| mature miRNA: TACTCCCTCCGTCCCGAAATA species: Medicago truncatula database: miRNEST The numbers on the right side of the alignments show a score calculated for them. When calculating the score, a mismatch is given a score of 1, bulge: 2, and wobble: 0.5. |
| Predicted miRNA targets | |||||||||
gi|148765769|gb|ES612463.1|ES612463 MTGland_A020_2007-05-03/MTGlandA020_F09_035_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CNNNNTTACGGCCGGGCCTATTTTCNATATAAATTGTATATTAAAAATTCTGTTAATTTATTGTTTAAAATGTTGAATATTGGAATGTTTAACATGCACTGTAAGGATACAAGTTAACATTAGTTTGGACACCTGTGCCAAGCACGGACTAGATTGTCGACTATTTACATTTATTATATAAACATTAATTAAATGGCAAATTCATTGTTTTTATACATAATATATTAATAACACATTGTTATTGTGTTATTAATTAAACATTGTATATTAATACTAACGCATGTAACACTGAAATAATAATCTTTAATGCAGGAAGATCTCACGCGGATAACTAATATCAAGCCGATATTTTTAATATGGATATCGATAATAAATAGATTTATTCAAAAATAAATGGATAACTAGGTTATTTATTAAGGGACGGAGGGAGTAATAAGTATAATTTGCTTTGAAAAGTACAATTTTTTAACTTACATACTTANAATACATAATTTTCAAGGAATAATTTCCTTTTATAATTCCTTAATCAGTGTTTCGGGGCACCGGTTAACATTTCTCAACTTATAATATACTCACTTTGGTACTACCTTTGTCCATATTTATAAGATTCTTTTGAGGATTTTTCAACCTCTTTTTAAAAGACTCTTTAATATATCCAACTACATTAATTATTTTTTTACATACATGCTCATATTTATTATATATATTTTTCTTCNATCNACAATAAATAGTATATTGAAAACATAAATTANNTCTCTCTAAANATAAAATTGTAAAAACGATAGTGANTTCAAACAACTTTAATACAAATACCATCNATTTTCTNNANTTCCCNT | |||||||||
gi|148765397|gb|ES612091.1|ES612091 MTGland_A015_2007-05-02/MTGlandA015_H02_001_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GCNNNNNGGCCGGGGTCCCTACCAACTGAGTTAAGCTCTTTCATAGTGTTTTAAACTTGTCTCAAAAAAATCGTTCCAAAATNTAANAGTTNAAGGATAATTAAACAAACTTTGTTGTAACATGGACTAAAATTANAAGTAATTCTTTTCTGTATGGACTAAAAAACCTATTAAAATTAAGTAAGGATTAAACTTAGTCATTCCCAATTTTATAGGGACCAAAAACATATTTAACCATAAATTTAATGACAAAAAATCAAACTAGTCTATTTCCAAAAATAAAATTACACAATATGACCTTTCAAAAATACTACTCCATCTGTTTCAAAATGAGTGTCGCTTTAGCCAATTGCACACAAATTAAGGAATGAAATAAAGTAGTCAAATGTCGTAGCAATTTTACCAAATTATCCTAATCAACTATTGGTTTGTTTTTCATTAAAGAAAAAAATAATACTTTGGAAGTAGTGTAACATAATATTAAGTGAAGGGTACGATTGAAAAGAAAAAGTTATGATTGCATTGAAAACTGAAAGTGACATTCATTTTAAAACAATTTTTTGAATAAAACGACACTTATTTTGAAACGGAGGGAGTAAAAAATAATACAAGTGTTTCTTCTTTCAAAAAAAAAAAATACAAGTGTTTCTATCTTGGAAATTCAACATGTGTTATCTTACTCNNNATCACTTGTCTTTTTGTCAGTTTCNTCCACAATTNNAAAACTTGCTACTATGTGTATGTGTTTTTATAACATTTTCCTTTTGNTTTATCTCANCGNNGCGTGCANNGAGCTCNTC | |||||||||
gi|157983219|gb|EX531491.1|EX531491 MTGland_B024_2007-06-29/MTGlandB024_D09_037_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GNNNCGGNNTNACGGCCGGGGCATAGATCTTTAGACATGTTGACCCACTAACAATGTATATTATTCCCTCCGTCCCATATTAAATGATCTAGTTGACTTCGACACACGTACCAATGCATATGTTTTATCTTTGATATCTTCAATTCTCTATTAAAAAAATTTATGAAAACTTAATATTTTAAAAATATTCATCGAGAGGATTCCAACAACATCTTACATGATATTATTTATCTTTGTGAATTAGTAGAAAAATATGGTCAAAGTATATTAAGTCAATAATGTATATTGTCAACTAGGTCATTTATTGAGGGACGGAGGGAGTATAATGTTTAATTTTTGTCTTTAATAAGGTAATGAGTAAATAGTCAATTTCCCCCTGAAATTGTAAGTTTCATCAATTATTCCCCTGAAATTTCACAATGTTAGTTAATTTACCCCTCCGTCAAATTTTTCTGTTAGTGAACATGACGTTTTGCAAATATCCCCCCAGAAGTTTTGCACTTGTGTGCAAAATGCCCCCAAACTTAAAAATTTATATTATTTTTTTCTTAAAAACAAACAATTAATAGTTAAATATTAAAGTTAACTATTAATTTTGTAGTTTGGAAAAACCACATACATATATACATCAAATTATTTTTAAAGTTACATGTGATTAATATATTACTGATGACCTGCAACAATAGGTAACTAATAGTGGCTTGCCCTACAAATGCAAGTTATAAGACC | |||||||||
