Basic information from miRBase |
hairpin accession number: MI0007206 |
Located between position 5386107 and 5386292 on chromosome Gm07 strand - |
mature miRNAs for MI0007206: |
gma-miR159b (MIMAT0007351): ATTGGAGTGAAGGGAGCTCCA |
References |
[1]Subramanian S, Fu Y, Sunkar R, Barbazuk WB, Zhu JK, Yu O, BMC Genomics. 9:160(2008)., "Novel and nodulation-regulated microRNAs in soybean roots" |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
CAAAATTGCTCTGTTGATATTGAGTAATCACATAATTTCAGTCATGGGAGTGGTTTAAAGCTGCTATAAGTAGAAACTAT
ATGTTATGGGTGATATATATATACAGTTAAAGTGAATGTATTGTTATTTAGCACAAGTAGCTACTGAAGAAAAACTAGGT
GCACTGTACGTGTTCATCTACTTCTACTTGGGGGGTGGGAGGTTCTTGGAAAGATAAGTGGTTGCTTATTCATTATGCCA
TCTCGCATCCCTTTTTGGAGGTTTTGATTGGTTGTTGTACAGACAGGACTGACAGCCGAAGAGGTTTATGCTGCCACGAT
ATTTTAAAAGTATTATCTTCAAAAGGGGAGCCATAAAATCTTCCTAAAATTTATGGAATCTGTGAAAAAATATTGGTTCA
ATTGTGCAATGAACATAGTTTATTAGGAGGTTACCTTTCGATTAGACTATTGTCACATTCATATACACAATACATGTCCA
ACTTCGGCACAGCCCTTCATGTACATGATACATGTTCAAAATTCCTTTTTTTAAATCAACTATTTCAAAAACTTTATTGG
GACTTATCTCATTACACAAAAAAAAAAGCTACAAGAATGAGCCTTACACAGATGGAATGACATTAGTCGTTCTCAAATAT
ATCGAATGTGAAATAACTTGATAATAAAGTATACGTAATTTTATATTTAAATTATATAATAATTACTTGATTTTTTTATT
TCTTTTGTGTTTAAATATTAGGAATTTAATATCTTTTAAATTTTTATCTAGTAAATGTTAAAATTAGTAAATTTATATTA
TTTTTTTGGTATATTTTTTTGTAGAGATACAAAAGAAGGCATGAAAGAAAATGAAGAACTCGAGAGTCACCCTTAGCACG
TGAGGATCGTCCAACGCGACAATCTCGTTTAACGTCAGAAGTTACATAGGAAACCAATTGTCACATGCATGCACACTCAA
CGCATAATCACTTAATATCTTGCTCAGTGCATAATCAATGTCGAAAAATATGATCGTGCCACGTTTTAAGAGAAGAAAAA
AGAGGGAACAAATTATCATTCATTCTATTGAGAAGCAAAGAGCTAAGGCACTATCAATGAAGAGGAAGCTACTCATTTGG
AGCATTTCATTTTCATTCTTCTCCATCTTCCTCCATTTTCTTTGACTTCTTTTGCTCCTTTTTGTATTTGCAAGTCTTCC
ATGACAATGAAAAACTAAATCCTCATTCTTGGGAGCTCAACAATCAAACATTCTTAATATAATGACTTTAATTATTTGTT
TAATGTTATTTCAATATTATTGTCTATTTTTTGTGCTTATAACCGCGTTTATGACTTGATCATCCATGCTCATGTAATGT
TATAAGGGTTAAACATTGAAAATCATTTATCTTTTAAGAATTGGAAAAGAACATCCAAGTAATAAATCTCTAAGGATAAA
ATGTTATTATTTAATCTAATTTATGCATCTTTGTTTATAATGCAATTTGTCTAATTTGTATAATTTATCTCTTAAGAGAT
TATGAGTGAAATTAGATAAGTTAAACTCTTTCATGTGAGAAATCAATGAATAGAATATGTAAGTGGATGTAAATAATAAT
ATTGAATAAATAAAAATTATTAAAGTTACATCAAGAGTAATTCTGATAGTTTGAGCTCCAACATTATCGGTAACATTGTA
TTAACTATCACTTTACTGCTTCGAATGTTTATTTTTCTACCTTTACATACACGGGTTCTATAGTTTAATTTATATCAAAT
TTATATTTATGTATCACCATATTATAAATATTATAGTCAAAATCCTTGTAAACTCAATATTCCATCTTAATGTTTTAAAA
TACTACTCATACGAAATAGTACACTTGAAAGGAATTAACATAATTCTCAATTCCTACCAAAAGCTCAAATACTCAAAGTA
TAATACTGATTGAAAGTTGAAAAACAATATCTGCTAATACTGCTTTATGTGGGGCTAACACTTCCCACCACACCTTTTCA
CAGCATCTAATGCAGAGTGCATGCAGATCTTCAAGAATTCTTTCAAATATTAAAACTAGATGAACAACATATACTATATC
GATGGTCTAATTTTGCTGAAACTCCAACTTCGGCACAGCTCTTCTCGTCGTTGCTTCACCTTTAGGCAAAGCGACTGAGC
ACATGCTTTTCTTGCTAGAGATAGTAATCATAGCTGACACTTGACCTGTTGGATAAGGAAGGCTAGAGCAACCTAATTAT
ATAATAACAAAATATAAAGATGGCATAAAAAGGGTACACGTTTAAACATGCTTTTGTTTATTATTATAAAGACCACGTAC
ATGTAAATATATTTTATAGGACAAAATCCTGCTCAAGTAGGTTATCAGACTCAAACTTAAGTTGAACCAATCCTATGTCA
TTTTACTGACACATAACTTATTAAATACTTATTGTTTAAATAAAATATTAATAATTTCATGTTTTCTTTGCAATAATTTT
TTTCATTTCTTTTTTATTTTTGTCACCTTGGCTACTTCCTTAAAATACCAAAAACACATTTGCCACCATAGTAGGGAATC
GTTCATATTGATAATGAATACTGATAAGTGATAAGATAGTTAACAACTAATCGAGAGAAAGAAAAAAAATGGCAACACTC
ACAAATCCTATTATTTCAATTAGGTTCAACAAAAAAAAGAAAGAGAGAGAACAAGGAGAAAAAGGATAAGATTCTTCTCT
GGGTTATATCAGGATTAAAATAGCATCATGCATTAGATGAGTTCCTCCATATTTGTAATTGATAAATAAAAATCAGCACC
CATCGACAGCAACAACTTTTTCAGACACAAATGTGAAGACAAGATATTAGTTATATATATATATATATATATATATATAT
ATATATATATATATATCACAAAAAAATCCACAAAATATATAACTAAGGTATATAAACTGAAAGAGAGATAGAGAAAGGGT
TGTGTGAGCATGGCTATAACAAAATAAGGCCAGGGCTTGA