mature miRNA: CACTTCAGATTGATGGTGTGT species: Medicago truncatula database: miRNEST The numbers on the right side of the alignments show a score calculated for them. When calculating the score, a mismatch is given a score of 1, bulge: 2, and wobble: 0.5. |
Predicted miRNA targets | |||||||||
gi|148764725|gb|ES611419.1|ES611419 MTGland_A007_2007-04-03/MTGlandA007_D02_005_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TTACNGCCGGGGNNNCTGNTAATGAAGCACCGACCCATACACGGACATGTTCACACCGATAGTAATTTGAGAAAATGACGGAATTGGCTGTAATCACACGCGTCACTGTCGGACACAGATGTGCGCCATAAACCAAACACACCTTCCATCAAAAATATCGGTGCTACGATCGGTGCTATGACACCGTACACGTCTTCAATTTGAGGTGTTGTTACATAAAAGCCAACACCATATTCATGATAATTTTAATTCCAATTACAGCACAAAGACTTATTTTGAATACAATTATTGAGTTTTTAAGCTTTTAGGGTTCAGACAAGTGAAGCAAAAAACTGAAAGGGGGAAAAAAGTTTAAAAAACCTTTATTGGTTGAAAAGCTCAAAACTTGAGATGTGCCCAAAACTCCATTTTTGGAACAAAAGCGCTGCAAACAAAAGGGTCAATAAATCACTCGTTGTTCATAAAATAAGTAACCAAATTTAAAAATAAATAAATAAATAAAATGTACTACCGTTGGAAGGTGATGGTGGAAGAAAGAGCGATTAAGGAAAAAGGTACTTCGGAGAAGCCTCGCCATGGAATAGAAGCACAAAAATGGTTTCTTTATTTTGCTATTTGATTTGGTTGAAGTTGCATGGAGACATGTACCACGAATTTGAGTTTACTGGTCATTANNGTTTAACATTTATTTTCCCTCCATTTTTATTTTTCATTCTCGANGTCATTTTGTGTCNGGATATTTTTCATTCTAGTCCCNCNAAAAAAANACTTGANNGGNTTTANTGCATTGANAAATATTATTTANC | |||||||||
gi|89245912|gb|DY617699.1|DY617699 AC3851 NOLLY Medicago truncatula cDNA 5', mRNA sequence CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GCAACTTCTCAAAGGAAGACAACACCATCTTTATGTTTATTATTACATTCTACTGCAAGAAAATAACTATAACAATCTACGAAGCACAAACACAGGCACGGGACGCGCCTTCAATCTAAAGTGTCAGTGCTACATAGATAGAGTGATTGATACATAGCCATTAAGACTCCAAAAAGGAATCCATTGCCTTTTTGTGACTTGCCGGTTTGCCATGCTATAACAAAAGCTTCTGATCCTTTGGAGAAAAACTTTAGACCAGTTTATGGCAGATAACCTTGATATGGACGATGAATTTGATGACTTGGAATATGAATCCGAGCTTGATATAGATAGCAGTGGGGAGATAGTGTATGCCATGTACTAATTTGATCATTACCAGTACTTGAAATACAGCATGTTGAAAGGAGAGCATTCTTATTATTGGGCCTTATAGAGGAATATGTGGTGCCTGCATTTTCTGTAGATTGTAGTATGGATAATACAAAGAAGTGCATGTTAATTTTTATGTGTGCGTGCTTCTTGGAGGTTCCTACGTCTACATATTTACGATTATCGCCTTTGTAGAAGTGGGGTTGGATGTTTTCTTACATGCTGAAATGGTTGCTGGTTTAGGGAAGAAAATGATCGTTATACTTTACTCACTTCCTGGTGAATACTTGCTTAATATATTATATTTACATTTACATTAGGTGAAATCATATTTCATGTCGATACTTATATTATACACACCTACTCATGTAAACAGTAAATTTTATTAACACTTCCGTATTAGGGATGCATGTTTTAACACTTTTTTC | |||||||||