gi|57493228|gb|CX524509.1|CX524509 s13dNF17H01AT012_448362 Aphid-Infected Shoots Medicago truncatula cDNA, mRNA sequence TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GGCACGAGGTTTTTATAATNAGGAAAAGTACCATTAATGTTGCATTGGTATTGTAAAGCGACATATAATTTGGGACAAATTTTTTTCCCTAAAGCGACATACAATTTAGGACGGAGGGAGTAGTACATTATTTTTGAAAGATCTGAAATCAGTTGAAAACAAATTGTCTCCACACAAACTGAAAATTTCAAGGGGGCCTTGTCAGTAAAATTAGTACCGATGCTCTAACTATTTTCTAATTTTCACCTTGAAATACAGAAAACAAAACAGAAGAGGTAGTGATTCTTGAACAAAAAATTTCATATCAGAAGTTCCTACACTTCTATGCACTAAATGTAAAAGTCTGTTCCAAAAAACTTGATCTTGAACTCCTCATTGAGATGGTGGATCATAACTTGTAAACTGGATCAATTCCAAGGAGATAGAAGCAATGTCTCATCACAACAAGTGTTGCTTCACATAACAAGAGTCTACT | |||||||||
gi|148764984|gb|ES611678.1|ES611678 MTGland_A010_2007-05-04/MTGlandA010_E11_044_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TTACGGCCGGGGTGTATGATTAAGAACGGTTAGATGACACGTGTAACGTGATCCTAGTGCCAGGTCGTGCTCGTATGCGATGCGGTGCATTAAAATTTAAAAGGCTTAATAGCAGTTTTCGCCCCCTAACTTTCACGAAGTTGCGATTTTGGCCCCCTAAAAAAAACTACAAAACCGCTCCTTAAGTTTGCAACTGTAGCAGTTTTGGCCCCAAGACCAATTTTTGGGAAGAAAAAAAAAGGGGTTAATAATGCTTTATTCCCATGTAATATACTCCCCTCATCCCAATTTATAAGCAAAAAACACAAATTCACAGTTATTAAGAAAACAAAAACATAGTAGTTTGAAGTATAATTTTTTGTGTTTTTATTGAAATAAGTTTCATGGAAAGATGTAAAAACAATTCTTATTGGTTAATGATTATTGATAGAATAGAAAGTAGAACAAATTGAATGCAATTTGCATTTAATATTACTTTAGAAAAGATGATTTTTTTTGAGATAACATAAAAATTGGTATTTTTTGCTTATATTTTGGGACAAAGAAGATGAGAGTTTTTTGCTTATAATTTGGAACGGATGGAGTAGGTCATTTCTGATTGTCCCCTGCAAAATATTTTTTTGGATTCCGTCATTGTAATTTGAA | |||||||||
gi|11905724|gb|BF641566.1|BF641566 NF068B04IN1F1032 Insect herbivory Medicago truncatula cDNA clone NF068B04IN 5', mRNA sequence TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CTTTTGTAATACCGATTTGTGTAGTTTATTTATACTCTTGAGTACAATGGATTCAAAAAAAAGCAATCCTCATTCTAGGCCTATTTGCTATGGTTCTTATTTCCTCTAGGGTTTCAGCGAGGGTCTTAACTGAGACTTCCTCTAATACCAAAACGGGTGAACTATATAATATTTTTCATTTTTCTTTATTCATGAGAATTTATTTATAAGTATTTTGTATTTTTTCCTCTTTTGAATTTTATAAGTATGCTTGTAAGTAATGTTGGATGATTATTTTGGAGAGCCTGATTATGTGGNGGGATGTCCTTTATGCTAGGTACGGGTCTATGATGGCTTTGTCTCTTTTGGGCATTGTTCTTGGTTAGGGGAGTCTGACCTATGGCTCATTCATTCTCTCTCATCTCATCTAACTAATTTATTTTAATCATCATCCAATATTTTTTTTTCATCTAAAGGCACAAAAAATTTAATCTACACAATTTTTTTTCCATGAAACTTATTCCAATAAAAACACAAAAAATTATATCTCAAACTACTATGTTTTTGTTTTCTTAATAAGTGTGAATTTGTGTTTTTTGNTTATAAATTAGGACGGAGGGAGTAGGAACTAAACTAGAAATTCTGNGATATTGGANAGATTAAAAACATATTTAACCCTTTTTAAATTTAATCTAT | |||||||||
gi|13780898|gb|BG645786.1|BG645786 EST507405 KV3 Medicago truncatula cDNA clone pKV3-47H9 5' end, mRNA sequence TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): AACTTTTGTTGACAATTTTGCTTACATTTTGGGACGAAGGGAGTAAATATATAATGATCTCAATAAACATTAAAATAAAAACAATCATTTAGGTTGTGATGGACATAAGTATACTATATAATACAAGAAACTGAGTGCAAACAAATATATAACATTAAACATTAACCGGTGGGTCGGAAACCGGTGCGAAAGCTAAAAAAAAAAAAATATATAACGTTAACCGTCACTGTGTATATATATAGAGAGAGAATTCTTTCAGGATCATAATAACTACCTGGGAATGGGATGTGAGTCATTTTCCTTTAATTTATTTGACTATGTTTCTTTTCCATTACGTCAGTATGTATTCATTGTTTCTGTATGCTAGTGTTTGGGATGGAACTCTTCTTGTAGCTAGACCAATACTCAGCTACCAGCTTAGAGAATGAAGAGTTGGTTTCCATTAGCTTTGAAGGCTCATCATATTCCACCAGTTTCCCATAAGATAGGATCATGACCATGTCACTGTCTATTACAGTTGGAATTCTGTGAGCAATGGTTATTACAGTGCATTCTGCAAATTCTTGTCTAATTACTCTTTGTAGAATGG | |||||||||
