miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse




mature miRNA: CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
species: Medicago truncatula
database: miRNEST
The numbers on the right side of the alignments show a score calculated for them.
When calculating the score, a mismatch is given a score of 1, bulge: 2, and wobble: 0.5.

Predicted miRNA targets
gi|157979645|gb|EX527917.1|EX527917 MTGland_A034_2007-05-23/MTGlandA034_G10_034_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
|||||.||||||||||| |
GGAGCTATCAATTGACGTCAG

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
TNACGGCCGGGCTAGTAATTTACTAAAATGCCCCTCAGCTGTTAATTGCTGAATTATGGAACCGACTGCAGTTAACTATCGAGGAAAACTTCGGCGGTAAACTACTGAGGAAAACTGAAAATTTCGGCAGTTAACTGCCGAGCAAACCTCAAACCTTATTTATTTTTTATTTTTTTGATAAAAACCATAAATTTTCAACGACAATTCTCAACGTTTTATGCATACATGTGTGCGAAACTTAAYCATTGACTTTTCTGCCTAATTAAACATTTTTTAATATATAAACAAAAGCGTTTTGCTTACCAATGTTTTTTATGCGCAATTAAACCTTTTCTTATATCACCAC



gi|148766488|gb|ES613182.1|ES613182 MTGland_B004_2007-02-18/MTGlandB004_D11_045_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
|||||||||||||||.|||
TAAGCCATCAATTGACGGCTC

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
ANTAAAAAAAAAANTTTTACAGGGGGAAATCGGAAATGACCTGTATTACAAGAGGTAAAACATCATTAACCCTTTTAAAAATGATGCAGCTTAATATTATCATAATATAAAATCTAAGAAAACTCACATAGTTATCCATTAAAATCAAATGGATGGTCAATAGATTCTGAAAATTATTGTTGACACATATGCAAAGGCTGAGAAACACGAGTAAATTAGCAAATATCCCTCGGCAGTTAACTACCGAATTCTGAAGAAACCGGCTGCAGTTAACTGCCNATGATCTGTTANAAGAACTCANATTTGTANCANAANAATGTGGCATGCCACATGTGTAATAACTAATTTAAAAATATTAAAAAAAGTCATGCGTTTAATAGCTGAATAAAAAAATTAAAAAAAAGAAGAAAAAAATAAGAAAGGCACGTGAGGTTCATGACAAACCCAACAAATTCATTAACCCCTTCTCATTCATCTTCTTAACCTACCAATTTCATCATACCTAGCAACTTCATTAAAGGAAAAAAAAATTCCCAAAATTTTGTATTTGCTATATGTCAAAGATCTTTCCTCGTCTTATCAATATCACCATCCG



gi|27407768|gb|CA920838.1|CA920838 EST638556 MTUS Medicago truncatula cDNA clone MTUS-32A3, mRNA sequence

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
||| |||||||| ||| |||.
GGACCCATCAATAGACTACTT

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
TAAAATGCGATTCAATCACAGGACGTGCTATATTTAGAAAAATTCGAGAGTATTTGATCTTTAAAGTTATCTTGCTATATAAGAAAATCTGTATTGATGTTCATCAGATAACTACCCAGGATCATCATCCAATAAGCACAACAAAAATGACTGGGGACATAAGAGAATAGCTAGCACAGGTAGCAGTTGGAGACAAACCAGAAGCCCCGTATTATTTGAATGTGACAATTAACCAGTTGTCGCATCAACCAACCTAACATGATTAGTCATTTCTCCTTCTTATTGCCACCTGTAGAGTTCTGCTCAGTAAGCATTTTCAAAACGTTTACCAATGCTTGCAAACGATCCCATATGCTAAGACCATATAGCGCTTCAACAAGTGACTCCTGAAATTCAAATCCATTTTCTGCCGCAGGATACTGAATAGGCTTTGGTATCTTGGTCTTAATGAATGGCCACCATCTATCTTCGACTACTGACTTTACAAGGCAGCATGCTC



gi|148766775|gb|ES613469.1|ES613469 MTGland_B008_2007-05-03/MTGlandB08_D09_037_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Medi

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
||||.|.||||||||.|.|||
GGAGTCGTCAATTGATGGCTC

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
CNNCNTTACGGCCGGGTAATATGAACAGAGAAACGGTTTCTAACAAAGATTTGAAACCCACTATTTTCTACTCTATGAACATCAACATTGAAGGTTTCTAACAAAGTTTTTGGTGAAATGGTTTGTGAAAACGATGGAGTTGGAGTGTTTTGAATTGTTGGTGAAAAGGGTATCANGAGAACAGAGATAACTGTGTGATAGTGATGATTTCATTTGCAATTACAATTGCAATTTTAACCCANATGAATCCATTGAAACTTTGTGTATATGAATTTTTTTATCAATGATTTCGGATGTAATCTATGTTAACATAACAAGTGTCATTATTTAATTGTTTTTACCTATGGTGCTGATTATTTATACATTGAATACAAATGATGGTGCTTCAAACCTGCTATGATTTATATTTGTCTTTTCTTTCTAACGCTGCATCATGTTACATGTATGATGATGATGACTGGGTTTTAATTTCCTCGGTAGTTAACTGCTGAGGTTTTCCTCGGCAGTTAACTGCAGTCGGTTTTATTTTTCCTCGGCAGTTAACTGCAGAGGGGGTATTTTGGTATTTTACTGGTGTTTCTCANCCCTATAACATGTGTAAACAGCAATTCTCAAGAAGCAAATATCAAAATTTTCAAACACTGACATCCTCTCATCTTATTTGCATCAAAATCATAGTTTTAAAATCCGGATCGGTGATCGACTTGGTAANGGTACTGGTTCNCTANTTTAATGGNTGAACTATTGGGTCACTGGTCGAACCACGCNACTNAATAANATTTAAT



gi|157977871|gb|EX526143.1|EX526143 MTGland-A070_2007-08-17/MTGland-70_J08_012_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Medi