gi|157981862|gb|EX530134.1|EX530134 MtGland_A063_2007-07-13_1/MtGland_A063_D03_013_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): ACGGCCGGGGTCNNNTTGTGTTAGTCTGACACTTGGACACAACTTAAATCTGAAGTGTCTGCGCTATATAGCTCGTTTGTCTATGTATAGTTCAATATTTGTGGATTTAGAATAGAGTACACGTGTGTGTATGCTTGTATATCTGTCAATCTTGTCTTATGTAGAGGTGCCTCTTCACTTTATCATTTTCTTTTGTTATATATGTATATCTGTCAATCTTGTCTTAGTTTGATTTGTTTATGAAAAATTAACAATGAATTATTTCCAACAGAACGTTTGTGGAGTGAGAGACAATATACTTCAGGTAGGAATAGTAACTCAACTGCATTATCACGGTTGCNATACTTCAGATGTCTGTTGAATAGAAGAGGGGTTCCAGCTGCTCCTGTCACAAATTTTTATGCTAGAACTGCTCCTGATGGTCCAGGTTCATGCTTTGAGCAATGACTTTAGAATGCTTCTGCTGTCTAATAATTCTAGACAGTTGTTGAAAATATTTCTACTAAGCATGGCCGTCTAATGTTAGTGCTCTGGTGAATGGACTGTAATCATGTTATAATATAAGTTATTGTATTCAATAATAAGATTTCTTCATTTGTCTCTAACTAATTGCAAATTTAATGGACTTTGTGATGCTTAAGCTTATAGTACTCTATCATTCTATGTAGAAAGCTATTGGTAACATCATTTAATTGGAACCAAATATTGGTTTTCAAGACTTTTTTTCTTTCCNATTTTACTCTTCATTTAAACTTTTCTATTTANGATTTTATCAATCTTTACCTGATCAACAAATACCGGAGAAAGACATGGTTTTTGATAGAGCATTGTGACGTCGTTTGACATANTGAGATAAAGTTTGGTTGTTTATGTTGTTGTACCTAATCAAATAATTGAANTCNNTCNTACTTTNAAATTTNNANNACAANTTTNATCTNNTNCTANNTAANTTTTANTACANNNTAGTT | |||||||||
gi|148764824|gb|ES611518.1|ES611518 MTGland_A008_2007-04-03/MTGlandA008_E06_020_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CNNNNNNNNNNNNNNTTACGGCCGGGGCCTCTTATTCTTTTGTGGACCAATGTTTGAGAACAAAATTCATTTGCTCTGTCTTAGGATGGCTGGACACCATTACATCTTGCTGTTCAGACTCAGAGACCTGATATAGTGGAGCTTCTGCTGATTAAAGGCGCTGATCGGACATTAAAAAACAAGGTAATTGTCTATTGATTTCCTATATTAATCTATCAATGTAATAGAACCTTGCGTGGTAGATAATGTGGGTTGAATATAGATGCTTTTAATGGGTCATTGGTAAATATCAGTTGTCACTGATATTTAGCTATGAAGCACTGACNCAGACATTCAACGTTACACCGACACGTAGACATTGATAATAATTTANAAAATAGAAGTGATTGTATTGGTGTCATGTTGGACATCATACATGCATTCAATCTGAAGTGTTGGTGCTACACAAGTATTTANAAGATTTGTCCCGTCCTTAAGAACTGGTTATCTGATTTAAATGATAGGCTAAGAAATTGAGATACTTACTCGAGATTCTCTCTTTAAACAGGGACGTCTTAAAAGTTGTTAAAAACCATAGTCATTAAAAACCTATCAGTTGAAGAAAAACTTTCCGATTGTTATTTAGGAATCATTAGACTTTGCCAATCACTTGCTTCTTTGTTGAACTGTTACGAATCTAGTCACTAGTCCCATGCTTGGATCAAAAAATTAATAGTTTCATTAAAATATTGATCTTTAATAGACCGTGATGCATCGATTANCCNGNNTCAGTCCTTACCCANNAG | |||||||||
gi|157979967|gb|EX528239.1|EX528239 MTGland_A039_2007-06-29/MTGlandA039_B08_031_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CGGNNTTACGGCCGGGTTCTCNTTCATACTAGCTAATTGTTAAACTCTAAAAAAGACTAATTCTTTTTAAGATCTTCAAACAAAATAACCAAAGTATCACTAATGACTCATTATTTAGTTAATCCAACAATAAAACAGTAATTGTAGATTACCCAGATGCTTCATGGCCAAATATGCGAGGAAATATGGCCTGCATATAAAAACACCTTATGTTAGATGTTAGTTTCTTAATTCCATAAAATCTATGAAGTATTGACATAGACATCAGAGCGACAGTAACACCGAAACATTAACATCGATAATAATTTGAGAAAATTGAATGACCGAATGTAATAATATGTATTGTTGTCGTGTCGGTGACACACCTTTAATCTGAAGTGTCAGTGCTCCATAGTTAAACAAAATGTTGATTGGTATATACATTGTCTCAGATTAAAAAAGAAAATGATAATCTTATCCAATTACATCTCACAAACGACTAATTCTTGTATGATGACGGGACAATGTCTATATGAGCAACAAATTGGAAATTCATGACATTAAAAATAATAAAATAGGATGAAAAAAAAAGTAAAAAGGGCAGGATATGATGATATAATTTAATTTTGATACATTGTCAGCATATAAAATCTTACACTATTTATGTGTAACTTAAGATTTAAGAAATAGTTAAGATTAAAGTCCATATTCTTTTTTAACAATTTGACGATTATGATTGATTGACTGTAAAAAATCTTTGCATTGAAAGTGTATATCAATTAAATCTATAATGATTATGATAAAATAAGAAACTTACATGAGTTTCCCAAGCAGAAAGATCACTACGACAGAGAGAGGTGGAAACAACCTTAATCCTAATCTCNNATGGTTGAGGAGGACTGACTTCCACTTCCTCCNTCACCAATGCCTCTCCAGCTCCCCATGCTACTGCAGCTGTTTGTTTGTTTCATAAACNATGGACATAGTCATANTCNTACATACATACATACATACTTACNTATCAAANNNNATGGNANGANNNAA | |||||||||
gi|209565255|gb|GE349896.1|GE349896 MEUAH76TR JCVI-MT2 Medicago truncatula cDNA 3', mRNA sequence CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GACCAAAGTACTCAGAATTGAACCTCATCATGACTTGTTAATCTTAGCTTCAGATGGATTATGGGAAAAGGTTAGTAATCAAGAAGCAGTAGATATAGCACATCCTTATTGTGCAGGGAGCAATAGACAAGGATCCTTCCCAGCTTGTAAGAAACTTGTAGATTTATCTGTATCGCGAGGCTCTATCGACGATATAAGTGTTATGATCATCAAACTACAGAACTACGTTTGAAGTTTCATTAATACAAACACAGACGACTAACACGACACCAGTATAATTTAGTAAAATGAATGTAATTACATGTTCAGTGCCCGATATCAATGTATGTTGGACACCAGAGACGTCTTCAATCTGAAGTGTAGATGCTACATAAATTAGGATGATAGGATGCCTTCATTTCATTCTTTAACATTCTTCATTACAATTAGTCAGTAGATAGGGAATGTGATAATAGTTAACAGAAAGAAAGACGGTGCCCTAAAATAGAGTACCTAGATATTATTCTGTAAAAATAGCAGAAATTTGGTAAAATTTTGTAACCTATAGCTGAGGAGAGAATAGGATGTATAAAGTAACTTTTTTGTATAATGATCTTGATTTAATGATAAACATTTTTTTAGTACAAAAAAAAAAAAAAAAAA | |||||||||
gi|57493227|gb|CX524508.1|CX524508 s13dNF17G11AT086_448360 Aphid-Infected Shoots Medicago truncatula cDNA, mRNA sequence CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CAATATTGAAATATACATTCATATTTATTCATGTGATTACTACATAAACACGTCCTTAAAGTGACACTTTTGTCACAACACTGCTTTGCAATTTAAATTACATTAACTTGGGTAAAATTTAAAAAGCAACAATATAATTTTATAAGGCACTAGAAATCAATAGAACATATAAATTAACTAAAGAATACCACCACTTTTGGGGTATATGTACTTGAAGAAGAAAAAAAACACACACTTGATTTGTTTTAAAAGTTTCCTTTTATGAAACACTAATACCGACACATAGATTTGAACACTAAAGATTAAACATGCCTTCAATCTGAAGTATATGTGCTATCCAGATTTTCGTTAATTGGCTCTCCTGCATTGCTTCCTAATCTCCCCATTTGATCCGGTAAGAGGCTTGTTATTTCCCATCTTAATCATTGCAATAGCAAAATCAGATTCAAATGCATTTTGATTATTGCTATAAGATTTAACCAATGAATCGGTGGACCCTCCATTGAAAAGCTCTTGATCAGAATGAAGGAGTCCCTTTTTGTTGATGAGATTCTTGTAGTATAAGTTATCAAAATGGTTTG | |||||||||
