miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse



Basic information from miRBase
hairpin accession number: MI0005393
Located between position 6520941 and 6521124 on chromosome 1 strand +
mature miRNAs for MI0005393:
         ath-miR837-5p (MIMAT0004258): ATCAGTTTCTTGTTCGTTTCA
         ath-miR837-3p (MIMAT0004259): AAACGAACAAAAAACTGATGG

References
[1]Rajagopalan R, Vaucheret H, Trejo J, Bartel DP, Genes Dev. 20:3407-3425(2006)., "A diverse and evolutionarily fluid set of microRNAs in Arabidopsis thaliana"
[2]Moldovan D, Spriggs A, Yang J, Pogson BJ, Dennis ES, Wilson IW, J Exp Bot. 61:165-177(2010)., "Hypoxia-responsive microRNAs and trans-acting small interfering RNAs in Arabidopsis"




>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
GTACACTTACAAGATGCATGTTTAGAAACTTCCAGATATGTGTACTGATATTATTTGCAAATACTACTGTAGTCCCAAAG
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