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
|||||..||||||||||.|||
GGAGCTGTCAATTGACGGCTC

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
TAAAATAACCAAAAAATGAACGGATTAAAATGCTCAATACCTGTTTTTTTTATGTCAAAAGTGTGTTGATACCTCCTATGCTTGATGCTTGAATGATTTTGGATTAAGAATTGATGAAAAAAATATTGGATTTTGGGATTGAATGGTGGTAGAAATGAAGTTGATGATGAAAATAGTGTGTAGGGGGAGCAGGTGGCTGTTTCATCTGATGAAACATTTCATCGGCAGTTAACTACCGAGGATTTCCTCGGCAATTAACTGCAGCCGGAATTCAAATTCCTCGGCAGTTAACTGTCGAGGGGGTAAAATCGTATTTTACTAGTGTGGCATATATAGCCTTATTAAATGTGGGAACATCA



gi|148766120|gb|ES612814.1|ES612814 MTGland_A025_2007-05-07/MTGlandA025_A04_016_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
||||||.||||||||. .||.
GGAGCCGTCAATTGATAGCTT

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
TTACGGCCGGGGGTCCCAGCATCGTTAATTATATTTTATTTTTTTCAAGATTTTATGTGTCTTTATCTCTCCAAATTGAAGAAATGGAGAAACACATAAATGGAGAGGATCCTAACCCCCTTATCTATTATTTAACTCCATTGCATTATTTGTTTGGAATCCGTCTATTTCAATATGATTTCTATCCTTATCTATTATTTAACTATGTTGGTTGTATCTTAGACCATTGCTGTTACACATTACATAAGGCTGTGCCATACNAGTACTTTACGAAAATGTCATTCGGCAGTTAACTGCCGAAGTTTTAGTAAACCGGCGAAAGTAAACTGCCGAGGAAAACTTCGATAGTTAACTGCANAGGAAAACTTCGATAGTTAACTGCCGAGGAAATCCCAAAGTTCCTTCGGCAGTTAACTGCCGACG



gi|30098354|gb|CB891187.1|CB891187 EST648156 KV3 Medicago truncatula cDNA clone KV3-49M24, mRNA sequence

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
||||||||.||||||| .||
GGAGCCATTAATTGACAGCTG

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
TGTCGGCACATTGGAAAAAGGTTGAAAACACTGGTAAAAGACGTAAATACCCCGTCGACAGTTAATTACCGAGGAAAACAACCGACGGCAGTTAACTACTGAGGAAAACTTCGACAGTAAATTACCGTCGATTCGATCCTGAGCATATGCAAAACAGAAGCATCAGTTTTCCCATTTCATCTTTTCTCCAAAACTTCTCAAAATTCACTCCAATTAAGTTTTGGACGAAATTCAACTTAATTATCTCCATTTTATCACAAGCGCTGAGAGAATATTATGAAGGCTACCTTGATTCTGCTACCAGATTGTCGGATCCACAGAATCTAGGGGATCCACAAGAGCTGGAAAAGATTAGGACTACTTGTGTGAAATGGTACCTCCTATATTTGGTTGGATGCTTGTTGTTTGGTGATAAAAGCAACAAACGCATTGAGTTGGTCTATCTGACGACCATGGAGGACGGCTACGCGGGGATGCGTAATCATTCTTGGGGAGGGATGACATTAGCATACCTATACCACTGTCTATCTGAGGTCTCTTTACCTGGAGGTGGAGCTCTTGAGCGAAGCGTGACACTGGTCACTGCTGGATGGTTTTTGTGTCACTTGCCGGAGCGGGGTCTGAGATAGTACGGCTATGTTCAGACCGTTCCCATACCTCCTACGACGATTGAGCCTCTTGAGCCAGCGGAGGTGGTTACGGCCTTCTTGGAGTTTGCTCTCCATGTCCAAAGCCAGCAAGAGAGGGGTGAGTCGGTCCCGGGAGACGAGGGGCATAAGCATTCAAAGGGGTACATGGAATGATTCTACCGTGTATCCCATCTTCTTATGA



gi|30098354|gb|CB891187.1|CB891187 EST648156 KV3 Medicago truncatula cDNA clone KV3-49M24, mRNA sequence

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
||||.||||||||||||.|
GGAGTCATCAATTGACGGCAG

