Basic information from miRBase |
hairpin accession number: MI0001015 |
Located between position 2625950 and 2626056 on chromosome 4 strand + |
mature miRNAs for MI0001015: |
ath-miR397a (MIMAT0000946): TCATTGAGTGCAGCGTTGATG |
You can find this miRNA in ASRP: miR397 (accession: ASRP1794) |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
TCGTGGCAAGTCTATTACCGAAAAAAAGAACTGGCCACATTATAGGCACAAGAACATTTTTCTACATAACACAAATCCAG
TTTTAACCATTAGAAAGAAAAAGAAAAACATATGAAACACAAAATAAAGCAAAAATATGATAAGAAAGTGATTATCATAT
TTTTCTAATAATAGACAGATTGTTTCAAAAAGAAAAATATACTTAAAAAGTAGAGAAACTAAAAACTGAGAAATAATTGA
CAAAAAGATTGAGAAATAAAAAGAATAAATGTAAATTTATTTATTTGATTTTTATTTTGATTTAAATTAAATGAGGTTTT
TATTTGTTACATTAACTGTTTAAATTTTATAATTAAAAGGTAATTTTTCGAAAATTCACAGATTAACAAGTAAATTTAAT
TTAGACAATCACCTCATACCAACTTCATTTTTGTTTAGGTTGTTTTTTGTCATTTCAGTTGGTTGATCAAATATTTTCTT
AATTGGCAATATTCTCTGTCAATCAAACCTACAAAGTCTCTAAGACATGTAAGTACTTTGGGCGGTGGCATATGAATCAG
TTGGACTAAAAAGGCAAATCTTGTTTTACATGATCCCAAAAGTTGTTTTCATTATTCCATACAAAAAACACGTTTTGTCC
TCGATATACACTTGTGTTGTGTATTTGTATGACCAAGATTTTCAATATCAGAGTTTTCTTATACATCACCGTGCCAAACT
CTAATTCAAACACCAAGATTTCGTCGTTTATATACGGCTGTATTTTTCCATTTCATTTATTGTTTGTTACACTATAATAT
CTACGTACTAAAGATTTTATAGTAGGAATGGATCAAGTTTACTATACTAAATGACTTTGAGTAATTTATATAGATAGTTA
TCTTTTGAATTTCTTGTGTAGGAGAAATGTTAATGATCTTAATCGACCAAGAGACTAATCAATTTAATGTCGCCAAAACC
GAAAGTAGACTTTATACAATGTTTGATAATTTAGTAATGTGGAAATAAGCTTCTATAATCACATGGGTTATATAAATGTG
GTCCTAACAGTACGTCATTTATACGTCATATGAGGTATAACAATATATAATAAGTTGGATATATTAGCATAGAGGACATT
TTTAAAAATGCTATTTAGCTAAGAAAAACACACTTAACTATTCCATTAAACGAATAAAACCCTTAGATCCAACATTAATC
AACTGTAACCACGCTAAACTGTGTTGAGTGACTAACATTGGCTTTTAAATGACTTGGTTAATTCAGTAATATTGGATCTA
GCTAAAACAGTTTGATCAACTTACATTTGAAGATATAATTAATGTATATTCGATTAACGAAGTAATTAGAGTTTTTCTTT
TTCTTTTTTTTCAAATCGGATAAGGTATTATGTTTATATTGTTGTCTACTTATAGCATAATCATTAGTGTCATTAAATGA
TCATATAAAGTCTTCGTTTATCTTTTGTATTTAGTCAACATATGCTTATGTTATTTTAGTTTGAGCTAAAAGTCAGAACT
TTTAGGAAGACATCAGCTATACATGTAAGAATTGAATTTTCAATCTAAAAATGTCCTGTTTAATACAACTAGCTCGAAAC
CTAATAAAATTTGATTTTACTATTGGAAAAAAATTCTACAATCTTACTAAACAATAGACCTAAACTAGCATTGCATGAAA
CTTTTCCAGATCAAAAGCAAACCAAATTTGATATCATTTCATATCTTTCGATAATTGAAAACCATTAAAGCCAAATCGAA
CTGAATTTTGTATAAATAAAACCATATAAACCGAAAACCCTATCCTTTCAACCTTTTATCTTTTATTCACTTGCATATCG
ATTTCATACATGAGCTATTTAGCTACATAAGTGATATTATTCTTGAAATTACAAGTTTAAAGAAGAATGGCATTATAATC
TTGTCTCCAATGAGCGGTGGTTCCAAACTTCTTCAACCTTTTATATCTTTTTCTCTTAAATCTTAAGATTAAACCCGTAC
CCAAAAAAGCCATTATCTTCTGTGATATCTTACCATTAGTCCCGACGTCTTCATTGCGCTTCGTACCGGTGAGCGAAAAG
GCAAATGACACTTTCTCAACGTCACAAGATCAAGTTCTCTCGATCATGACTAATTCAAAATTCCCCGACTTATTCGCGGA
AGTATCTATGTCAATGACACACCTTGAGGTTGCATGTGGCTTGTTGCTTGATTGCTTTGATCTCCTATCCTCTATGACTT
ATCAAACTTATCTATCCTTCTATGTTGTTAGTTTCTGGTCTTTGAAGTTTATTGTAATCCTTTTAATGCTTGATAATCTT
GTAATCTTTGCTTTTATGGGATTGACTGAATGAAACACAAGGCTTATTTGATAAAAAAATAAAAATAAAAAAAAAACAAA
AAACAAAACGAAAACCAATTATATGAGAAAGATCGAACCAAACCGTATAATTGTACAATCTTGTGAATGTTCCATGAAGG
AAGCTGGTGTTCATGAATCATGATCCTAGAGAATATTTGCTTCGAATTCACTTTAGTAGTTAAAGCTACTTATGATTGAT
CCCAAAAAGCAAAAAAAGGGCCTGAACAAAGAACGACGTCGTTGACGTAGAGAAGATCTCGTGTAGTACATAAAGTTGGT
GTTTTGCTGCAGTACACACGAACACCGATCGTTAGTACATTACAAACACTTGGACTATTCTAAAATTTTTAACTAATAAT
TTTCTTAACAATGTTGTTTTTAAATTTTAATTACTATCACATGAAAACCAAAGAAAAATTTAGTTTCATTAGTTATAATT
TTGAATACGAAAAGAAACTCGGAACCTCAAAATATATATTCTAGTATGGTTTGTAAGTAGTACACAGTACAAACAACAAG
CATTGTACTGCTTCTAAACCAACACAAGCATTGCAATGTCAGCTACTCCTCAAGTATAAAATCATGTTTATGTTCATTTC
TAAGATGATAGAAAAAAGCATGAGGATATTTTTTCCTGGG