gi|161108329|gb|EY475663.1|EY475663 METAI81TF JCVI-MT3 Medicago truncatula cDNA 5', mRNA sequence CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GATAGCATTTTTTGTAATTTGTTTGTTACATTGGTGGTGTGTAAAAATGGTAATAGGCTACTGAGGAACAGAGTTTCAGCTCAGCAAGCAAGGGAGAGGAAAAAGGCATACTTGAGTGACTTGGAAACAAGAGTCAATGACTTAGAGAAGAAGAATTCAGAGCTTAAAGAAAAACTTTCAACTTTGCAGAATGAAAATCAAATGCTGAGACAAATATTGAAGAACACAACAGCAAGCAGGAGAGGAAGCAATGGTGGTTCCAACACTGCTGAATGAAATTAATGACAATCAAAACTTAGAGTAAATTAAAAAAAAGTGAATAAAAAAAAAGAGATGTTAAAAATTAGTTTTGATGATTCTTTCTAGGTGTGCATTTGGAATTTCTTGAAGGATGAACGCAAAACATGTTTTATCCTAAAACACCCTGTGTTTTGATACGTGAAGCACTAACATGAAAACGGGACATGTGATTGACGACTTTGACACGCAGACGCTAGTGATGTGAAAAAACATAAGTATTTAATGTAATCTCATGTATCAGTGTTTTACTCTAGACGCATTCAATCTGAAGTGTTAGTGCTACAAATGTAAACTTTCTCCATTCGAATTTAGGTAGTATGGAGGTGAGTTGCTGTCGGTTTTTGTAATAATTTCATCAAGGAACCCATTTGTTGAGGATATAAAGGGTAACTGATGAACCATTTGTGAAGTTATATCATACTAATGAATT | |||||||||
gi|11928484|gb|BE319234.2|BE319234 NF015E11RT1F1083 Developing root Medicago truncatula cDNA clone NF015E11RT 5', mRNA sequence CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GTTGGATGTTGTTGGTTTTGTGGATTGGTTTATGTCTGTAAAGTTTTTTTTTTTTGTTAAAATTGATATGCTAATTCTTGTAACATGTAAATAGGATGTTAAAGAAATAGTAATAGATATGAAAACTGAAAATTTTGTTTAAGAAGTTTTGTGTCTATTGAAACTGCTATAATCTATTAGCTATATATGAAACACAGACACAGATTAATAATCACATGTATGTATTCAGTGTCAGACACTCACGTGTGTTGGACACCAGACACACCTTTAATCTGAAGTGTCGTAGATTCATAGATTGAAATCCTCTGATTGGCTAATTTGCCAATGATTTTAAAGAAATAACATTGAAGTGATGAGTGATATAGGAAGCCTC | |||||||||
gi|209561478|gb|GE344869.1|GE344869 MEUAH76TF JCVI-MT2 Medicago truncatula cDNA 5', mRNA sequence CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GGATCATTTCTCATTCAAACCAAAACCAAAAACAAAAGCTTCGGAATTCGCGGCACAGAACTTGGAAAAGAATGTGTTAGAAGAAGTAATCAGAAGAGATGAGAGTGATATTGAGGAAGCAGTGAAACATGGTTACCTCAAAACAGATTCAGATTTCTTAAAAGAAGATCTTAATGGTGGTTCTTGCTGTGTAACAGCATTAATTAGAAATGGCAACCTTGTTATGTCCAATGCCGGTGATTGTCGTGCTGTCATCAGCCATGGAGGTGCTGCTGAAGCCTTAACATCAGATCACAAACCTTCGAGGAAAGACGAAAAAGAACGGATTGAGACTCAGGGAGGATATGTCGATATGTGCCGCGGTGTTTGGAGAATCCAAGGATCTCTTGCTGTTTCAAGGAGCATTGGAGATAGACACATGAAACAATATGTGATAGCAGAACCTGAGACCAAAGTACTCAGAATTGAACCTCATCATGACTTGTTAATCTTAGCTTCAGATGGATTATGGGAAAAGGTTAGTAATCAAGAAGCAGTAGATATAGCACATCCTTATTGTGCAGGGAGCAATAGACAAGGATCCTTCCCAGCTTGTAAGAAACTTGTAGATTTATCTGTATCGCGAGGCTCTATCGACGATATAAGTGTTATGATCATCAAACTACAGAACTACGTTTGAAGTTTCATTAATACAAACACAGACGACTAACACGACACCAGTATAATTTAGTAAAATGAATGTAATTACATGTTCAGTGCCCGATATCAATGTATGTTGGACACCAGAGACGTCTTCAATCTGAAGTGTAGATGCTACATA | |||||||||
