| Basic information from miRBase |
| hairpin accession number: MI0008280 |
| Located between position 4849902 and 4850058 on chromosome 10 strand + |
| mature miRNAs for MI0008280: |
| osa-miR1876 (MIMAT0007831): ATAAGTGGGTTTGTGGGCTGGCCC |
| References |
| [1]Zhu QH, Spriggs A, Matthew L, Fan L, Kennedy G, Gubler F, Helliwell C, Genome Res. 18:1456-1465(2008)., "A diverse set of microRNAs and microRNA-like small RNAs in developing rice grains" |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
CGTCCATGTCCTCAGAGAACATGCTCCACCACAGCACGCCAGCCACCGCTGCGAACGCCTCGCGTGCCACCGACACCGGC
ATGCCCCCGGCGCTCCCGTCGGACACGCGGTGCGCGAGCTCACGCGCCACCTCCTCCCGCATGGCATGTGTCACACCCTG
AAGTTCTTCTCGCAAGTCTAAATTAATTTAATAAATTACCTCAAGAAATTATCTGTGTATTGGCAAGAGAGAAACCCTAA
TTTAATAAATGCAAATAATAATCGGAATTGGCATATGGAATTTTTGTTCACTTCTACAAGTCAAAATATGCTAACAGGAT
TTTCAGTAGAATTTTCAGAGGTCAAGAAATAATTTTAACCAATTAAAAATGAACACAAGCAATTATTAAATCCCTTGAAA
TCCCTTTTTTTTTCCCTTTTTCCTTCGAGTGGGCCATCGGCCCATTCTCCCCTCCCCTCCCCGTGCGCAAGCTGGGCTGG
CCCGAGGCCGAGGCCTAGCAAGCGGCCCAGCCGCCGCCTCGCACCCCCCTCTCCCTCCCTCTGGGTCACCGACAGGTGGG
GCCCACCTATCAGCCCCGTCCCCTACCTCCGGCCGGCGCCGCCCGCGCCCGCAACCGCCGCTCCCGCCTCTCCCGCACAC
GCCCGCGCATGTCGCCCACTCCCCGCACTCGCCCCGCACGTCCCGCAACTGCTGCCCCTCACCCGCCCATGCGCCCCACC
GAGATGGCCGGGATTCAATTTTTGAATCCCGCCTCTATCTCCTCCCCACCTCCCCACGTCGCCGGCCGATTCCCGCGCCT
CTCGGCTTCATCTCGCCCCCTTGTGCCTATAAAAAGCAACCCCGTCCCCTCCTCTACCATTTTCCCGTTCTCGTCGAGCT
CTCCCGTGCACTCCACCACCCTAGCGTCGCGCACCACCCGCTGCCGCCGCTTCAGCCACCTCCGGCCGCCACTCGCCGCC
ACTCGTTGCCGCTAGAGCCCCCGCCGAGCCTCGCCGTCGCTGCCGTCGGGTTCACAAGCCCACGGGCCACGCCGCCCACC
CCTTCCCCGTCCAATGCCGCCGCCGGAGTCCGGCTTCCACCGTGCGCCGGTCAGCTCGCCATTGCCACCTCCTTTGGCCG
GCGATTTTGCCCATCTCGCTCCCTCTCTCCCTCTCTAATCACACTCATTTGCTTCCCTAGGTTACCCCGGAGCCCGTCCC
GCCGTAGCCGTCGCTTCCCGCCGCTCACCGTCGTCGATCGCCGTCGGTGAGGCCCCTCCCCTTCTTCCCCTCTCTCTCCC
GCGCCGCCTAGCGCTGCTGCTGCTTAACTGCCAAGCCTCCGCGCCGCCGCCTAGCTGCGTTGCCGTTGCTCGCTGCCGTC
GGCTGCGCCGCCGCCTAGCCGTGTCGCCGCCGCTCGCCTCCTCGGGCCGCCGCGCGCCAGGGCCACCGGGCCAGCTTAAG
CCGCCCGCGCGTGCGCTCGGCCGTACGCCGCCTTCGCCGTCTGATCTACCCTCGGGTAGATCGGGGCCATCCGTTGCCGC
CCGCGTGGCAGCCCACGTGGCCGCCATGTGTGCGCCACGTGGCGCTCCCCATCCCCGATCCCGTGGACTCGGTCCACTGT
GGACCAGCGGACTTGAGCCGATGACTTGTGGGGCTCGCATGTCGGCGCCCCCCCCCCTTCGCTGACGTCACCAGGGTTAA
TTATTGTGCAATGAATCAATTAAGTTTTTTCTTTTTATAGTAAAAAAACACAGTGAATCTTCTAAAATTCATAGATAATT
CATCCGTGCTCTATAAGCCATTCAAGTCTCAGTAAATCAAGAAAAATTCAAAGAATCCAATTAAAATGGTTTTGTTCTCT
ATTTCAGTAGTCTTACAGCCTGTTTGCATTGTTTGCTTTGTATGTCGCATAGATTCCGACTCTCCCGACGCTCCAGTGTA
CTTCGAAATAGTCGCCGAGGTTCCTCCAGCCACAGAGCAAGGCAAGTCATGATTGTCACTTGAACATGTTGATCCCATAT
TGGAAATGCTCTATTGCTTTCCTTTAAATATTGCATTGTTTTATAATGTTACCATGGGATGATTACCTACTGTCTCAGCC
ATGCATGTTATTTGATACCTTTATACTTTGCTAGCTTGGGTTGTAACATGATTAGATGTTGGATTAGGGATTGCTTAGCC
ATGCCTAGTTCAACTAGTACACAATGGGGGAACTACATTAATACATAGACTTCAGATTCTAGTATTGATGTTGGATTAGT
GCCACCGCTTTGGTGTTGGTTAACTAAAATATATTAAATGGTGGGCTGTGGGTGCATGGCTTTGATGGTCGCGCCCATGG
CAATTAAGGACCGGTTCGCGGGATGCCCTGGAAGAATTTATCGTACTTACCACAAGCCAGCGTGGACAACGGCTGGGCTT
GTAGTGTAGCTTTCCTCTAGCTGACGCATCCAGGCAAGGGTAGGCGTGATGGAGCGGGATGGGCCCTGCGACGGCCTTTG
GTACTTCCGGATTCACCTAAACACGAGAGGGGACTGCCCGCTGCCTTGCAAGGAGTGGGGGTGAAACCTGAGGTATGGTG
TGTTTGGTTAGAGGGGGTTATGCGAAGGGTCCTATCACGGCCTCTTTCCAGTATGCCGTGGTGGCATGTCGGCGCACGGG
AACGTGTCGTGGGGCTGTGTCTTGTGGGTACAGTTGTACACCTCTGATCAGAGTAAAACTATTCGAATAGTCGTACCCGC
GGTTATGGGCGTTCAACCAGATTCAACGTAATTAGTCTCACCCTAGTTTAGTCTAATGGAACTGATTAGTTCAGGTGGTG
GTTTGGGCCTGTCCCAATGTGGTGTAGCGTTGAGCAGTGGCTGGTTTAATATTGGCTAATTATCACAACTGTTTTACTGC
TTTCAACTACTGTTTATAAATGCTAGCTTTATGCAAATGAACTCCTTTAGCCTCCTTTGGTTATATCTTGCATCATACCT
CCTCTTCCGGTATGACTTGCTGAGTATAGTGGGTAGTACT