Basic information from miRBase |
hairpin accession number: MI0002228 |
Located between position 7412220 and 7412362 on chromosome scaffold_14 strand + |
mature miRNAs for MI0002228: |
ptc-miR166k (MIMAT0001934): TCGGACCAGGCTTCATTCCCC |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
GGGTTTTATTAGTAGGTAGTATTTTGATTGATAAATTAATAATTATTGTATGATCGAAAGGGTGGAGTCGACAACCTGGG
TTGGAGATGCAGGATTTGACATTTACGTGTTGTTTCTATCGAACACACTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCATATATATATATGAGAGGAGAGAGAGAGAGGAGAGAGAGAGACACACACACACACACAATTTTCAAGAC
TGTGAAAGCGTTGAAATATGTAGCCAGTATCGTCCTCTCCGTTTGTCACTCTGATGTACAGTATTTGGAAAGATAGAGAA
GCATGGACCAGATGGTGGTGGAGCCTTTGGTTGTGTTATAGAGGTGATAGCATGGCAGCACTTCTTACGGGCACCTTCCG
ACCCAACCTCACATGAAAAAAAAAATCCCTGAATCTGGCAGTACAGGTACTTACTAATCATTCCATAATCGTTAAGGTTA
ATTAATTGCGATTAATAATGTCTTTAATCAAATGGTCACGGACCATTGTATCAAAAACCTGATGAAAACAAGTGCCCGCA
ACCCTGCCTTACCACGCTTCAAGGCAGCTGTGAGGAGTAAAGCACCATAATTTTAAAAAGAAAACAGCTAGCATTTCGAG
TTAATTATATTTTAAAAAGAAGAATGTGACTCTGATTCTTCCACGCCATGGCTTAATTATACTATTTTCATTGACATAAT
TATGTAAGTGTCAAATGTCAAGAATCCCACTGCTTGATTTACCGATTGAAAGTCTTGTCTGATAGAATGCTAATTAATCT
GTTTGTGTTGTGAAACACGCGGAAAATTTACATGCAGTAGCCTAAAAAATCTTCATTTGACTATTAACAGTACTGGATCC
AATTTTTTTGTCATTGAAAAAATTGATAAGAGACGGACATTTAGGTAAGGCATCTTTCAATGTTGCCGATTTAACATATA
CTGGCAATTTATTACTGCAACTACGACTACCATGCATAGTACACATGGTGATTTGTGACCAAATAAGCAATTAATTAGAA
CCTCACGATCCATTCCACTAATAATTTCAAACGAGGCGAGAGGCACATCGAAGAGAGAGAGGAGAGAATGGACCCAAGGA
TTTTTAAGGCGATGTGTATAGGAAGATGATGGTTGTGCCAAGTCTCTATCGGGACACCGAGAAAGTAGATGACAGTTTTT
AATAAGCCAAATAAATCTTTATCTCAAGGTCACCATTTGTTTCCTTCCGTCAACAACAATAATTTTAATAGAGTAATGTT
ACATTTCTATCACTTTGTTTGGTTTTTTCAAGAGTAAGTAGCAAGGTCAACTTGGATCCAAGAGCATGAAAAGCTGTTGT
GGTAAATAAATTAAATATTCAACCATAAGCTAGGATGCTGTATGCTGAATCCCCCATGCCATATTCTTAAAAAAAAAAAA
AACAGAGAGAGATTAACGCGAATCATGTTAACAACGTCTTTGATCCTTAATTCTATCGCATATCATAGAAAACAAGTGAG
TTTGGAGCGTCAAACAAGCTCAGTATGTCACATCGAATAAGTGCTCAAAAAACAGTTTCTCACCGAATGAAAACGACAAA
GCAATTAAGTTTTACATGGTTCTCTCTCATCCGAGTTAGTGAAGTTTACCACTTTGCACAAAACTCAAAACTTCGTAAGT
ACTTCATTTTGTCAAATGTATTTTGCATTTTCTTTTCTATAATTCAATGGAAAATTTTAAAAACGTCCTCACACAGCTGA
TCTTGTTAACAAGGGAGCTAATTTATATTTATGAAGTTGAAAGAGAAAATTGGATTTAGTTATGAAACAACAGAGAAGGA
GAGAACAAAACTACATTCAACATTAAAGAACACTCCATGGTTTTAGCTTCAATGTAAATCTAAAAAGAAAAAAAAAAACA
AGAAATTGAAGCAACAAGAAAGAAGGTAAAAAGGCAAAGTGAAAAGGAAAGCGTGGACCCCTGACTCTATCTGTCGGTCA
TCGCCTCGGATTTCTCGCCTCTGCCTAAAAAGTGACACGGCAGACGAGGGTCCATTCTTTCATGCCCAATTTTTATTTTT
ATTTTAATTCTTCTACTTAGGGATTACTATATTCTACTGTACCGTTTAATTTTCTCATTCCAATCGCAATTAATTGATTC
GAAAAGGTGTAGATATATATATTAAATGGGCCTTTCCATTATCGGGCAGCTCAAAAACTCAACCACTCCTCTGACCCAAT
TCTATGCCTCCTTTACTTTGATTCCTTTACTATCTTCTTATCAATTATTTTGTAATCATACAATAGGTTTTCTTAGCATA
GTACACACCATTCTACGGTCCATAATGGGTATTTAATTTCTAGGCTACATAGTACAGTAGACAGCACAGTTACAGTCAAC
AGTGTTCGTGTTTGATGACACCATCCAACCATCATCTAATGGTGGGTTTCACTTGGGTACGTACATGTTCAATCTCTTAC
GAGGTGTTACCATCACAGTCATCTGGAAAATCCAACGGTGGATAAGGGTTTCAAGAACAGAGACATGTTTCATGGAGTCC
ACCCCTCTATTTTAGTAGTGGTGGTATGATATGTATGAACATGAAAGTGAATGGGTTCTTATTAGAATAGTATTTGATTT
GTTTTTTCAGAGATGATGAGAGGGAGGGAGGGAGGGAGAGAAAGGTGCATGGGGTCGTGGTCATTTCTGGAACTGAGAAA
CCCCAGCTGGTAGGGGCGGGTCTGCACCTATCTTTTGTCTTTTTTAACGTTGGCTTTCCACTCTTTTTACTCTTCTAAAT
ATAGCCCCCATACCATATCATTCTCTTCATCATCACCAATCTTTCTCTCTCTCACCACCCCCCTTCAAGATAGGCGAGAC
TCTTGGGGGATAAAGAGAATAGTTTGAGAATCACCGGCACGCACACACACGAAATCAAATTCCATATATCTCCCTCTTTC
ACTTGGAAGAATTGATCAAGATTTGCTAACAAAGGTAGCT