gi|27408955|gb|CA922025.1|CA922025 EST639743 MTUS Medicago truncatula cDNA clone MTUS-47G4, mRNA sequence CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TTGTATTAACATACATGATAGATGATAACAAAATGAAAGTACAGAAGGCCTTGATCTTTCATATGAAAGAAAAATACAAAAACATGTGACTAAATTCTTATAGGCAGTTTAGAGGGAGAACTTTGCCAAATTTTAGATTCAGATATTTCTCTGATTGATAAAGTATATCTAAATAGTTGCACAACTTGCACTCAATTTTTAACATAGACCAGTGCAAACCTCTGATTACCAATTAAGCATGTTTCAATAACTCCATCTTTCTTTACAGATCTATGAAGTGTCTCAATCTTCTATGTTGTGACAAACTAGGAAGCACTGACACGGAAACTGACACGTCGACACTGATAATAATTTGAAAAAGTGGAATAATTGAATGTAAACACATGTGTAAGTGTCAGTGTAGTGTGTCAATGTCAGACAGCAGACACACCTTCAATGTGAAGTGTCGGTGCTACATAGGTGGAAGAGAGCTACTGATTTGAAGAAAAACAACAAAAACAAAAAAAAAGAATATTGCAATACATAATTTAGAAAAGGGGACTTCATCTACCCTCGGACTTCACCAACTGTGAGAATACCCTACTCATAGAAACACCAGATAGATCATCAACGGTTGAAGCTTCAAATGGCACAGCAGAGGCAGAAGAAGAAACATTTGCGTCCTGGTTGAAATTGTTGACTTGTGGAGATAGTTCGCCAATCATATTTGTACTGTTTTCTTCAGGATCACCTTGAACCCACGGCCTCTTGAAAGTTGAAGAGCATATTCCAAATTTCCACAGACATCTCCC | |||||||||
gi|57492637|gb|CX523918.1|CX523918 s13dNF08E07AT051_447180 Aphid-Infected Shoots Medicago truncatula cDNA, mRNA sequence CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GCACGAGGCTAGTATTATTCATTCACTATTTTTTTTCGGCAAATACAAGATACTGGAGAAAAGAATACAAGACATTGAATTAAAGAACTGTATTGAAACTAAGAAATCAATAAAAGACTGGGGTCCTATGCGACACCAACACATACACAGACACCAACCCTACGCTCCAACACTAGTAATGAATTAAAAAATAAAAAGAATGAAAGTAATCACATGCGACGGTGCCCGGTGTCGGACACCGACACATTTTAGACACCAGACACATTCAATCTGAAGTGTCAGTGCTACGCAGCTTGTATCAATCTAATTTTGAAGAGTAGGATAATCATGTGATGGAGCAGCTGGTTGAGAATGATTTAGGACATCAGACAGAACAAGCAAGTTGAAAACTCCAGGTTTTGTCAACCAAGCAGTCAGCACTTCTCCAGGAGACACCAATCTTCCCAAATTATTCTCATAAATTCTGAAGGGGGAGCCCATGCCATTTAGGAGTGCTTCAACAGCCTTTTTTAAAGTTCCATCTCCAAGCACTTTACTGTGCTTTCCCCAGCCAGTTAAAATGTTGACAAAC | |||||||||
gi|13781660|gb|BG646548.1|BG646548 EST508167 HOGA Medicago truncatula cDNA clone pHOGA-9I15 5' end, mRNA sequence CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GGTTCTATTGAAGAATTTACGATTCTGTTGAAGTGTTTTTGAGTGCTTGACTAATTTTCATTCAACTGTACTACATGGCTGAGGAGGGTTACAGGGTTACTCTTAATGTTTATGATCTAAGCCAAGGACTTGCTCGACAGCTTTCAACGTCGTTTTTGGGGAAAGCTATTGAAGGGATATGGTGAGTGTTTTTTCCCCTTTGTTTTAGGTCCATGGTATAATGTTCATGATCTAATGGCTTAATTAGTTGTTTTATTTTAGAATTATGGATTAGATGGTTGTTTTATGTTTATGTTGTGTTGAATGAATGGAATTGACTTGGAACATTTGAACTATAAGGGACTGACACAGACACAGAGCACATACACAACACCGACACATTGGCATTGATAGTAACTTGAATAATGGAGGAAGTTGAATGTAACTGCATGTGTTAGTATCGTGAACATTGGCACGTGTCAGACACTGAACCCACCTTTAATCTGTAGTGTCGGTGCTAGATAGCTTTTAATTACTATAGGTTAATCATAGGTTTGTTTCTTTCGTCTGGTATCTTGAAGGTACATGCCAAAATCTTGGTTGTGCTATTTTTTGTTGGCATATTGAACAGGTGGTGTCAATGGAAAGATCGTAGAAGATAGTGGTATATTCACATTCTACTAATTATTTGACAAAATTTTGTACTAAATTGAGTATTGCGGGAGAATAGCAATTTGTTTAATTTCTATCAATATGATGGTTCTATAGTGTTAATACTATTTGATAACAATGATATTTGAAAGTTACA | |||||||||
