miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse



Basic information from miRBase
hairpin accession number: MI0000674
Located between position 764722 and 764858 on chromosome 03 strand +
mature miRNAs for MI0000674:
         osa-miR166e (MIMAT0000639): TCGAACCAGGCTTCATTCCCC

References
[1]Reinhart BJ, Weinstein EG, Rhoades MW, Bartel B, Bartel DP, Genes Dev. 16:1616-1626(2002)., "MicroRNAs in plants"




>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
GTTCGCCGCCGGGTCGCGGGGATCGCACAGCTCCGCCGCCGCCGTCTCCCCGCACCCGTGGTTCGACGCGTAGTCCCCCA
CCCACGCCGACCCTACGTACGTACGTATCACCCAAATCCAAATATATTACTGACAAAACCCCAAGGAACAACGACCAAAT
AAAACGCATGTACAATACATCTCAGGCTTAATTTTGCTTACTCGCAACAGTAGTGGATGCAGCGGCGACGACAAGGATGA
TAAGCAGGAGAGGTATCATCAGAGACGATTTCTTGGTGTATCTCCTGCCCATTTTCGGTGTGTTTCAATCCAAGGTGATC
AGCTCATATAGTACAGGCAGGTGTGTAGTGCTCAGTATTTATAGGAACGAGAGGTTGTGATATGTATGTCTACTCTTTAA
TGTGGTGCGAATTAATTGATTGATATAATAATATACTATCATGGAAAATTGACATATATATATCGATCTCATCTCTGTTT
CTTACCATTTAACGCTTGACTACAGTACTCCATATTTCACGGTGTCATGGTGTAAAATTGGCATGTACATATTGCACTAA
TTGATGCCGCTGGTGATAAGCAGCGTACTTCTTGTTTTAGCTTTGCCTTTTCCTTTTCCGATCGCAAATTTTTACTTGTC
TCTGTGTAAAAGAAAATTTAAACACAGTACACACATCCATATGCTCATATAAACATATGCAGACTTCTATAAACGTACAC
ATGGACATCATACCTCTATAAGCACAATAAAAAACAATACCAGTAAATCTTTTCAACCTATTAAACACATATTTTATTAT
TTATCTCCGTGCGGCGGTGGAATATATTCACATGCCTACAAGTACATAAGATAGAGAAGCGAAAGGGTAGCTCATGTATT
CTTGGTCAATTGGGCATGATGAGTTCAAGGTCGCGCGCAGAGGGGAGATTGTGTGTCCCTGCGTATACCATGCATGGACT
TGTTAAAGCATGAATGTAATTCCTATTTTATCACTAATAAAGATATTTCTTTATGCTTAAAAAAGTTATTATACATAAAT
AATTAAATATATGTTTAAAAATTAATGGTGGTGTAAATATTTAAAGACAAAGGGAATAATATAAATGATCCTTAAATAAG
AAAGTCACTGTACTACTGTGCATGCATGCTTGCTCTACATATTTTCTGGCCTTCATTTATAATTGGGAGTTGGAAAATAT
AATTACTATCATATATTCTTTTACCTCCTTTTTTTTCTTCTATGCCAATCTTTTCGCCGCATGTTGCCCTCACTTTTATA
CTGATTCCCAGCTTAACTATATATATCGCTATATATGAAGAACAAGGAACATATAAGTGGCACTAATGGACTAGCCAGTT
GTCTGAACACTCTGTGCACTACTATTTTCTGGTCTATGTCTCCCAATGCATATTTGCAAATCGAGAGCTTTCCCCTGTTT
AACAGCTTCAGTTACATTCTGTTTCGGATAGGATATAGATTTGGCCGAATTAATTCCCTTGAAAGATCAAGATTTATCGT
GTACTATAATCGCGTTGCCCCGATTCGCTAAATCAATAATGAAACGAGTAACGACAAATCGATATGCAACAATAAATTTC
TTAAAGCTACAATATTTGGCTCTGTCTTCCAGTTAACATGGACGATAAAATCCATGGCCCAATGCCACTAATCCTTTCCA
AATTCAAACGTACTAGCTCTCTTCTTCGTTCCTAAAAGACATGTAATCAAAGACAAATTAGACAGTAAACTAAAATTTTA
CTATGTACTTTATTAATACGGAGAGAAAACTATAAGGGTGAGAAAAATGAGCAGTAGATGAGAGTAGTACTGGTTTGATG
ACTAAAATGAGAAGAAAAATAATAAAGTACTGCTATAAAAATATTTAGCTAGCAGGGTCTACTTGAAAATATAGTTTTCA
TATGACAAATTTTTAGATTAAAGCTGGAGCAGTATTTTATGAACAGGAGGCAGTAAGCAAAATGTACGTGTTGGTGACTT
AGCGCGGTACATACGTCGATTGATTATATCTTATAGGAGTACTTGAGTGATCAAGTATGATAATCTGCGTAATTAAACAG
TAAACACCAAATCGATCTAACACACCTTCTCGTTGTTGTGTAGGGAGAGCGAGGAACAGAACAAGAGCAAGCAGCCAAGC
GCAGAAATCGAGAATCTCGAGGCACGCATCCAACCGCAACAACCCCGCCGCCCTCTTTCGATCGCCTAGGGTTTTCCAGA
TCAAAACAGACGGCTCGGATAGTCGGATGGCATCTCACCTGGCCACCATTTACGGCTCCCTGGACAAGCACTAGCTGCCT
TGTATTTCTCCATTGAATCCCTCTATTCATAGCTCTTCAATGCCTTCTCCTCGCCATGTAATATTTCTACTGTGCTAGGA
CCCCAACTGTCAGCCACTGGGTGTACAGGGCTATATCTACCTTACTGCAACTGGCTAGTGGGCCCGGTAAGTACTATATG
GCCTGTTTTGTCAGTGGCTATGTACTACAGCGAGGTCAAAATGTGGCTCATGGTTCATCACTGTTTAATCTTGCATACTC
CTACGATGTACAGGAGTACTAATCATTTAAACCATCATCACTTCAGCACCAGAGTGTACAGGGTGTGTCTCCCCTACTCC
TTGTGTGTGCCTCTCTTAGGTGTGAGTTTGAGGAGAAGGTGATTGAGGAGATTGGGAATATATGCCAAACGAGGTGAGTC
ATTAGCTCATGATTAATTGAGTATTAATTATTTTAAATTTTAAAATTGGATTAATATGATTTTTAAAGCAACTTTTCTAT
AGAAAATTTTTATAAAAAACACACCGTTTAGTCGTTTGGAAAGAGTGCGCGCGGAAAACGAGGTATTATCTCCCTCAATG
TTACCCGAACGAACGCAGCCTTAATCTATACATAGCTCCATTGCCTCTCTGCTTCTTTGGCATAGACGGGAAGGGAAACA
AATGACACAATGCTAGTGATAGAGGGGATTGAAGGAAGCT