGTGAACATATTTCTATTGTAGATGAGCATTGAATTCAGTTGGAAAAATAAAATTCAGAAAGTAATGTATAGGAGGGTTTGTAATTTTACACGAAGAGAGGGGTTGGTCATTATTGATTACCGCTATGGTATTTTTTTTAATAAAACAAACTACCTCCGTCCCAAAAAAAAAAAAAAAA | |||||||||
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gi|20293392|gb|BQ156333.1|BQ156333 NF091F08IR1F1075 Irradiated Medicago truncatula cDNA clone NF091F08IR 5', mRNA sequence ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TTGTCTAGATGCATATTACCAGAAAAAAGGCCGTATCAAAGTGTTCATGGGGTAGCAAGCCTACTCCTCCAGGAACAGCCTCTACTCCTCTTCCACCACCAGCTTCTACGCATGTACCAGTGCCAGGGTTTTCACCTGCCGGTCTTGCATTGTATGAACGCCAGTTGGCTTTGAGCAAAATGAATGAGGCACATGCCGTAAAGCGGGCAGCCATGGGAATGGGTGCTCTTGGGGCTGGGTATGGGGCAGGATTCCCTAATGTTGCCACCACCCAGCACCTAATGTACTACCAGTAAAATATCCAATCCCCTATGACAAAGGATGTGTTTGTTTATTATAAGTTTATTGAGCCGCTAGAATGGTTCTACAATACTGCATGTTAATTTCTTCCACCCTCCCTTTGTTGTACTCTATTCTAACTTTTATCCTTATAAATCTTTTCCTTTTGCACCTTTTGTAGTTTCTTTATGCTTTGTTTATGCTTAACACATTTGTATTACTATATTTAAATAAATGACGAGAAAAAAAAACAAAATTCAACGAGCTACCGGGGGCTAAACCAAATACTCCCTCCGTCCCAAATTGTATGTCACTTTAAAAAAAATATTTGTCCCAAAT | |||||||||
gi|151386078|gb|EV255956.1|EV255956 MTYCQ87TF JCVI-MT1 Medicago truncatula cDNA 5', mRNA sequence ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GAGTCTCAGTCTCAGGCAGCATCATCTTCGTCTCTCTTCCACTTCTTCTTCTTCAAACCTAGGAGCATCATCGTCTATGGCGGAGGCAGACTGGTCTCAACTCCCAAAGGATCTACTCACTCTGATATCGCAACGAATTGACACCGAAATCGATCTCATTCGATTTCGATCCATTTGTTCCAATTGGCGTTCTTCCTCCATCCCAAATCACCATAACATCTTACCCTTCAAATTCCCACTCCTCAAATGTGAAGATAATTCCATCAAATACAACGACAACGAGATCATTGATTCCATCAACAACACCGACTCTCTATTCTGCTACCTTTCCAAACGCAGTATCTTCCTCGTCAAACCACCACCATCACAACTAGAGGAAAAACAAACCCTAATTCCTCGTCGTCCTTGGTTGATTAGATTTACTCAAAACTCACATGGCAAAACCAAACTCTTTCACCCACTCATCAAATATCCCCGACCACAACAAGAAGAAACACTTGCTCATCCTCGTGTGTTTGACTTCAACAAACTCTCCGTTCTTCACTTAGGAACCGATTTCATCCTCGACAAAGTCAACTTCACATCCCGAAATCGACATGGTATCTACATGCTTCCTAAAACGGTCCTTGCTGTCACGTGCCATGGGAAGGACCCTCTCATACTCGGCTCATTGGGTTATTGTTCCTATCGGCCGCTGCTTTTCCGTGACCGCGATGAACATTGGAAACCGATCCCCAAATGTCATCTCTC | |||||||||
gi|148766296|gb|ES612990.1|ES612990 MTGland_B002_2007-02-20/MTGlandB002_B07_031_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TTACNGCCGGGGNNTGTATCAATATCCATCATAGGGACTGTATCTGTAGATAGTTAAGTTCAAAGTTTTTACCTGTTTGAAAACTAGCTATCATAGTGCTACAACAACCTAGCATCTTATTGGGTCATCACATTAATTAGGCTAAGAGAATTTTACACATCTATACCCAAAACATTAATGCATTATTTATACTACCTCCGTCCCTAATTATAGCACTTTTTTAAAAAAATAACGGGAATTAAGATAGTGGATATTTGTATTAAATATGTTTGTAATTACTATTGTTCTTACAATTTTGTCCTTWAAGAGAGAGGGTTGGTTTATGTTTTCAACATGTTATTTATTGGTGATTGAAGAAAAATATGTATAATAAATAGGGACATGTATGTAAAGAAATAATTAATGTANCTGAAAATAACAAAGGGGTCTTATAAAAATAAAAAATTCCATCCCCGTGAGCTTAGCTCAGTTGGTAGGGATATCGCATTTTATATGCAGGGGCCGAGGTTCGAACCCCGGACATTCCACTTCTCCGCAATTAAATTGTGTGAGCTCTAGCCACTAGGCTACTTGACT | |||||||||