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
TGTCGGCACATTGGAAAAAGGTTGAAAACACTGGTAAAAGACGTAAATACCCCGTCGACAGTTAATTACCGAGGAAAACAACCGACGGCAGTTAACTACTGAGGAAAACTTCGACAGTAAATTACCGTCGATTCGATCCTGAGCATATGCAAAACAGAAGCATCAGTTTTCCCATTTCATCTTTTCTCCAAAACTTCTCAAAATTCACTCCAATTAAGTTTTGGACGAAATTCAACTTAATTATCTCCATTTTATCACAAGCGCTGAGAGAATATTATGAAGGCTACCTTGATTCTGCTACCAGATTGTCGGATCCACAGAATCTAGGGGATCCACAAGAGCTGGAAAAGATTAGGACTACTTGTGTGAAATGGTACCTCCTATATTTGGTTGGATGCTTGTTGTTTGGTGATAAAAGCAACAAACGCATTGAGTTGGTCTATCTGACGACCATGGAGGACGGCTACGCGGGGATGCGTAATCATTCTTGGGGAGGGATGACATTAGCATACCTATACCACTGTCTATCTGAGGTCTCTTTACCTGGAGGTGGAGCTCTTGAGCGAAGCGTGACACTGGTCACTGCTGGATGGTTTTTGTGTCACTTGCCGGAGCGGGGTCTGAGATAGTACGGCTATGTTCAGACCGTTCCCATACCTCCTACGACGATTGAGCCTCTTGAGCCAGCGGAGGTGGTTACGGCCTTCTTGGAGTTTGCTCTCCATGTCCAAAGCCAGCAAGAGAGGGGTGAGTCGGTCCCGGGAGACGAGGGGCATAAGCATTCAAAGGGGTACATGGAATGATTCTACCGTGTATCCCATCTTCTTATGA



gi|157983151|gb|EX531423.1|EX531423 MTGland_B023_2007-05-15/MTGlandB023_D12_045_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
| |||||||||||||| .| |
GAAGCCATCAATTGACAGCGC

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
TTACGGCCGGGCNATAAAATCGAACAAAAACATGATCATGGACTGAGGACATGTAACCACTGACTTGGAAAAAGAAAGTTCAAACCANAAAGACATGACTATCTAGCTTTTAGTAGTAATATATAAAACCTTCTGATGATGATCATATAGAAAAATAATCTCACTCTATATTGCCATAGTAATGCTGAAATAATCTCAGTCTACATTACTAATTTATAAGTGCATATACAAATTAAAACTATTGATGCGGTGCTGAGTCTGTACTTACATAACAAAACATTGACATTTANGGGAARAAGATANCAGAAAAAACACCAGTATTGCTCCGCGGCAGTTAACTGCCGAAGTTCCGCGGTAGTTAACTATTGTCGGTTAACTTCCGCGACAGTTAACTACCGAAGGGGTATTTCCGTATTTTACTATGTGTTTCAGCTTAAACACATGTGTGAACAACGATTTTCTCAATGTCNTGGAGCTCAAGGGTGATTTTATAGAAGTCC



gi|27811071|gb|CB065493.1|CB065493 EST645174 HOGA Medicago truncatula cDNA clone HOGA-19I19, mRNA sequence

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
|||||| ||||||||||.|||
GGAGCCCTCAATTGACGGCTC

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
AAGAAACTAAAAACAATCATTCAAAAACTCATTCAAACATTTCATCGAACACTTGATGTGCACATTATACCCTAAAATTCATAAAAATAACCCTAAAATTATAAATCATATACTCTTACTAAAATAGAAAAATTAATCATATAACATAAACATCATGCAAATATTTTAACAACATTAATCAACTAACATATACCCTACAAATTAATTATAACATGTAAATCTACTAACAAATAATAAATGTACTCAAAAACTAAAAAATCAAAACATTTATAACAACTAAAATGTAAGTTAATAGCATTATAATTACTTACTTGTTATTTTGTTGAAAAAAGTTGGTTGGATTTGGGTGTGTTTTTTAGAGAGATTTTGAGAGAAATTTGAAGAAATTATTGAGATGGTAGATCTCCTGGATAATGGATGAGAGGAGATTCTGCCAGATTTTGTAGGGCAGGAGATCCTCGGCAGTTACTGCAGCCGGATTTTTCAAAATTTCGGCAGTTAACTGCCGAAGAAAACTACCGCACAAAACCTCGGCAGTTAACTCCCGAGGAAATTTTAACATCCAAAACTTCACAAAATTCTCAATTTCTCTCAAATCTCCGCCAAATCTTCTTTCACGAATTGCGAGCAAATCAACGGGACACTTATATTATATAGTAGTGTTCAGATTTGACTAGACAACTAAAACTTTGTCATTAGTAATAAAATACTACAACTACACTCTAGGATCAAAATAACGATCACATCTCATTGAAAATTGCTTATTATCAATACATGAAGTTTACAG



gi|157983868|gb|EX532140.1|EX532140 MTGland_B032_2007-06-24/MTGlandB032_F06_019_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
||||||.||||||||. .|||
GGAGCCGTCAATTGATAGCTC

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
CGGNNTTACGGCCGGGGGANGCACCAGCATCAGCAGGACCAGGACCAGTAGTGGTAGTTTGTTTTTTAGGACTTGTTTTTTAGTTTTGGTATTTTGATGACATTGATTTATATATTTGTATTTTGATGACATTACTTTTAATTTCATGGGTATTTTACTTTGTTTAATGGTATATAAAAATGTTGGTTTAATTAAGTTGTGCATTTGCGCCAATATTCGTTATGCATAAAAAAAAAAATAGGTGCATATGTTGTGTTTTGTGTTTGAAACACATTACAGATTCAGGAAATGAAGCTACTGTCTCTGTCTTGGCTTCAGGACACTTCGGCAGTTTACTGCCGAGGAAATCCTCGATAGTTAACTGCCGAGGAAATCCTCGGGAGTTAACTGCAGCCGGTTTTCTAAAATTTCGGCAGTTAACTGTCAAGGGACATTTAGGTAAATTACTCGTGTGTCTCAGCCAAATCAAATGTGTCAACAACAATTCTCTTGCTCTTTTCCTTTGTTTCACTTTAACTGCGAAAATAATCAATTAGTAAATTAACTAAAAGTACAATATAATTAGAGGCCGGTTCTAATAATAAAATTCTTTCATTACTTTTATTCAAGAAAAAATAAAAAAATATTTCATTACTGAAAATAAATAAGGGTTAATTAAGTAAATGGTCCCTAAATATTTATAATTTTGTTTTTAGTCCCTACAAAATAAAATCACACTTTTTAGTCCCGTGACATTTTCCTTTAACATTTTAGGGACCGAAAATGCTGACGTAAAATTTTTACAGGGACTAAAAATGTTGGTTGAAAATTTTATAANGATTAATAATGCTGACGAAATTTTTTTATAANGACTAAAAAGTGTGATTTTATTTTGTATGGATTAAAAATGAANTTTTGAATATTTATAANGACCAATTACTTAATTAACCCNNTAAATNATANAANTCNTTCAAAAAATCNTTCNAAGTTTTTTTTCNNNTAGTTNAGTANANANAGCTNANNNNTTNCNA