gi|13782674|gb|BG647562.1|BG647562 EST509181 HOGA Medicago truncatula cDNA clone pHOGA-17A22 5' end, mRNA sequence CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CTTCCGGCTGCCACTGCCGTTGGGCAACTTCAGCATCATACTCTCGACTTACCATTGGTATCCCGGTACCCGCCACTTGGTACGGTGACCCCGAAGGAGACGGCAGTACTGGTAACAAAACCTCTCTCTTATTTGTTTTTCTTTTTCACAGCTATGTATGAAACACGAAAACGGACACCATTGACACAGATAAAATTTTGACAAAATGACATTATTCAATATGTTGGTGTCGGACGCGATGCGTGTCGGACAGCAGGACACACCTTCAATCAGAAGTGTCTGTGCAAGAGAGTGTAGCTCTAACACTTCTGATTAAAATCGTGTTTGGTATTAGACACAATTACAATTACATTCAATTATGCCATTTTTTAATAATAGTGAGTATGTTGGTGATTAATTATGATGAGAATGTGTGAATTAGGGGGAGCTTGTGGGTATGGAACATTGGTGGACGTGAAGCCATTGAGAGCGAGGGTAGGGGCAGTGGGACCAGTGCTGTTTATGAAAGGGGAAGGATGTGGTGCTTGCTATAAAAGTGAAGTGTTTAGACAATAGCATATGTTCAAGGAGAGCAGTTACTGTGAATATCACTGATGAGTGCCCTGGCTGCCCAACTGACACCACCCATTTTG | |||||||||
gi|11912857|gb|BF647727.1|BF647727 NF011B12EC1F1095 Elicited cell culture Medicago truncatula cDNA clone NF011B12EC 5', mRNA seq CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GTTGCATTGAGAGACAATCCAAAAGTTCTTTGTTCTTGAATTAGTTTTATGTTCATGGCTTGCTGCTTTAGTGCAAGGGTCAAAGTTGAAAATCCTACACATAATGAAAAATAGTTGCCAGAATATTGCATAAAAGTTAGTTCATGTTTCTATTATGACATGGACTGGTTTGAATTCAGAGGTTGTTGGAAGAGAAGAGGTTGTTTCGGGTGGTTTGAGCAACAAGGTATCCTCTTCAACTGTTCTGCTAACTTCAAGGACTGAGGGTGAGATATTACAATCCAACAATTTGAAGTGTTTCACATTCAATGAGGTAAAAACTGCGACAAGAAACTTTCATCCAAGTGGTGAACTCGATGAACGTGGATTTGGTAGGGTATTCAAGGGGTGGATCGATGAGCACATGCAAGCTCCTACGAAACCAGGTACTGGTTTTGTTGTTGCTGTGATGATGTTTAACAATGAAAGCAACCAGGAACATAGTGAATGGTTGGCAAAAATCAATTACCTTGGGCAGCTGCGTCATCCTAATCTCGTGAAACTGATTGGTTACTGCTTANANGGTTCCTATCGGATTTTAGTATATGAATTTGNGACCAAAGGAAATTTGGATAATCATTTGTTTANAAGCTTTTCTNACTTTCTACCACTCACTTGG | |||||||||
gi|20174838|gb|BQ122888.1|BQ122888 EST608452 GLSD Medicago truncatula cDNA clone pGLSD-30M14, mRNA sequence CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GTAGGTGAAAACTGATAGAATTGGTATATGATATCTGTTAAAACTAGTGGCTGCTGATTTGAAATATTGGTGTTAGGTTAGTTCGGCAACGGCGAAGTCTACCTGTGAAGCACCAACACGACACTGTCACGTAAACTCCAGTAATAATAATTTAAGAAAATTGAAGTGACTGAATGTCACCGTATGTATCTGTGTTGGACACCAGACACACTTTCAATCCGAAGTATTGGTGCTATATAAAACTCTATCCTGTCCCATGGGGACCTTTTGTCAATAACTGAATTATGAGCTTCTTAGACCTTTATGCTTTTCAGACAGAGTTGCATGTGCTGTGTTGTTCTGCTGTCTGAGAATAACCAAAGTGTTTGCATTGGGATAAGCACAGCCTGTTAGTTTTACACAACCTTTTACTGTATTTGTTGTCTATTTTCATTCACCAAAATGTTAAGAA | |||||||||