gi|14874326|gb|BI268427.1|BI268427 NF006B05GS1F1044 Germinating Seed Medicago truncatula cDNA clone NF006B05GS 5', mRNA sequence TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CTAAGTATATGTTTTGGGATTCAATTCATCCTACAGAGAAGGCATACCACAACCTCTTCTTGGCTTTCCAACCCACCATTGATTTCATTGTCAACAACTAGAATAATGAATGAGTTCCTTCATATATACTCTTTCCATCCCAAAATATAAGCAAAAATAAGTTAATATAAATTGATGTATTTGGTACAAATTTTGAACAAAATGTATTGACTTTTGCTGATTAATTTTTGGACGGAGGGAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA | |||||||||
gi|13371529|gb|BG452735.1|BG452735 NF079C07LF1F1051 Developing leaf Medicago truncatula cDNA clone NF079C07LF 5', mRNA sequence TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TTTGTATCANACACAAATTGGAGTCGCAAAACTCAACTCGCCGGAAAACGCAGCCGGAGTTGCGCATCGGCCGCCACAAACTGTGAGAAAGTTATCAAGTTTTTTGTATGAATGGCTTTGCAACTGTTGAGAAATCGCACTTCAGCGTCAACGTTCAATTTGTTCACCAATGCTCTTAGACGTTTCTCTACTGGTACTCTCATTTCTCATATTTTCTACACTTTTTCATTCTCTTAATTCCAACATTTATATCAATATTCATAGTGTATTGTAGCAGATAGAGTAACATTGTGAAAAAAATAAATACTCATTTTGAAACGGAGGGAGTATAATGCAGCTTTTTGGTTTAGGTTCAATTATAACATTGATCGATGTTTCACAAACCGAACCAGACATAGGACCGGTCATCTGGGTCATGGTTCAACTGCTTTAAACTACCTAAATTGGTCTAGCACTGTGGTTGAACCATTCAAATAACCGAACCATAGACAATATCGGTTCAACATTCAACTAGTTGAATCATTTAATTTCGGGTCGGATTTTAAAATATTGCATCTAACTATGCTGCTTCTGTTTATGTCTTTCTTGGCTGNTAAGCTGANGTTTCGAACGGTATTCCTCANGANGCACGCGANAGGATGATGTATTCCGACATAAACTCACAGATTGGGAG | |||||||||
gi|157978989|gb|EX527261.1|EX527261 MTGland_A026_2007-05-17/MTGlandA026_E03_012_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CNTNACGGCCGGGANGGNANNTAAGANAGTGGATATTTGTATTAAAGTTGTTTGTAATCACTATTGTTTTTACAATTTTATCCTTTAAAAAAGAAGGTTAGTTTATGTTTTCAACATGTTATTTATTGTTGATTGAAGAAAAANATGTATAATAAATAGGGGCATGTATGTAAAGAAATAATTAATGTAGTTGGAAATAACAAAGGGGTCTTATAAAAAGGGACAAAAAAAATTCTCAATAGGGTCTTATAATTAGGGACGGAGGGAGTATATATTATGTAACTTTAACTTTTTTAATTTTAAGATAAATTGGTAATCAGGGCCGGCCCATAGCCCGTCGAGGCTGGGCGACGACACCGGGCCTCCAATTTTTTGGGGCCCAAAATATTTTTTTTTATATGTAAGACACAAAAATAATGATTATATATCTTTTAAAAGCAAAATTATTTAATTTGTACAGCTTGCTTTAGTGACATGACCATTTTTTGTTGAGTGTGAGGTCATGTGTTCAAGACCCAGTGTGATTTTTAATTATTTTTTTTAAATAACTTATTTATTTTTTTGGGGCCCAGATTTTTTTTTTTTGCATCCCTTATAAAATTAAAACCGGGCCTATGAATTTGTTAAAACGGCCTTGTTGGTAATATCAATAAGGGTATGTCATGGAAAAAATGCACTTAATAATGCATCTAGTAANNTGTATAGGAATTTATAATTAANAACNAAAGGAATATAAAGTTTAAATTTTAATTTTTTTTTTATCACAATAACACCNANNTTTTNNNANANCTANACNA | |||||||||
gi|7566987|gb|AW692251.1|AW692251 NF049C11ST1F1085 Developing stem Medicago truncatula cDNA clone NF049C11ST 5', mRNA sequence TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): ATTTATACTCTTGAGTACAATGGATTCAAAAAAAAGCAATCCTCATTCTAGGCCTATTTGCTATGGTTCTTATTTCCTCTAGGGTTTCAGCGAGGGTCTTAACTGAGACTTCCTCTAATACCAAAACGGGTGAACTATATAATATTTTTCATTTTTCTTTATTCATGAGAATTTATTTATAAGTATTTTGTATTTTTTCCTCTTTTGAATTTTATAAGTATGCTTGTAAGTAATGTTGGATGATTATTTTGGAGAGCCTGATTATGTGGTGGGATGTCCTTTATGCTAGGTACGGGTCTATGATGGCTTTGTCTCTTTTGGGCATTGTTCTTGGTTAGGGGAGTCTGACCTATGGCTCATTCATTCTCTCTCATCTCATCTAACTAATTTATTTTAATCATCATCCAATATTTTTTTTTCATCTAAAGGCACAAAAAATTTAATCTACACAATTTTTTTTCCATGAAACTTATTCCAATAAAAACACAAAAAATTATATCTCAAACTACTATGTTTTTGTTTTCTTAATAAGTGTGAATTTGTGTTTTTTGTTTATAAATTAGGACGGAGGGAGTAGGAACTAAACTAGAAATTCTGTGATATTGTAGAGATTAAAAACATATTTAACCCTTTTAAAATTTAATCTATATTTAAT | |||||||||