gi|157979720|gb|EX527992.1|EX527992 MTGland_A035_2007-06-15/MTGlandA035_G10_034_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
| |||||||||||||| .||
GAAGCCATCAATTGACAGCTA

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
TTACGGCCGGGGNNNNTGATCATGAACGTGGAAATTAATATAAGATAATGACACACTTACTATCATTAGACAACATTATTTCCTAGTTTTCTAATAAAACTTATCATAAAGTTTTGGTGGATTTTAAATGAAGCTTTACAAATATTAGTAACACCAAAAATGTAAGAAAATTGTTGTTCACACACATAAGAAGGCTGAAACACACATATAAAAGACCGAAGTACTCTTCAGCAGTAGCTGCCGTCAGTTTCACTATTCATCTGCAGTTAACTGCCGCCGGTTTTTTGAATTCCTCGATAGTTAAGTGTCGAGGCGCTGTTTCATTAGATGAAATAGCCACCTACTCCCCCTACTCACTGTTTCATCATCACATTTCTTTCCTCTTCCATCTAAACCCCCAAATCCAATATATTTTTCACCAAATCTTGCTCCAAAATCATTGAAGCATCAAGCATAGGAGGTATCAACACACTTTTGACGTAAAAAAAAAAAAAAACAGGTATTAAGCATTTTAATCGGTTTAATTGTAGCTATTTTTGGGGTTTTTTATGTCAGTTTACGTTAAAACACTGTCATGAGGACCTCGACAGTTAACTGCCGAATTATGGAGGCATCGACAGTTAACTACCGAAGGGATATTTTCGTCTTTTATATGTGTGTTTCAGCCTTATTAAATGTGTTAACAACAATTTTCAAAATGTAATTGGTGTTGAGTCTCTTAGCACCAAATATGGAATTAGTGTTGAGTCTCCTAATTGCTTGCAATTAAGTTCGATAGACATCTTACATAAACCCATATTGTCNAGCCATTTTATCACTTCCTTTCGTCACCTTATATAAATTTATTAATATATATCTGTTGGAGGCATAGTAGCTAGGTTTTACCTCTAAAATTGANTATTTAACGATAGTATTTGANGTTTATTCTTTCAAAAAAAAATTGNGAACATTTTTATCTATTTAATTGATTTTTAACCTTACATTTATTTCNTNACTCNCTGNATATAAATATNATNNNTTNNATTAATTCNNTNNNNTT



gi|157981328|gb|EX529600.1|EX529600 MTGland_A056_2007-07-11/MTGlandA056_D08_029_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
||||||||||| |||||.||.
GGAGCCATCAAATGACGGCTT

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
ACGGCCGGGGTGTTACNCGAACTTCGATACCTCTATTTATTTGTGTGAGAGTTTTCAACGACTCTTGTCATTTATGTGGAACTAGTTTCGAATTTTAGCTACTTTTTAGTTTGAGAATTGTTGTTGACACATTACCTTTGGCTGAGAAACACTAGTAATTTACCCAAATGCCCCTCGGCAGTTAACTGCCGAATTATGAAACCGGCTGCAGTTAACTGCCGAGGAAAACTTCGGCAGTAAACTACCGAGGAAAATTGAAAACTTCTGCAGTTAACTGACGAGGAAACCTCAAATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGACNAAAACCATAAATATTNTTTGANAATATTCCNCGGNCTTTATCATTTTTGATTGATTTTTCTTAATAATTCNTTTTTAATTTTATTGNTTTGCCNTCCTTATTTATTTTAATTGNATTACNCCTTTGATNTTTTTTTTTGNTGNTATAACTG



gi|57565991|gb|CX539246.1|CX539246 s13dNF62G10GS072_461752 Germinating Seed Medicago truncatula cDNA, mRNA sequence

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
||||..||||||||||.|||
AGAGCTGTCAATTGACGGCTC

