Basic information from miRBase |
hairpin accession number: MI0007207 |
Located between position 2804526 and 2804710 on chromosome Gm16 strand - |
mature miRNAs for MI0007207: |
gma-miR159c (MIMAT0007352): ATTGGAGTGAAGGGAGCTCCG |
References |
[1]Subramanian S, Fu Y, Sunkar R, Barbazuk WB, Zhu JK, Yu O, BMC Genomics. 9:160(2008)., "Novel and nodulation-regulated microRNAs in soybean roots" |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
TTTTAATGATGGCAACAAAATATCAACTTCAACCACAATCTAATATAAACCTTAGATTATATATATGCATGTCATGCTTT
CATGGTTGCAGGTGTTATGTTTCACACCCCTCTTTTCATGTGTTTCTCTTTTTTATTATTTTTTTTATCTTTTTAATTTC
CATGACATCATTTTGTAAATTTTGTTTAGCTTATTTTCTAGTTCTTATCTCTCTCCCTTTTATGGGTGTATATCCACTTG
GTATGAGAAATAATTATTTTCCTACATACATATGTTGCTAATCGCATGTTGCGGGGTTTTTCGAAGGATTGGAAACCGAA
TAGGCGAGAAGAGTTGTTTTTGAATTGAATGAGACTGATCTTGTCAGGAACATCAACATGTTTCAACCTAGCTAAATCAA
AAGTGAGTGAAGAAATGGAAAGCACGAGCCATCAACTGAAAAGAGAAAAATGAAACAACAGAGGGACAAAAATCTGTGCA
GAAGTTCTTTAGAAGTTAATATGATATTGAAAGTATTTGGCGGAAGAGATTGGAATGTTTCTTGTCTTTACAGTCAAACT
TTTAAAAGAGTCGAATATTCCTGCACCATACTTTATTTTTTATATTCTTGCGGATTGATAAAATTAATTCATTAATAAGA
TTCTTCCTATATGTTATTTTGAGATATTCATTTGCTCTAGCTAAAAGTTATATTTTTCATTTGGTAGTTTAGATTAGTGT
TTTTTAAAAATAGACTGATCATTGAATTGATAAAGACATTGTCTCGCGATTTTATTACTTTATTTATAATTAAATATTCC
AAAATAAGAATAATAATGAAATATATTTTTAATTAATATAATATATTAAAATAATAATTAAATAAATTCAAAAAATTAAG
TAAAATTTTAAATTGATACTCCTTTAATTTATCTCATAATGACTGATGTTTAAATTTTCCCACATGATGAAAAAAATTAT
GATAAAAATATATATAATTAATAATAATCTATCAATATATCTCATATATAAGTCTTTATAAAATCTTTGAGGAACCTAGA
TTTAAAAGAGTTGTTTTTTATCCTTATCTTCATTTCTTTTAAATATAATAGTTTTAATGATTAATTAATTTTAATAATTA
AATTTTAAAAAATAATTAATGAGAATAAAAGTAATTCTTTTTAGTTGTTGTTGGAATAACTTGATTCTCCAACCCTAATG
ATATATTTTTTATTCCTTACTTCTAGAAGTGAGATACCCAGTGAATTCATTTCTTATACAAAATGCCACACTGGCAATTT
TTCCATCAATTACTCTGCTGTACATAACAAAATATGAGTGTGTAATTCACACTCCCAGAATTAATAGAGCAAAACATCCT
TAGTCATAGTCAATTTAAAAATATTGCATATACTAGTGGTAGGATAGGACTGTGACATTTTCATAGCTAGGACATGACAT
CATATGGTATTCTTATTGTTCTTAAACACTTATAAAGTAATATTAACCTAATTGAATTATAGATAAATTCTTGCAACCAT
GTGGTTCAGCATGACTTATTCGATCCGATTTGAATAAAAACTATATATGTCGTTGGATTTTAAATTATTTCCCAGTTTAA
TAATTTGTTCTAAATTTAGGATTTAAAAAATTTATCCCCAATTTAAATATTTTCATTAAAAAAATGCTAACTAAATGGGC
CTTCACTAATTAACAATTAATTATAAATGTAAATGAAATTAGTACTTTAAGAATAATTATTTTAATCAAATTAATCTAAG
CATACACGCATGAAAACTATTGTTTTCTTGTCCAGAATGCGAGAAGGAATAAATCAGTTTAATATTATCAAGTTGCTATC
AAGTATCAACCATTGAAAAGTACAATGAGCGGACAGGTTTGACTTGAAGTTAGAGTTACACAAATATCCTCTATAAAATA
CCTTATAGGCGGAATTCACTGATGCAGACTACATTGTTAATACTATAGTTGTTATTGTCTATCACCTACGTGTAATAACT
TAAGGCACACAACTGGTATCACTAATAATGTGGGCTATGATTAGGGTATTTATAATTTCTTATTACATGTCACAACTCAC
AACTTTGTTTTGGATACATATAAACTTACGTCACACTATATATTATATACGATATTAACTTTTTATTTGCTTTATCGAAT
AATGGAAAAAAATTATAATAGGAAATAAAATGTAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT
ATATATATATATATATATATGTATTACGAAGAACTAAAGTTTAAGTCAATGGGTACTTAGTTCAATTATTTAGTGGACCT
TAACTCAAAACACGGCTTAAGTTATAAGTGTTGATTGAAAAAGTCAATATATCAATATAGAATTCTTAAGATGCACTTGA
AAATAGGGAATCATACTTAGACTCTAAGTAAGGTCATTTTGTTATATTTTGATAAATGAGAGAAAAAAATATTTATTATT
TTAATTGAAAGTGAATTTATTAATCTAAATGAGAAAATGATTAATTTGAAAGAATTATTAAAAATAACTACTAATTTAAA
TTAGGCAAGATTAAGCAACTTACTCTTTTAAATATGTAAAAATATAATTAATGTAAAATCTGTCAATCATATGTTGTATT
CCAACACAAGGACCAAAATGATGCATCATCAATACACACTATCAACTATAGATCCTAATCAGACGATTGAAATGTAAAGA
TCCCCAATCAGCTGGAATAATCTTTAAACTAAATTTAATGCCATGCGCTTCACCAATCATCGAACATCAAGATCTTGTTA
TGAGATTTTCTAATAAAATATTTGATGCTCAAATTCTATGGTCTAGATTACACATCAAGCCTAGGTCTTGGCCTATATAA
ACCCAATGTTGAAGAATTTCCAAGCATCGCAATCCCCTCTCAAGTTCTTAGCAAATTGCATATATGTATTTGAGTAGTTC
TTTTTTAGTTTAAACGATCTAGGATTTTGGGTATGAATAA