Basic information from miRBase |
hairpin accession number: MI0000208 |
Located between position 8108072 and 8108209 on chromosome 3 strand + |
mature miRNAs for MI0000208: |
ath-miR167a (MIMAT0000196): TGAAGCTGCCAGCATGATCTA |
You can find this miRNA in EMBL: (accession: AJ493650) |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
GCAATTGTTATTTTTTTATAAAAAAAATTCAATAGTAAAATATGTATTGAACTTTGCCGTTATATACAAAAAAGAACTGT
ACTAAAACCTTTTTACATATTTTACAGTACACTGAATTTTCATGATATTAGAACTAAAGAACTTTGTTTTTAAAACATAC
CACAAAATTATAGCAAATTAACTTTAGTCGTAGTTTTTTTAATTTTATTATAATATTGTTGGCAATCACCGATTAGGTGT
GGCTTATTAACGTTGGTTGGAATTTATAAATATGAACACTTTTATTTGACTTCGGGTGCAAAGTTAATGATTTTATCAGA
CTATCAGTCATCACAATCAACTAACTCTTTATTTAGCATCTAACGTTGCTTTTGATACTAAAGAAAAAGAAGAAAAAAAA
CATTTAAATTATAGTACCATTGTATTCGATAGATGATCCAAAACAAAAAGATAAGTTCGAGCATCACATATATAGGTCTG
ATCAAGTACTTCTCAATTTGCATACGTATACATCAAACTGTTACATCAGCCTCCTCGTGAGCCATATCGAAACATGTATG
ACAAATTTGTATGCCTATTCTTCGCAATTATATTCGTGTATCGAACTATATTATTTAATTTATACTATTTTTAATTAATT
AGAGAATTGATACACGAGTAATCTCATAGCTGATTTTGTCTCATATAAACGGTGTTAACAAAAAAAAAGAAGAAGGAATT
AACGTACATATGCTTTAGTACACGAACAATATCGCTTCAAAATTAAACTTGTTTATGTAAGTTTCGTACAAAAATATAGC
ATAGCTTATAGTTCACTATCACTACGTACGATGAAATTCTTCAACCTTTTATATATTCACTATTAGGAAACGGATGAAGT
ATGATTAAACCAATATAGGTTAATTCTTTTACGCAAAAAAGTCAAATCATTAACAAATTTAAAGGATTAAGTTTCGAGTA
GACCGTGACAAATCACTAAACTAGAAATTTTACTTCAGCAGCTTGAAGCTTATAAGAGTAAACATCTTTACCCTTACTTT
TGCAGTTAGTGTTGTTTGACTTATTGGTACCAAACTAAAACCTTAAAAAAAAGGAACAATGAAATAGAAAAAACTTCTAG
ACCAATCAGATTTTTTTCTTTTTATCTCTACCAAATACAAAAAGTCGTTGTCAAAGATTGTCCATATCAATAATTTTCAA
TATCTTGCAATATCGCGTAGCTGTCACAAACCAACAGCTTGCCCAGAACCTATCGAATTTTAGGTAGTTTTTGCATAGAA
ATGGTATCATCCCATTGTTAGTGATAAGGAATCTTTTTGAGGAAAGTTGTTTTATTATTCAATTTTTCTTTCTATACATT
TACAGCAATAAATAATTAAATAACACCAGTTTCAGATACTTTATTTATTACATCTTCTATATTAAAAAAAAAAGTTGTAA
CGTCTAGAGCTATTAATCACTATACCAGCGGTAATTGGCATTGTGGTAAATTACAAGAACAAATGGCCGTAAAACATGTG
AAGTCGGTAATTAAGCATGGATACTGTATGTACATAGATAATTATATATGTCACTTTTAGATAACTAAAATATTTTTGTG
ACAAAGACTGGCACTTGAGTCAATAATTAGAGATTAAAAAATATATAAATCTCATTTATATATCATGAGAATATTCCATA
TGAGCTCACTTAGGTATCACATGTATTGGTTATAATACCACTCACATACAAGGTTTTTCTTTTGTTACTTTTCCTAAGAA
AATTTCTATAACGTCTTATAAATAAAAACTATAAAAATATCTCCACAAAAATTCTTAATGTTTTTTTGTGTGAGTTAAAC
TGTTATTTATTGGTATGTAAGTGAGTTATAAAGTAGTTGCACGATTAGTTTATATTGAGGCCAGAAAAAAATGTAATGCT
TCACATAGTATTATATAGTCTAAGAGTTCCCGTAGGTTATACTTTATGCATGTGTTAACCTCACTTTTTCATGGCTTAGG
TCTTAATAATATTGAATATGAATCATAAAGATAATGTCTCAGCGGTGGAGTTTTGAAAACTATATTAAACCTAATGATGA
GTCTAATAAAGCCTAGTATCAATCAAATAGGACAACAAGAAAACTGTCATTTTTTTCTCTCCGACATAGAAAATATAGTC
CATAATTCTGACCATATATATAATTAAACAGTTAATATAAATAAACCATATATTTCGTACTATTATGAATGAAATTAAAT
TAACTTAATTAAATCAAGACCGGATGCAAAATTACAAATCGTCCAATCTTTTCAGGTAAATGTTTGATATCCAATATTAA
CAATTTTCATAGTAATTTACAATATGAAAGTATAAAAACAGAAAATTCATCCATTGATTAACAAGTCAAAGTGGTAGAAA
TTTTACACAACATGTTATTACATGCACATCCGATTAAAATCTAACATCTTCTAGAACATTAATCACATTATATAATAGAA
AACAATCAATAATTATTCATTGGAATTATTGGTTATCAAAACAAAACTTTATTTCCAAAAACCAAGAATAAGAAGATAAA
ATAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAAAGAGGGTCCCCATCAATGTAGTAGAGAAGTAATTAATAGAGTTACAGAAACAAGCA
AAAACAACACACAAAACTAATCTGTCTCTGTAAGATGATGAGATTAGAGAAGTGCATGAGGCTCGGAGAATCGGCGTGAC
ATTATTCAATTTTATTCACGGTTCTACTTTGGACCACTTTTCTTTAACGCCTTTTGTTTGTCACTCGTTCTTTTTTTCTT
TCTCTCGATTTTATTTCACTTTCGACCCTTAAACTCTCCATAAATTCCGAAACTGATCCCTCAAAAACATTATTCTATCT
CTCTCCTTCACGTTCTCCTCCTTATCCCTTCTATATAAACACTCGTCTTCTTCTTCACTTGATGAACAGAAAAATCTCTC
TTTCTCTTTCTTGATCTGCTACGGTGAAGTCTATGGTGCA