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
GCTTCCTCCCTCCCTCCCTCATATATTTACTCTCCTCTACTTTTTATTTCTTTCTCCTTCCATAATCACTTGTTTATCTTTTATTTTCTACCTCTTGTTTTCATATCCTCGTCCTTAATTAACTCTATTAATATCTAGTTCTTTCTTTGTTAAGTTTTGGATCATTCTACTAAGGAAATTATCAAAACATGATATTTACAATTACAGTTATGGTTCAACTCATTTTATTATACTCAAATATAGTTCAGTTTATATTCTACTAAAATAATCAGAATTGTTGTTCCCACATTTAATAAGGTTGTGCCACACCAGTAAAATACGATTTTGCCCCCTCGGCAGTTAACTGTCGAGAAATTTGAAATCCGGCTGCAGTTAACTGCCAAGGAAAACCTCGGTAGTTAACTGCCGAGGTTAACTACCGAGAGAATGTTTCATCAGATGAAACAGTCACCTGCTCCCCCTACATACTATTTTCATCATCAACTTCATTTCCACCTCCATTCAATCCCAAAATCCAATAATTTTTTTTTATCAATTCTTGATCCAAAATCATTCAAGCATCAAGCATAGGAGGTATCAACACACTTTTGACGTAAA



gi|157981328|gb|EX529600.1|EX529600 MTGland_A056_2007-07-11/MTGlandA056_D08_029_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
||||||.|||||||||| |
GGAGCCGTCAATTGACGTCGG

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
ACGGCCGGGGTGTTACNCGAACTTCGATACCTCTATTTATTTGTGTGAGAGTTTTCAACGACTCTTGTCATTTATGTGGAACTAGTTTCGAATTTTAGCTACTTTTTAGTTTGAGAATTGTTGTTGACACATTACCTTTGGCTGAGAAACACTAGTAATTTACCCAAATGCCCCTCGGCAGTTAACTGCCGAATTATGAAACCGGCTGCAGTTAACTGCCGAGGAAAACTTCGGCAGTAAACTACCGAGGAAAATTGAAAACTTCTGCAGTTAACTGACGAGGAAACCTCAAATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTGACNAAAACCATAAATATTNTTTGANAATATTCCNCGGNCTTTATCATTTTTGATTGATTTTTCTTAATAATTCNTTTTTAATTTTATTGNTTTGCCNTCCTTATTTATTTTAATTGNATTACNCCTTTGATNTTTTTTTTTGNTGNTATAACTG



gi|148764599|gb|ES611293.1|ES611293 MTGland_A005_2007-02-17/MTGlandA005_H12_041_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
|||||.||||||||||.||.
AGAGCCGTCAATTGACGGCTT

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
ATNNGANNNTTNGCTTTTCNAACATACAAAACATCACGAGTATTGCTGTTTACNCATTTAATTTGGCTGANAAACACGAGTAAATTATTCAAATGTCTTTCGACAGTTAACTGCCGAAATTTAAAAGAACCGGCTGCAGTTAACTGCCAAGGAAAACTTCGGCAGTTAACTGCCGAGAAATTTCAAACCTAAAATTAAATAAGGAAATACACCTAAATTTTCCTTAATTAAATTTAATTCTTTAATCCTTTTAAGGAATTAAACATAATTATTTTTATGATTTCATTCATATGATTTTGTTGTCATAAATGAAGAAATATGATATATGAATAATATCTGCAATCGGTAATTAATGGACCTAAAATGATGATTCAATAAAAAAAATGCAACAACAAAAACGTTAGAAAGGATAGAATAATTATATTTGTAATTATTAGTAACTAATTTCATTGATGTCTTTCATTATTCATAGGTTTGACTAACCTATTATTACTTTATACTAATATTTCANATATTATTAATTTAATTAACATGAAAAACACAGCAACAACAACAAATAAAAATGTTTGTCATCGGTAATTAATAGACCTAAAATGGTGATTCAATAAAAAAAAATGCAACAAAAAAACATTATATATAAAAAGAACATTTAANTCCTCTAAAAACATTTCAATAAGTGTAAAAATTANGCATTTGNANATTGTTT



gi|57565991|gb|CX539246.1|CX539246 s13dNF62G10GS072_461752 Germinating Seed Medicago truncatula cDNA, mRNA sequence

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
||||||.||||||||.|.|||
GGAGCCGTCAATTGATGGCTC

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
GCTTCCTCCCTCCCTCCCTCATATATTTACTCTCCTCTACTTTTTATTTCTTTCTCCTTCCATAATCACTTGTTTATCTTTTATTTTCTACCTCTTGTTTTCATATCCTCGTCCTTAATTAACTCTATTAATATCTAGTTCTTTCTTTGTTAAGTTTTGGATCATTCTACTAAGGAAATTATCAAAACATGATATTTACAATTACAGTTATGGTTCAACTCATTTTATTATACTCAAATATAGTTCAGTTTATATTCTACTAAAATAATCAGAATTGTTGTTCCCACATTTAATAAGGTTGTGCCACACCAGTAAAATACGATTTTGCCCCCTCGGCAGTTAACTGTCGAGAAATTTGAAATCCGGCTGCAGTTAACTGCCAAGGAAAACCTCGGTAGTTAACTGCCGAGGTTAACTACCGAGAGAATGTTTCATCAGATGAAACAGTCACCTGCTCCCCCTACATACTATTTTCATCATCAACTTCATTTCCACCTCCATTCAATCCCAAAATCCAATAATTTTTTTTTATCAATTCTTGATCCAAAATCATTCAAGCATCAAGCATAGGAGGTATCAACACACTTTTGACGTAAA



gi|11913862|gb|BF648732.1|BF648732 NF049C07EC1F1053 Elicited cell culture Medicago truncatula cDNA clone NF049C07EC 5', mRNA seq

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
||||||.||||||||.|.|||
GGAGCCGTCAATTGATGGCTC

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
GAGAGAACTAGTCTCGAGTTTTTTTTTTTTTTCCTTCCATAATCACCTTGTTTATCTTTTATTTTCTACCTCTTGTTTTCATATCCTCGTCCTTAATTAACTCTATTAATATCTAGTTCTTTCTTTGTTAAGTTTTGGATCATTCTACTAAGGAAATTATCAAAACATGATATTTACAATTACAGTTATGGTTCAACTCATTTTATTATACTCAAATATAGTTCAGTTTATATTCTACTAAAATAATCANAATTGTTGTTCCCACATTTAATAAGGTTGNGCCACACCAGTAAAATACNATTTTGCCCCCTCGGCAGTTAACTGTCNANAAATTTGAAATCCGGCTGCAGTTAACTGCCAAGGAAAACCTCGGTAGTTAACTGCCGAGGTTAACTACCGAGAGAATGTT



gi|157984380|gb|EX532652.1|EX532652 MTGland_B039_2007-06-06/MTGlandB039_F04_011_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
|||||||||||||||.|.|||
GGAGCCATCAATTGATGGCTC

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
GNNTTACGGCCGGGCTATGTAAATCTACTCAAAAACAAAAATAAAATAAATCTACTCAAAAAATAAAAAATAAAAATATTTATAACAACTAAAATGTAAGTTAATATTATAATTACTTACTTGTGATTTTGTTGAATAAATTTGGTTGGATTTTTTAGAGAGATTTATGACAGAGATTTGGGAATTTTTTTTGAAAGATGAGATTAATAACGGATGAGAGAGCTTCTGCCAGATTTGTAGCAGAAGATCCTCGGTAGTTAACTACCGAGGTTTTCCTCGGCACTTAATTGCAGTCGGTTTGTGAATTCTTCGGCAATTAACTGCTAACTTCCGAGAGGGCAGAATCGTGTTTTACTTATGTGCCTCAACCTTATGCAATTTCTCAACAACAATTCTTATACTATTTTTCCTGAATGATTAGGTCATTATTTTTTTACTGTTGGAAACTGATAAAGTATGATTAATTTATCTTATTTTTACTCACACGAATCTTAAGATATATATTTTTAGAAGGTCACATATCAATCTCTACAACAACAACCAAGTTTTGTCTCTTTAAATGAGGTTTTACTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAANTGT



gi|157979645|gb|EX527917.1|EX527917 MTGland_A034_2007-05-23/MTGlandA034_G10_034_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
|||||.||||||||||.||.
CGAGCCGTCAATTGACGGCTT

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
TNACGGCCGGGCTAGTAATTTACTAAAATGCCCCTCAGCTGTTAATTGCTGAATTATGGAACCGACTGCAGTTAACTATCGAGGAAAACTTCGGCGGTAAACTACTGAGGAAAACTGAAAATTTCGGCAGTTAACTGCCGAGCAAACCTCAAACCTTATTTATTTTTTATTTTTTTGATAAAAACCATAAATTTTCAACGACAATTCTCAACGTTTTATGCATACATGTGTGCGAAACTTAAYCATTGACTTTTCTGCCTAATTAAACATTTTTTAATATATAAACAAAAGCGTTTTGCTTACCAATGTTTTTTATGCGCAATTAAACCTTTTCTTATATCACCAC



gi|11931010|gb|AW686673.2|AW686673 NF040F03NR1F1000 Nodulated root Medicago truncatula cDNA clone NF040F03NR 5', mRNA sequence

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
||||.|.||||||||||||
GGAGTCGTCAATTGACGACGA

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
GCACTCTTAATTTCTCTCTTCCTTCATTGTTCATTCACACACCCTTCAACTTTATTTCAATCCCTCTCTTTTCCAAATGGCCAGTGTTGAGGTTGCACAAGTACCACCACCAACAACAGTGCCCGAAACAACACCGGAGGTGATCAAGACAGAGGAAACAATTCCAGAACAAACAGCGATCGAAGTTCCTGCTCCAGAACAACCGGAAGCTGAAGTTCCTGCCACAGAAGTACCAACAGAAGAAACAACCGAACAGCCAACAGAAACAACAGAAGAAACTCCAGCTGCCGTAGAAACACAAGATCCAGTTGAAGTTGAGACCAAGGAAGTGGTAACAGAAGAAGCCAAGGAAGAGAATACAGAAGCACCTAAAGAAACAGAGGAATCAGTTTGAAGAAGTGAAGGAAGAGGCTGCAGCAGTAGTGGAGGAGCCTGTACTCAACCATTGAAAATGAGTCAGAAGCACCAGCAGCAGTTAACTGCTGAGGAAGAGAATGTTAAACCAGTTGA



gi|157979645|gb|EX527917.1|EX527917 MTGland_A034_2007-05-23/MTGlandA034_G10_034_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
||||.|||||| ||.||.||.
GGAGTCATCAAATGGCGGCTT

EST sequence (targeted fragment marked with yellow):
TNACGGCCGGGCTAGTAATTTACTAAAATGCCCCTCAGCTGTTAATTGCTGAATTATGGAACCGACTGCAGTTAACTATCGAGGAAAACTTCGGCGGTAAACTACTGAGGAAAACTGAAAATTTCGGCAGTTAACTGCCGAGCAAACCTCAAACCTTATTTATTTTTTATTTTTTTGATAAAAACCATAAATTTTCAACGACAATTCTCAACGTTTTATGCATACATGTGTGCGAAACTTAAYCATTGACTTTTCTGCCTAATTAAACATTTTTTAATATATAAACAAAAGCGTTTTGCTTACCAATGTTTTTTATGCGCAATTAAACCTTTTCTTATATCACCAC



gi|10697728|gb|BE997452.1|BE997452 EST429175 GVSN Medicago truncatula cDNA clone pGVSN-1M5, mRNA sequence