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gi|13595138|gb|BG580074.1|BG580074 EST481796 GVN Medicago truncatula cDNA clone pGVN-36L23 5' end, mRNA sequence ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GAAACGGCGGCTAAGCATGAAATGGGTCACCTTTTAGGGCTTGCACACAGTACTGACCAAAATTCAGCTATGTATCCCTATTGGGCAGGTGTAAGGAGAAATCTAAACCAAGATGATGTGGATGGAATCACGGCTCTTTATGTGCTTCATCGTTAACTAGAAATAGAAACTAAAATCTTTGTTCCACACTTAATTAAGTTATGGGAAAGGGTTGTTATATACTTCCTCCGTCCCAATATATAAGCAAAAATTAGTTAACATAAACTGATGTATTTGATACAATTTTTGAACTAAATACATTAACTCTTGTTGACCAATTTTTTGAAAGTTGGTTGCT | |||||||||
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gi|148765344|gb|ES612038.1|ES612038 MTGland_A015_2007-05-02/MTGlandA015_B05_023_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GNNTTACGGCCGGGGTAGTTTATTAGATAACACTTTTTTTTCTTCAAGGAAGTTTAGATAACTGATTATAAATTTAACTCATAAAAAATTCATTTATCGAAACTCATAAAAACTCCTCCATAATCAAGTTTGCTAACCGGGTCTTAATTTTCTCCATGTTTTTTCACTCAAGCTCTGTCATAATGGCCAATGCCTCCAAAGGAAGTGAACATATGGAATCAAATTTGCTTCATTTATCTGTTACTCCCTCCATCTAAATTATAAACAAGAAAAACTCATTTTCTTTATCCCAAATTTTAAGTTAAAAAGACTAACTTTTATCATATTTAGTTAAGTTTTTTCAAAAAATCATCTTTTTGAANAAGAAATTTAATGCAATTTACATTCATTATACTCTCTCTTTCATTTTCTTTATAATAACTAATAACCAATAAAAATTGTTTACACTTATTTCTGTGAAACTTATTCCAAGGATAACACAAGAAACTATACTATAAACTACTAGTACAATACTCCCTCCGTCCTAAATTGTATGTCACTTTAGAAAAAATATTTGTCCCAAATTGTATGTCACTTTGCAATACCAATGAAACATTAATTTTACTTTTCCTATTATATCTTTAACTATTATTATTTTTTTTCCTTCAAAAAAAACTATTATTATTTTTTCTTCTTTTAATTCTTTCATTTATTTTTCCCATATCATTTATTAANGACAATTTTGTAAAATAACTCATAATATCTTTTTTCTACACNATATTAATTACATTTCTTAANATGTGTGAAATGTCCAAAACATCNTACAATTTGGAACANANAGATTATTTTANTTTNNTTATTT | |||||||||
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gi|260523897|gb|GT144533.1|GT144533 METCT03TR JCVI-MT3 Medicago truncatula cDNA 3', mRNA sequence ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): AGAAGATGGAAGACTCCACTTTGATGGAGACGAAAACTGGACCAACAATCCCACAAGTCTTGAGGATAACTTTGGTCTTCATGCTGGATTGTTGGGGAAGGAATCTAATCCCTTCCAAAGACCAACGGCTACGACAAAACAATTTGATTTGGAAACTGTGGCTTTGCATGAAATGGGTCACCTTTAGGGCTTGCACACAGTACTGACCAAAATTCAGCTATGTATCCCTATTGGGCAGGTGTAAGGAGAAATCTAAACCAAGATGATGTGGATGGAATCACGGCTCTTTATGTGCTTCATCGTTAACTAGAAATAGAAACTAAAATCTTTGTTCCACACTTAATTAAGTTATGGGAAAGGGTTGTTATATACTTCCTCCGTCCCAATATATAAGCAAAAATTAGTTAACATAAATTGATGTATTTGATACAATTTTTGAACTAAATACATTAACTTTTGTTGACCAATTTTTTGAAAGTTGGTTGCTAACTTGGTCGAAAGTTGGCGTGAATTAGATGTGTAATTATAGATAAGACACTACACTCTAATGGTTATGAGCACGATTGAGATGAGTGATTGTCTAGCTTATATTTTATAGAAGCACTAAAAAAAATCAAAGTAGTATAAATACATTTTAAAACTATGGAACATTTGAAAAATAAGAAAAAAAACATTTTAATGAGTATAAAAAAAAAAAAAAAAAA | |||||||||