gi|157981608|gb|EX529880.1|EX529880 MTGland_A060_2007-06-22/MTGlandA060_B02_007_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TTACGGCCGGGGTCCTGAATTAACTGAGTTATTTGTTCATTTCACACGTATTAAGAAAAATGTATAAAAGAAGGAGAGAGAAAAATGGTTTTAAATGCTTTTGTTAAGTATTGGTTGAAAGTAAAATATATTGAATTGGAAATGATGAAAGTAATATTAATTATAGTTATAAAGGGAAAAAATAATTATTATTGTATTGAAAAGTGAAATTGCTCAGTTATTTTGTGACACTTTATTTTAAAAATGACTCAGTTATTATAGGACGGAGGGAATATTTTTTGGTCAAAATAAAGATACAGTCCATGCACACGAAACTCAACGGCCAAATAAACTGAATTTGAGGCTTATCCTAGAATATGGGGTCCAATAAAAAAATAACTTTTGATTGAATTCAACCAATTACAAACTCTAGTTTTTCGATGGGACCCACTGCATGGCATGAAGCTCATAACTGTTTCTCATGCTAACTTAATTTGTTCATCTCCGTCTCTATATAAACCTCACGACGCTTTTCCATTTTCATACTAAACAAACATACAAAACAACGTTTAGAATCTCTCAAACTTGTGCTTTAATTTGCATATTTGTTCTTTCTTTAACTAGTTTTTATTTTATTTTGTAGCCATGGGCTTCAAAAACTTGGTTATTTTAATTTCTGTGGTGACAATATTGAACGTACTTGTTGGTCAGTACGTGAATTGCAAGGGTACCGATGGTAATCATTATCATCGTCGTACTCGTCATCATCAACATCATCGTAACTCACACACTCACTTANGCAATAATAAAACTCTTTACGAAAATGGTTTCGTTCAACGAAAGGAAACTAGTTTTGTTCTGAACGGAAAACCTTTGTACTTGAATGGGTTCAATTCGTATTTTTTAATGATTGTAGCATCNNANCCNTCAACNNTGTCTAAAGTTNCTACNNCTTTTCAAGAANCTTCCNNANTGGNTNAANNTNGCAAGAACATGGGNCNTNANGANGGNGNTATAAAGCTNNTCNANTTC | |||||||||
gi|57493369|gb|CX524650.1|CX524650 s13dNF09E07AT055_477934 Aphid-Infected Shoots Medicago truncatula cDNA, mRNA sequence TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GGCACGAGGGTGATGGAATATGGTGGAATGGATACCATCAAATTCCATCTCATTCCATTCTTTTGTTTAATATCCAAACAATGGAACATATAATGTCATTAATCCAATACCTTCAATCCTAACAAAGCCTAAGAGTACTCGGAAACAAACGGTACAAACTCTACAATATTATGATAAATGATAAATTAAACAAGATAAAACAGGTACTGAGCTTGACAGCGAGAGCTTAAATACTACTCCCTCCATTTTTAAATATAAATAAAATTGACTTTTTAGGTTCATTTATTTAATGATGTACGTAGTCCATATTATAAACAACATACATCATTAAATGAATGAATCTAAAAAATGAATTTTGCTTATATTTAGAAACGGAGGGAGTAGAAGTTCTCAACCAGTTGTTGGGAGATACACCCTTATAAGCTGTCTAACAGAAGTGATCTTTTTTCTACAGGTAGGACATTTAGCTTGAGCCTTGATTGCATCCTTGATACAAGTCTTGCAAAAAATGTGGCCACACTTTGTGGTCATTTCTTCGACAAAAGGGCCCAT | |||||||||
gi|157982053|gb|EX530325.1|EX530325 MTGland_A065_2007-06-28/MTGlandA065_F07_027_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): ACGGCCGGGCTATCCNTTTACGGTTATTGCTTCTATGAACATACATACTCCCTACGTTCAAAAAATAAGCAGATTTTACTTTTTAGATTCATTCAATTAATGATGTATATGGTCTATATTATAAACTACATAGATCATTAATTGAATGAACCTAAAAAGTAAAATTTGCTTATATTTTGAAACGGATGGAGTAGTAGCTAAATAATCCCAATGTGTTACATAAGGCAGATATTGTATAATCAAGGTGAGGTGGATCTGAATTTCTACCCAAAATCAACTCCAAAATGGGTCTATATTTCTTCAACCACTTCTGCCACCTTTGAAGTTTTGTCGGTAACTTCTTACACAAAGGTTAAAGTGTACTCCCTCGGTCCCTCAATAAATAATCTAGTTGATTCCGACATACTTACTAATACATATGTTTTATCTTTGATATCTTCAATTCTTTACAATTTTTTATTTTTTTTAATATTTTAAAAATATTCATCGAGACGAATCCAACATCTTATATAATACAATTTTTCTTTGTGAATTAGTAGAAAAATATAGTCAAAGTATATCAAATCAATAATGTATATTGTCAACTAGGTCATCTATTGTGGGACGGATGGAGTATCGCCTTTCGGTCCATCATTCTTATAAGCAAAAAGTTATGGTTGTGAAAAAGTTATAATAAAATAGTAGTGGTAGAAATATCATTTCTTGAGAAGGAAAACTATGTTTGAGGAAAAAAAAACAGCTTATAATTGCAGCGCCTTATAAAACAACACGTGCAGTACTTGTTTGACTTGGTGCCNCGTCATTGGACCCCACTTACTGCAGATGTTACAATATCCAACTCATTGCTGACTCACTTATCACTAAAGAAATACTGTAATTCANCGTGGGTCCCCCATGATCTTAAACCTCTGTCATTTTNTCTTCATGGAANAAATCNNAATAGACNTCNANNACAGCTATANTCNNAGAGTTTTNATTTGTGCTATCAGTTTTNATTNTGNNNNTNNAANTNNANNNGTC | |||||||||
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gi|148764226|gb|ES610920.1|ES610920 MTGland-A001_2007-02-01_1/MTG-A001_D06_021_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Medi TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): AGTCCNTATTAGCGGCTACCATATTTTATTAAAAAATAAAAAATTATACTACCTCCGTCCCTAATTATAAGACCCTTTTGAAAAAAAAAATTGTCCCTTTTTATAAGACCCCTTTGCTATTTCCAACTACATTAATTATTTTTTTACATACATGTCCCTATTTATTATACATCTTTTTCTTCAATCAACAATAAATAACATGTTGAAAACATAAACCAACTCTCTCTTAAAGGATAAAATTGTAAAAACAATAGTAATTACAAACATATTTAATACATATATCCACTATCTTAATTCCCGTTATTTTTTCAAAAGGGTCCTATAATTAGGGACGGAGGTAGTATATATTTTTATTTTTTAATAATTAAAATAAATAAATACATATGTGGCGTCCACATCAACTTTGATTTGGTCAAAATTGGCATAGGGGCCAAAACTGTAAAAAAGTCAATATTTAAGGGGCGGTTTTGTAGTTTATTTAATTAGGGGTCAAAATCGCAATTTTTTAAAATATAGGAGGCCAAAACTGCAATTAAGTCTAAAAAAAATTCACTTTTCAACCTCTAAATTTACCCTATTTTGCAACCTTAAGGCCCCCATCAACCACCACGCGACTCCTCACTTAAGTGACTTGGACGCCAGTGAATTAGTTTTCANTTAAATTTAAAAGAAAAAATCACTTGTGTATTTAAA | |||||||||
gi|7565293|gb|AW690557.1|AW690557 NF035H05ST1F1000 Developing stem Medicago truncatula cDNA clone NF035H05ST 5', mRNA sequence TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GAGAGAGAGAACTAGTCTCGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTTAAGGTTATAATAGAAAAAGTAACATTAAAGTTGCATTGGTATTGTAAAGCGACGTACAATTTAGGACAAATTTTTTTCCCTAAAGCGACATACAATTTGGAACGGAGGGAGTAGATAACTTCGTACGCACAAATTTTAATGATGTTATTCGAACAGCTGTTTTCAGTACTCAAACAGTACGACAAAATAAGGAGCCTTCTACTAAAAAATACAAAAAATAAGCAACCTTGTATGCTTCCAGCAATTATGTGATGATTAGTAAGAAGAAAAATGCTACAAAGCAACGCCTAAGTTGTCTCACTTCTTGACCTCTTCATACTCTGCCTCTGGAGCCTGATCACCACCACCTGGAGAACCTCCATCAGAGGAACCTCCACTTGACCCACCTGACATATGCTGACCAATCTTTGACACGGCTTTGTTAGCAGCATCAAGTTTTGTCTTAATTTCATCAACACTTTCTCCTTCCATAGCCGTTCTCAAATCTGAGACCGAGTTTTCAATTTCCTTCGCAACCTCACTAGGAATCTTTTCCCTATACTCCGCTCAAACTCTTTTCAATCAGAGTAGATTGATGTGTCAGCACTATTTCTTGATATC | |||||||||
gi|157983401|gb|EX531673.1|EX531673 MTGland_B026_2007-07-02/MTGlandB026_H02_001_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CGGNNTTACGGCCGGGCNTTATTGTGTTGAGCTAAGTTTGGAAATGGCGTCTATCGTGGGGAGACGTTGCAAATTCACATTTACAATTTCCTACATATAATGATACTTAATCACGGAATTTCATTGATCACAGGCCATGTAGGTATTTCATCAATTAATGCAATACGTAATTACTATTCAATTATTGGATCGGAAACAATCAAATAATAATTGGTGTTGAGAAAGAACTATTAATGATATGGTACTCCCTCCGTCCCTGAATAAGTGACCTATTTGTAAAAAATATTTGTCCCACAATACTTGACCTTCTCAGATTTCTAAGCAAAATTTGACAGATTTACCCCTTATAAATACTTTTTGTGGTCCCCATGTTAAAGTTTGTAGTGGAACAAAGAAAGTAATCATTGCTTAAAAGTGAAAAAGTTTCAAAATAATGACAAGGGCAACTCAGTAAAAGTATCACTCTCTTTCTTTCATCTTTACACTTTTCTTAATCTGTGTGAAATGGTCAAATAGGTCACTTATTAAGGGACGGAGGGAGTAATTGTTTTCAAGTATCAGTCAAAAACTAATTATCACATTGCAGTTTGAATATTTTTTTGGATAACTTGTGCATTCAATGCGTTGGAAATTGAAGTATTGGACTTTTTCAATGCATAATTTCTTAATTAGAAATCCTTAAAGAGTGTCATTAGAGCACTCATTAACAAAATCCTATTTTTTTTTAGAGCTAGTGCAAAAAAAAAACTTATCAGAAGGAAAACAATACAAAAACAAAAGACTAAGCAACTAAGTGCCTAAAAACTCCTGAAGAGTCGGCGAACAAGATAGAATATAGCTTCNGANGAGAAGANGTTCATATCTTCAAAGCNTCAATTTGATTTACTATCTTCTACTAGTATTTATTAGAAAAAANTTTNTGTGNAGNNNCTTTTAAATAAANTTTAANTGAAANTCATCGTGAGCNTNACTNANTTGGTATGAANANGCANANNTNTGNNNG | |||||||||
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gi|157983863|gb|EX532135.1|EX532135 MTGland_B032_2007-06-24/MTGlandB032_E12_044_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CGGCCGGGACCTAGTTTNNAACTATAACTGTAGAAAAAACTACCTAATCCTAGCCATACAATCTAAATATCGAATATAGCCGTTAGAACACTTGACCTTATCCGGAGAAATAACTGCTTTCGAGATCCCCTCGTCCATCGAACAAAGACGCGCATCTTCGATTCTCGTCCAAGGAACATAACTTCGATATAACATGCAAGGTCAAGTCCATCTCGTCGGGTCAACCCTTTTGACCATATTAAATGATACTCCCTCCGTCCCTTAATAAGTGACCCATTTGGAATTTTTTTAATTTTGACCTAACTGACTTTGACCGTATTTTTCAACTAATATACAAAGATAAATAACATCATATAAGATGTCGTTAGATTCGTCTCGATGAGTATTTTCAAAATATCAAATTTTCATAATTTTTTCCAATATATTATTCAAGATATTTAAACTCAAAATTACGCATTGGTATGCGTAATTGAGTCAACTAGGTCACTTATTAAGGGACGGAGGGAGTACCCTTTTACAAATATTTGCTAACAGATACATGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAANCNNNT | |||||||||
gi|14872203|gb|BI267301.1|BI267301 NF101B12IN1F1101 Insect herbivory Medicago truncatula cDNA clone NF101B12IN 5', mRNA sequence TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GATTTGTGTAGTTTATTTATACTCTTGAGTACAATGGATTCAAAAAAAAGCAATCCTCATTCTAGGCCTATTTGCTATGGTTCTTATTTCCTCTAGGGTTTCAGCGAGGGTCTTAACTGAGACTTCCTCTAATACCAAAACGGGTGAACTATATAATATTTTTCATTTTTCTTTATTCATGAGAATTTATTTATAAGTATTTTGTATTTTTTCCTCTTTTGAATTTTATAAGTATGCTTGTAAGTAATGTTGGATGATTATTTTGGAGAGCCTGATTATGTGGTGGGATGTCCTTTATGCTAGGTACGGGTCTATGATGGCTTTGTCTCTTTTGGGCATTGTTCTTGGTTAGGGGAGTCTGACCTATGGCTCATTCATTCTCTCTCATCTCATCTAACTAATTTATTTTAATCATCATCCAATATTTTTTTTTCATCTAAAGGCACAAAAAATTTAATCTACACAATTTTTTTTCCATGAAACTTATTCCAATAAAAACACAAAAAATTATATCTCAAACTACTATGTTTTTGTTTTCTTAATAAGTGTGAATTTGTGTTTTTTGTTTATAAATTAGGACGGAGGGAGTAGGAACTAAACTAGAAATTCTGTGATATTGGANAGATTAAAAACATATTTAACCCTTTTTA | |||||||||
gi|157984313|gb|EX532585.1|EX532585 MTGland_B038_2007-06-05/MTGlandB038_G08_026_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TACGGCCGGGGGNNTTTGTATTAAAGTTGTTTGTAATCACTATTGTTTTTACAATTTTATCTTTTAAGAAAGAAGGTTAGTTTATGTTTTCAACATGTTATTTATTGTTGATTGAAGAAAAAGATGTATAATAAATAGGGGCATGTATGTAAAGAAATAATTAATGTAGTTGAAAATAACAAAGGGGNCTTATAAAAAGAGACAAAAAAAATTCTCAAAAGGATCTTATAATTAGGGACGGAGGGAGTACTTATTAGAAAGTTTAAAATAGAAACTTTATCTTGGAACTTGTACATTAAACACATTGAAACAACAAAAAGTAACTTTCTCTACCTAAATTTCATCGATCATTTCTAATTTTGATCCAGAAAGCCTCATTTGGTATGTGCTTCATTTGAAGAAAGCCTCATTTGCAAAGTGGAGTCACCGCCACTCAGTTCTTACCACTCTATCTAATCTATCTTAGTCAAGGAAGCACAAGGAAGAGTGAGAAGGATCCCAATTGCTACCAAGGCCACAGATGTTAACTACTACTCCACCAAACAGACCAAAAAAGAGTACACATTTCACAATCCCTTCAAATACTCATTGGATGCCACAACCACAACTCCACTAAAGCCTTAAAGTCGACATTGAATCGTGTGAGAACGAAAATAAAAATAAAAGTTGTTAAACCTCATCAAACTAATACCCACCCATGTTGAAATTAGAAAGGTACAAAATTTCAAATTTGAAAGTGATCAACCTTGACACGAAGGAGGAAAAAAATGTCCTAATATGATGGTAAAGTGTATCTTTTTTAAACAAACTTTTAAGCCAAAATTGAAACNAATTAAGCAAAAGAAAAATAGACAATTACNGCAAATACCTACGTGAGCATCTATGTGAAGAATGCATCATGTGTGTTTCATTCATTCATAGAATTTAATTATTTTTCTATCAGAAAANAATAATAGTCATTCNCC | |||||||||