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
||||||.||||||||||..|
GGAGCCGTCAATTGACGGTTA

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GGATCAACGTTCATGAAGTTAAGATCATCAACATAGATATAAATTAATTGGATTTGCATGTTATACTAAAGAATTAAGAGAGAGAAAGACAAAAATTCTTCTATTTTTGGTATAAAAGATACGTTGAAAGAGAGGAGAAGTGAGGGATGTTTAAGAAAGACAAGGCCAAATACAAAACTTGGTCTTGAATTCATCAGATATTGGCACGTTAGGGGAAGAAAGAAGGGATGAAGTGTAAAACGGGAAAGTAGTTAGCATGATCCTTATTTTATAGGAAGCAAAATAAGAAAACGGAGTGTAACTAGCAAAAGTGGAGAAATATAGAACCCGTTGGAAGAAGGAATGGCTGCTGCATATGGAAATTGGATATAACCTTGCAACTAGCAAATTGTCACGAAAATTGCTGTTCACACACTTAATAAGGCTGAAACACATCAATAAATGACCAAAATACCTCTTGACAATTAACTGCCGCCGATTTTGTATTTCCTCAGCAGTTAAGTGTTGTCAGATCTATTGGCAGTTAACTGCCGAGGAAATCAATTATACAGACAGTGGCTTCTACATAATGGAAATCAAACCATTTTCGGTCTCTTTTTACCTGTAATTCAACCATAGCATTTCCAGAGGCAATACAACTCATACACTATTTATAATAAGTCATAAACAAGAACATTACATG



gi|148765026|gb|ES611720.1|ES611720 MTGland_A011_2007-05-04/MTGlandA011_B07_031_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
||||||.||||||||| .||.
GGAGCCGTCAATTGACAGCTT

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TTACNGCCGGGTAAACCTAAACCTAAATCTAAACTATCATCAAAACCTACATCTAACCCTAAACAATTCTAACAATTCTACAACGATTCATCAAAACCTAAACCTAACAATTCTAACCTAAATTATCCTAACATATCATAAAATCAATAAAACCTATATAATCGAACCTATGTAATTGAAATTTAACAAAAAAAACAAAAAACAAACAATTTGACCACAAAACAACAGTGCAATATGATTCAAAAAACTTACTTATTTCTGTGATTGAAATTGGCTTGGAATGACTTCAAATTGCTCAAAATCGCACCAAGGANAATAAAAAACGCAACAATGGAGTTTTGGAAACTACTATATCTGTTATGTTCTTATAACATANTTTCGGCAGTTAACTGCCGATGTTTTCATCGGCAGTTAACTGCANCCGATTTTTGAATTCTTCGACAGTTAACTGCCGAGGGGGTAAAAACATAAATTACTTTTCTGCATCAGCCTTATGCAATGTGTCTACACAAATTCT



gi|157983900|gb|EX532172.1|EX532172 MTGland_B033_2007-06-07/MTGlandB033_A09_040_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
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AAAGCCATCAAATGACGGCTC

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CGGCCGGGGGANGNACCGGAGCCAACATATTTTGAAGCTTCAACATGGACGGAAGCTCCATTAATGTTTGGTTTCNCTTCAACCTTAGGCGGTTTGACNTCTCCGGAAATTTCNACAAAATTTGGTTTTATCTCTCCCGGAACATCTTCCGCGTTCTCTACCATTACTATAATTAAACAACACAAAAATATGAATTATCAATTAACTAATGNATAAACATCAATGCCATAAAGAATTAAGACAAAAAAAAGAAAGAAAAGAATTTTTTTTTGGAAACTGCCATTTTTTCGTTGTGAAAATTTTTGACAAGTATTCCTCAGTATTAAAATACTTAATACCGAGGTTTTACTCGGCAGTAAACTACCGAAATTTAGTTCGGTAGTAAGCTACCGAGGATCCCATGACAGAGTTCTACGTAAACTGACGTAAAAACCCATAACAAAGCCAAAAAATGAATGGATTAAAATGCTCAATACCTGTTTTTTTTTACGTCAAAAGTGNGTTGATACCTCCTATGCTTTATGCTTGAATGATTTTGGAGCAAGATTTGATGAATTTTTTTTTTTGGATTTGGGGTTTGGACGAAAGTGGTATGGAAGTTGATGATGAAA



gi|157984767|gb|EX533039.1|EX533039 MTGland_B044_2007-06-23/MTGlandB044_E06_020_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
||||||.||||||||.|.|||
GGAGCCGTCAATTGATGGCTC

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ACGGCCGGGGGNAGAGTTGTTCTTATCAAAAAGGNATTTAAAAAGGATTTCAATCCTCTCCTGTTGATAGCCGTTACAGCCACGATAGTGTTGTGTGCGAGTGTGAGTTATATATGTCTCACATCGTATAGAAAAGTAAAGGTTAAACACCTTATAATAAGAGGGCCCATAAACCCATAGCCTTAAGGTTTTCGGTAAGAGTGTGATGTCTCTCTTGCTTGTGCGGTTGTTCTAGCCTAGATGTGGACGGTCGCCCGAGCTCCCCTCATGACCCAACAATGGTATCAGAGCCCGGTTTGACGTAGGGTACGACCGAGGTAGCCGGTCTGTCTGCGCAGAAAGCAACAATGGCAGTACAAGCAGTGTCGGTCTGTTTGCGGAGAAACCAGCAACGGCGATACATATAAGAGCTTCTGCTTGAAGGGGGGCATGATGAATAGATGAACTCATACTTGCACACATCAGATAGTGGTGGGGCGGAGCAGCATTTTTCCACGATAGTAGTACAAAAGTATTGTGTTTCGTAGTTGTAGAGATGCGGAGTGACCGCTACAGCCATGATTGTACCCTCAATAGAGAATTGTTGTTTACACATTTGATAAGGTTGTGCCACACGAGTAAATGACGTTTTTGCCCTTCGGCAGTTAACTGCCGAAGTTTTATAAATCCGGCTGCAGTTAACTGCCAAGGAAAACCTCGGTAGTTAACTGCCGAGG



gi|157977871|gb|EX526143.1|EX526143 MTGland-A070_2007-08-17/MTGland-70_J08_012_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Medi