gi|27408825|gb|CA921895.1|CA921895 EST639613 MTUS Medicago truncatula cDNA clone MTUS-45G7, mRNA sequence CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CTTGGCATAACTTGAAGATAAAAATACAAGAATATGGTAGGCATACACATAATTTATTCACTATGAAGCACGGACACAGACACTTGACACGACACTTACATGATGACACCAATAATAATTTAAGAAAATGAAATAATTGAATGTACCCACATATGTTTGGATCGTGTCGAACACCAAACACACCTTCAATCTAAAGTGTCGGTGATACATAGTTTATTCGACACCAAAGCTAAGTCTTTGGTTAGATAAATAGCAAAAATTCAAAGAGAATGGTTTCAGATGGATATGCTGTTGGGAATTCCCTTACCAGTGAGTCCACCCTCCCTAGAATAATCAGAGGTATTGGGAAACAGAAGGGTATAAGGCAATTTCACTGGCCCATTTCTGTTCTTCAAACTTGGGTCCTTGTTCCTTTTCATGATATTATTCTCAATCTCCAGTAGCTTCTGTGAAAATCGCCTAAATGCTGCCAATGGTTCAGCGTCTGCAGTCCAATCAGGGTCTACTGTCTGTCCAAGATAAACCTCTTCAGTCGAATGCCTAGACAGAACTTCTATCAATGACACACCAAGAAGAGTTTGGAACTGAGCTGTGATTGTTTTTAAGAATGCTAATTCAGGATCTGACTCAAGCTCTTCATACTCTGGTGTACCTTGCTCAAGCATAAACCTACGACTAACCGTTGGACGATTTGGTAGGTAACCTGCATAAGGGTATTTGTCAAAGTTCACAGCTGCATGAAAAGCAGAAGCCACCCATATAATAATGGTTGCAGATTGTATGAGATCGATTCTTGTCTTCATTACT | |||||||||
gi|148765586|gb|ES612280.1|ES612280 MTGland_A018_2007-05-03/MTGlandA018_C07_030_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TTACGGCCGGGCTCTAACATTGGCTTCTGGCATTTACAATAGCAGTCAAGTAGCTTCTTCTATAAGGAAACCACTGAAGCCTAACACATAATCTCATCGCAGTTGAGTTTTCAGTTGCTATGAAGCACTAATAAAGACATGGACACCGAATACAACACCGGCACGTAGACATTTGGTAATAATTTGATAAACTAGAAGTGATTGCATGCAACTACATATGCCAGCGTTGTGCCAATGTCGGGCATTCATACACGTTTTCAATATGAAGTGTTGGCACTACATAGTTTAGTAGGAATCAACTCTTTAGACCATCTTTAGAAATTTTACTTGATTTATTGTGACGTGCAGTATATGCATAATCTGAAACAAGTCTTTTCTCACCATTAAATATGTTAAGATCAAGAGAGCTTCCATACTTGCAAGGACCATGTAGTAAAATATTAAATGTAACATCATTTGGAACCACTCCTAAATTAAGCATTACATCAAGCAAACATTTCAACATTTTTCTTCTGCAAAAACCATTCATTAGCTATGAAGCACGGGCTCCGACATGGACGGGCACAGACGCATCAACACGGCTGATTTTAAAATTATAGGACATTGACACTGATATATACATTTATTTATTATAGTTAAATAAATATGAACATCGTCTATAAAATATATAAATTGAGAGCTAATTTTTTTTTTTTTGATCTTAGCTAAAATATTATGTACATCCATCTACTANNNAAAAGTAATATTTCTCTTANTAAATATGACAATTTTTCATGTCATCCATCCNTCNACNANACCGAAAAGTNAAAACAAAGTTATAGAATTTAATGNCTTCANTCCCTTCATTNNNANT | |||||||||