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gi|33105903|gb|CF069244.1|CF069244 EST669965 MTUS Medicago truncatula cDNA clone MTUS-18A12, mRNA sequence TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): ACACTGGAGCTCAAAAGAAGAATTTTATCCCATCAGGTTATTACTACTTAGTAATCCATTCCATAGACAAAATACTCTGTTATTTATTTATTTATTTAATGAAGCTCTATTTTACTTTTGGCAAAAAATTCTTTATTTTGAATCTCTTTTATTGTTATGTATCCTTGACCTCTAGGAGTTTGCTTGTAATATACTCATCCGTTTCAAAATACATGTCTAAGTCAACCACTTCACATATGTTAATGCATAATTTTGACCATTAATATCTTTAATTATCTAAAGTAAAAAATTATAAAAATTTAATATTTTGAAAATATTTGTCGAGACAAATCAAACAACATCTTACATGCTAATATTTGTATTTATACATTAGTTAAAAAGTATGGTCAAAATAAATCAAGTGAATAGTGCACATTGCAAAAATTGGACATGTATTTTGAAACGGAGAGAGTAAGTTATATATGTACACTCTTGAGTCTCGACCTTTAAATTTGCTTGAAAATCTTAATATTTCTACATAAATAGTCTTTTTCATATCTTCAACTTTCTATTATGTTTTTACATCTCCGATAAATTTCTCTATTTATTACAAGTTGATTGGAGGACTTTCCATGCAAAATACCCTTGGAT | |||||||||
gi|209568687|gb|GE351261.1|GE351261 MEUAZ61TR JCVI-MT2 Medicago truncatula cDNA 3', mRNA sequence TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TAATGTACCAGGGACAAGTGCAAAAGATGTCATGGATATGGTCCTTGTCACTCAATACTTTGACACTTTGAAAGAAATTGGGGCTGCCTCCAAGTCTTCTGCTGTGTTCATTCCACATGGACCTGGCGCTGTTCGCGATGTTGCTAGCCAAATTCGCGATGGACTTCTCCAGGGTTCTCATCAGTAGCTTCTATTCCTCCCACTTCATATCTGATTTGTATGGAAGTGTTGTGATTTTTTAATGTTTTATGTCTCTGCAGTATGATATACTCCCTCCATCCTATAATAACGGAGCCATTTGTAAAAAAATATAGTCCCAAGAATCTTGACTCATTTCACTTTTCAATACAACATTAATTACTTTTTTTCCAATTATAACTCTAATTAATACTACTTTCACCACTTTCAATTCAATATTTCTACTTTACATTTATCATAAAGAAGAATGCACCAATACTTGACAAAGACACTCAAAACTATTTTTCTCTTTCTTTTCTTTATACACTTATCTTAATCTGTGTGAAATGGAAAATTGGCTCAGTTAAACTGGGACGGAGGGAGTATGATTTTGTGTTAGAGTAAACTGCTAACTTGATCCTCCAAATATTACAGTATCAACTATCAGTTCTGCAAAGATATATTTTGTCATTAAGGTAATCCTTCAACAATTTAAAACCATGTCACATATTCTATTATGGAAAATGGTGACACAAAAATACTAATTTGGTAATTGTTTTGTATCTTTGTGGGATCGATTTGGTAATGAAGTATTTGAAGAACTGTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAA | |||||||||
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gi|260521742|gb|GT139498.1|GT139498 METCM18TF JCVI-MT3 Medicago truncatula cDNA 5', mRNA sequence TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GGATGCCGGTTGTGAAAAAATATACCCGCTTCATCGTCAACATTTATTTAAGTGCATAAAGGCATTTTGTGTGAGATCAAGTTGAGGAGGTGCATGTAGCAAAGGATGGTGTATTCCCTTCCACCGTTCATGCAGCTGACGCCACAGGTGTCGACGCAAAGGGACGTAAAGACTTGTCTTAAGGATGATTGTATTAAATGATACTCCCTCCGTTTCATAATACTTGTCCATTTTAGAGAATAATTTTGTTTCACAATACTTGTCCCTTTCAAGTTTCAATGCAACATTAATTATTGTCTTGTCAATAATACCCTTGCATATTTATTGTAGAGAGAGAAAAAAATAAAATGAAATAATAAATGATTAAGGGTATTATAGAAAACACACACATATTTTCATCAAAAATAACAAAATTTATTTGGTTTCTTGGTTAGTGCAATTTCTCCAAAATGGACATGTATTTTGAAACGGATGGAGTATTTGATAACTTTTATCACGTGGAATCTTGGCTCGGATCCACAAACATGCTTGATGCTTAAAATAAGATGCATTTCAAATATATTTGTATGCTTATGTTCATGTTTTAAATTAATTCGTATTTTAAATTTCT | |||||||||