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
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GGAGCCATCAATTGACGGCTA

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TAAAATAACCAAAAAATGAACGGATTAAAATGCTCAATACCTGTTTTTTTTATGTCAAAAGTGTGTTGATACCTCCTATGCTTGATGCTTGAATGATTTTGGATTAAGAATTGATGAAAAAAATATTGGATTTTGGGATTGAATGGTGGTAGAAATGAAGTTGATGATGAAAATAGTGTGTAGGGGGAGCAGGTGGCTGTTTCATCTGATGAAACATTTCATCGGCAGTTAACTACCGAGGATTTCCTCGGCAATTAACTGCAGCCGGAATTCAAATTCCTCGGCAGTTAACTGTCGAGGGGGTAAAATCGTATTTTACTAGTGTGGCATATATAGCCTTATTAAATGTGGGAACATCA



gi|148766058|gb|ES612752.1|ES612752 MTGland_A024_2007-05-07/MTGlandA024_C09_038_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
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GGAGCCATCAATTAACGGCTA

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TNNCGGCCGGGCNNTAAAATTATAAATCATATACTCTTACTAAAATAAAAAAATTAATCATATATTATAACATAAATCATTCAACTTATGTTTAACATATTTTTTTTTGTTAAAACGTAAAATATAACAAAATTATTCAACTTATATTTACTCTTAAAATAAATCATATACTCTTACTAAAATAAAAATATATATATAAAACACCAAATTAAAATATAACCCTAAAATTTTAAGCTATAACATAAACATCATACAAACATTTTAACTAAATTAAGCAACTAATATTTACTCTAAAAATGAATTATACTATGTAAATCTACTCAAAAACAGAAATAAAATAAATCTACTCAAAAACTAAAAAATAAAAACATTTATAACAACTAAAATGTAAGTTAATAACATTATAATTACTTACTTGTGATTTTGTTGAATAAATTTGGTTGGATTTGGTTGGGTTTTTTAGAGAGATTTGGAAAGTTTTTTTGGAAGATGAGATGGATTAGAGAGCTTCTGCCAGATTTGTANCAGAAGATCATCGGCAATTAACTACCGAGGTTTTCCTCGGCAGTTAACTGCAGCCGGTTATTGAATTCCTCAGCAGTTAACTGTCGAGGAGACAAAAGCGTATTTTACTTGTGTGCCTCAGCCTTATGAAATGTGTCAACAACAATTTTCTAGCATGATTCATTCACGAGATTGTTTAAAACTAAACATAATTCACTATATTCATAAAACATAANGGTTAATATATGTATACCATAATATTAANNNTCTCTGATTTACACCCTTGAAAAAATTGTTTANATTCCNNCCCTNNNATTTGAANATTCCNNTNANTTTTTGACCTTNNTGA



gi|148766058|gb|ES612752.1|ES612752 MTGland_A024_2007-05-07/MTGlandA024_C09_038_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med

CCTCGGTAGTTAACTGCTGAG
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GGAGCTGTCAATTGACGACTC

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TNNCGGCCGGGCNNTAAAATTATAAATCATATACTCTTACTAAAATAAAAAAATTAATCATATATTATAACATAAATCATTCAACTTATGTTTAACATATTTTTTTTTGTTAAAACGTAAAATATAACAAAATTATTCAACTTATATTTACTCTTAAAATAAATCATATACTCTTACTAAAATAAAAATATATATATAAAACACCAAATTAAAATATAACCCTAAAATTTTAAGCTATAACATAAACATCATACAAACATTTTAACTAAATTAAGCAACTAATATTTACTCTAAAAATGAATTATACTATGTAAATCTACTCAAAAACAGAAATAAAATAAATCTACTCAAAAACTAAAAAATAAAAACATTTATAACAACTAAAATGTAAGTTAATAACATTATAATTACTTACTTGTGATTTTGTTGAATAAATTTGGTTGGATTTGGTTGGGTTTTTTAGAGAGATTTGGAAAGTTTTTTTGGAAGATGAGATGGATTAGAGAGCTTCTGCCAGATTTGTANCAGAAGATCATCGGCAATTAACTACCGAGGTTTTCCTCGGCAGTTAACTGCAGCCGGTTATTGAATTCCTCAGCAGTTAACTGTCGAGGAGACAAAAGCGTATTTTACTTGTGTGCCTCAGCCTTATGAAATGTGTCAACAACAATTTTCTAGCATGATTCATTCACGAGATTGTTTAAAACTAAACATAATTCACTATATTCATAAAACATAANGGTTAATATATGTATACCATAATATTAANNNTCTCTGATTTACACCCTTGAAAAAATTGTTTANATTCCNNCCCTNNNATTTGAANATTCCNNTNANTTTTTGACCTTNNTGA