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gi|9672056|gb|AL372303.1|AL372303 MtBA50A07R1 MtBA Medicago truncatula cDNA clone MtBA50A07 T7, mRNA sequence ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GTGTTGATGAAATTAAGACAAAACTTGATGCTGCTAACAAAGCCGTGTCAAAGATTGGTCAGCATATGTCAGGTGGGTCAAGTGGAGGTTCCTCTGATGGAGGTTCTCCAGGTGGTGGTGATCAGGCTCCAGAGGCAGAGTATGAAGAGGTCAAGAAGTGAGACAACTTAGGCGTTGCTTTGTAGCATTTTTCTTCTTACTAATCATCACATAATTGCTGGAAGCATACAAGGTTGCTTATTTTTTGTATTTTTTAGTAGAAGGCTCCTTATTTTGTCGTACTGTTTGAGTACTGAAAACAGCTGTTCGAATAACATCATTAAAATTTGTGCGTACGAAGTTATCTACTCCCTCCGTTCCAAATTGTATGTCGCTTTAGGGAAAAAATTTGTCCTAAATTGTACGTCGCTTTACAATACCAATGCAACTTTAATGTTACTTTTTCTATTATACCCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCGAGGGGGGGCCCGGTACGC | |||||||||
gi|13598799|gb|BG583735.1|BG583735 EST485488 GVN Medicago truncatula cDNA clone pGVN-74G18 5' end, mRNA sequence ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GAGGAAAGTATGGCTAAAACTTTAATGTTTATTTATATTGTGATTCTCCTTACTTGTGTACTTGCTGTTATTGACATCAATGCATTTTCTTTTCCATGCAAGACTAACTCTGATTGTCCATCTTATTTATGCCACTATCCTAAAAATCCAGAGTGCGTTGAACGTGAATGCATATGTTGGTAACCATTACAGTCAAGTTTGATATTCCCTCCGTCCGAAAATACTTTGGATGGAGATTGCTCCAAGATAAACTACCAATGTGTGTAGAGTTTTGGAATAGAGGGGTTTTCTGTGATGTGCATCAACAATGTTTTGTGATGTGTTTTAGCAAAAGTCGAATATGTCAAACAATTGTTCACAAGCTGCATAAAGAAGTTGGAATTTGGTTGGGTTGGAATGCACTAGGTTGGGGATATGAAAGAAAGTGTCTCATTTGATTTGGTTAACAGTGGCGTGGTGAAGTTAATTTATTTCTAGGGACGTTACTTAGAAACAAAAACATTGTATTCTCACATTGATGGAATAATTCACTCTCTTGCTTTCGATGTGT | |||||||||
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gi|157979559|gb|EX527831.1|EX527831 MTGland_A033_2007-06-18/MTGlandA033_G01_002_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med ATTTGGGACGGAGGGAGTATG EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CACGTGGCAGAAGTTGCACAGTCNGCNACNGCCACNTGGCANAACCCATGCCATATCATCAAAAATGTGGGGCCAGGGNCATTTTTCNAACNAAAAAGTTTTTNCNGGGANGTTTTTNNAACATTTTTTTTTNCNGGGACNAAAATNAAAACNGACCCNAATTACNAGGATGAAAATCATATTTAAACCTAAAATATATTATTTTTAGATGCTTTACCTAAAACATTAATCTAGAATCGTGATGATTCTGCATAAAGATTGAAAAATACTCCCTCCGTCCCTAAATAAATGACCTAGTTGACTCTGACACACATATCAATGCATATGTTTTATCTTTGATATCTTCAATTCTCTACTAAAAAAAATTATAAAATTTAATATTTTAAAAATACTCATCGAGACGAATCCAACAACATCTTACATGATATTATTTATCTTTGTGAATTAGTATAAAAGTATAGTCAAAGTATGTCAAGTCAATTATGTATATTGTCAACTGGGTCATTTATTTAGGGACGGAGGGAGTATGTTTTATGAAAATAACCAAGTTTTTAGACGTGTGTTTTTGTCCTANGTCATCCAAAAATAGAAAATCGTTGCACGGAACGAAGTTGACAAAGACAATGATGAACAAAACAAATTTTAGAATGTTGATTATCTCGAGAAGAGTATTATATGAATTATGTCACATTTACATAACACCACCATTTTTATTATCAATGACCGGTCTCCCTAACCGTCACCTCCTTCTCCACCAACGTAAAAGTCTATAACATTTTCACGACCGCCCCTTATCAATATCAGTCCCCTTTCCATCATCNNGGGGTTCTATGTCGGTTGCACCACCACCTTTTCCGTANCTGGAAATNGGNTTGACATATCCAGCACCACCCCATGTTCTACCGCCGCCAACCTTTCCACCACCNNCGCCTTTCCA | |||||||||