gi|157982721|gb|EX530993.1|EX530993 MTGland_B017_2007-05-25/MTGlandB017_H11_041_1 Medicago truncatula A17 glandular trichome Med TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TACGGCCGGGGTCTGANNNATTTCAAATAAATTTATTATTCCAACAACTTTTTCTTAATATATGTGATTATTGTTAGAGATTCTTATAATAAAGGATTAAGGGAGTACTCCCTCCGTCCCAAATTGTATGTCGCTTTGAAAAAAAAATTATCCCAAATTATATGTCGCTTTACAATACCAATGAAATATTAATGTTATTTTTCCTATTATATCCTTAACTATTAATTATTATCTCTTCTTTCAATTATTTCATTTATCTTTTCCATACCATTTATTATGGATAATTTTGTAAAAAAACTCATAATTTATCTTCCCCACACAATATTAATTACATTTACGTGTGAAATGGCCAAAACGTCATACAATTTGGGACGGAGGGAGTATTTGACTACATTCAATCCACAAACATAAAAACACAACATTCTAACCCCAATTANATGAATTATTCTATTTTATCTGTATTCGGCTCAAGTACCAACTAATCCGGTTAACTTAGCGGGGCTCAATTGAAGCCGGAGAAAAGCCATGTATGGACTAACCCAACACATGAATTGTTAACACTAAATAATCGAACCTAAGACATTGAGAGGAACACACTCGTANNNCCCGGACCCAATTACATGAAATATTGAACTATAAACAAATGAACAAACAANNAAAATNAAAAAAACTCANTTTGACGGANTTGGGAGTTTTNNTNGGTTTCNCCNNANTGNGGA | |||||||||
gi|13780233|gb|BG645121.1|BG645121 EST506740 KV3 Medicago truncatula cDNA clone pKV3-39E4 5' end, mRNA sequence TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): GAGAAGAATAGTACTAAGAAAACAGCTGCTGCTGAGGTTTCCAAGACCTTTGATGAGTCAAAGGTTTGTTTTCTTAAATTTTATCGAGTGTTTTTTTTTTTTGTCTTATGGTTTTTTATATACGTTGAAAATGAAAAACTAGTTCATATATTTGATGTGGTTTGGTATTTTGTTTAGGAGGGAATCAATAAAGAGTTTGAGGAAAAGAAAACTGAACTTCAAACAAAAGTACTTGCGGTATATGAAGCATCTTCAACTGAAATCAAGGTAAGAAGAATATACTTATATAATTAAGTATACATATCTATATACATACACATATACATGATCTATATTCATGTATTCCCTCCGTAACAAAATATATAAGCAAAAAAGTATATATATTTGGTCTAAATTTAGATCAGATTCATTTAGACGGTATCTGGTTAAAATTTGGGCCACATACATGAGATTTTTATTTATATTTTGTTACGGAAGGAGTATGTTTGTACATCTGTAGGTGCCAAAATATAAAATTTAAGAAGTGAAAAGGACACTAATATTGATGGAAAATTTTCAATATCACCTTTACAGAGTTTGGTCAAAGAACGTGATCAAGCACGTCTAAAGAA | |||||||||
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gi|11931851|gb|AW692244.2|AW692244 NF049B06ST1F1048 Developing stem Medicago truncatula cDNA clone NF049B06ST 5', mRNA sequence TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): CCGATTTGTGTAGTTTATTTATACTCTTGAGTACAATGGATTCAAAAAAAAGCAATCCTCATTCTAGGCCTATTTGCTATGGTTCTTATTTCCTCTAGGGTTTCAGCGAGGGTCTTAACTGAGACTTCCTCTAATACCAAAACGGGTGAACTATATAATATTTTTCATTTTTCTTTATTCATGAGAATTTATTTATAAGTATTTTGTATTTTTTCCTCTTTTGAATTTTATAAGTATGCTTGTAAGTAATGTTGGATGATTATTTTGGAGAGCCTGATTATGTGGTGGGATGTCCTTTATGCTAGGTACGGGTCTATGATGGCTTTGTCTCTTTTGGGCATTGTTCTTGGTTAGGGGAGTCTGACCTATGGCTCATTCATTCTCTCTCATCTCATCTAACTAATTTATTTTAATCATCATCCAATATTTTTTTTTCATCTAAAGGCACAAAAAATTTAATCTACACAATTTTTTTTCCATGAAACTTATTCCAATAAAAACACAAAAAATTATATCTCAAACTACTATGTTTTTGTTTTCTTAAATAAGTGTGAATTTGTGTTTTTTGTTTATAAATTAGGACGGAGGGAGTAGGAACTAAACTAGAAATT | |||||||||
gi|161107300|gb|EY478060.1|EY478060 METB970TF JCVI-MT3 Medicago truncatula cDNA 5', mRNA sequence TACTCCCTCCGTCCCGAAATA EST sequence (targeted fragment marked with yellow): TGGACATGTATTTTGAAACGGATGGAGTATTTGATAACTTTTATCACGTGGAATCTTGGGCTCGGATCCACAAACATGCTTGATGCTTAAAATAAGATGCATTTCAAATATATTTGTATGCTTATGTTCATGTTTTAAATTAATTCGTATTTTAAATTTCTTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAA | |||||||||
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