gi|21905879|gb|BQ750474.1|BQ750474 EST633210 KVKC Medicago truncatula cDNA, mRNA sequence CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): ATATTGAAATCTACATTCATATTTATTCATGTGATTACTACCTAAACACGTCCTTAAAGTGACACTTTTGTCACAACACTGCTTTGCACTTTAAATTACATTAACTTGGGTAAAATTTAAAAAGCAACAATATAATTTTATAAGGCACTTGAAATCAATAGAACATATAAATTAACTAAAGAATACCACCACTTTTGGGGTATATGTACTTGAAGAAGAAAAAAAACACACACTTGATTTGTTTTAAAAGTTTCCTTTTATGAAACACTAATACCGACACATAGATTTGAACACTAAAGATTAAACATGCCTTCAATCTGAAGTATATGTGCTATCCATATTTTCGTTAATTGGCTCTCCTGCATTGCTTCCTAATCTCCCCATTTGATCCGGTTAGAGGCTTGTTATTTCCCATCTTAATCAT | |||||||||
gi|27407716|gb|CA920786.1|CA920786 EST638504 MTUS Medicago truncatula cDNA clone MTUS-32E12, mRNA sequence CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CTTCCCATCCAGTACAACACAAATTGAAGCAAAAAAATAAAGCACTGACATCATCATCCAAAATCCAACCTTAAACATGTCTAACTAATGAAATGCCATATGTCCAGTTATGGGTGTGAATTGAGAGGTTGTGTCAATAGAGGCTAGCGAAAAACAAGCAAGCAAAACTACAACCATCTGACGAACACAAGCTCCATTTGGCAAAGGAAAGGTACAGACCCTCTCTCCCACACACACCATAGTTCAAAATTCAGGTCATAGGTAGTTTATCGCCGTCGTCTTCTGAAAAATTGTCAATTTGATCGTCGTCGCTTTCTGACATGTTGTCAATTTGAAGTGGCCCCTTAATACCGCCATTATTACCACCAAAAAGTTCCCTCTGTGCTTTCTCCAGAAACTCCTGAGCAGCAGCTTGAACAGAAATAGATGGCTTTTCAGAAGATTGATACTTTCTCTTTTGACCAGCCTGCTCCTGATGTTTCCTCTTCTTTCCCTCCCCTCTACTTAAGTTCCTCATTTTCTGCAGTTGCTCTGGAGTGAGGTCAGGCAGAGAGTGTTCGATGAAGCGAGTAGCTGCTTGAGAATTCAACATAGTAGAAGGTCGCAACGGAGCCTTATTCAAATCTAGAAGGCGTTCAAGTTTGTCTTGATATAACTCTACTCTATCAAGCTCTGATTTGACAGGGTTATCATCAGGTTGAACTCCACTACACCTCAATTTCAGTGTGAGGAAGGTGGAAGTGATCTTGGGAGAGAGAAG | |||||||||
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gi|8172208|gb|AW980669.1|AW980669 EST391822 GVN Medicago truncatula cDNA clone pGVN-55F23, mRNA sequence CACTTCAGATTGATGGTGTGT EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GCGGACACCAAACACACCTTCAATCTCAAGTATCAATGCTACATAGAGTCCGATGCACAGATAAAATAGGAGGGTTGTTTAGTTCTTAAACAGTGAAAGTAAATTTTGTCAAATCTTTATGATAGACTATAGATTATAACTTGGTTATAACTTATAAGTTTGTGTAGTTGAGTTCAGGATCCACATTTATCACATGTTTGCTAGAGCAATGAAAGATCACGTACTTCAGAATTTGGATATGTATGTTGTTAACTCTAGACTACAAGTGAGTGAGGCAACACCATGACTTGTCATTGCAGGTAACAGTTGGACGCAAGCCTGTGACCGGACTAAGGCTGAGCCTAGAAGGGAACAAACAGAACCGACTCGCAATTCATTTGCAGCATTTAGTCTCACTCCCGAAAAACCTCCAACCTCATTGGGATGCACACATGGCCATAGGTGCTCCCAAATGGCAAGGTCCAGAGGAGCAAGACAGCCGTTGGTTTGAACCGATCAAATGGAAGAACTTCTCCCACGTAAGCACTGCGCCAATTGAGATAACTGAAACTAACATCGGAGACCTCTCTGGTGTTCATATTGTCACTGGTGCTCAACTCGGCGTTTGGGACTTTGGTGCCAAAAATGTATTACACCTCAGACTACTTTTCTCTAAAGTACCAGGGTGCACGATAAGACGGTCAGTGTGGGATCATAACCC |