Basic information from miRBase |
hairpin accession number: MI0002237 |
Located between position 22458162 and 22458250 on chromosome scaffold_5 strand + |
mature miRNAs for MI0002237: |
ptc-miR167c (MIMAT0001943): TGAAGCTGCCAGCATGATCTA |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
TAGTGAATACACTTTTTTAAAAAATATGAAACATTATCCAACAAATATAAATATAATATATTATAAAACACCAATAAATA
TCTTATATAATTTCAATTTTATTTTACAATGAAACATCACATCTACATTAATTCAATATTTCTAATTGTAAATTTTGTCT
TTGTTTTCTTCATGTTTATGTTAAACTCATTTTTTTTATTATTGAATTCAAGGTCAATCtcatcatttttcatctatctt
tttatatccacatgtattcaatatgacatttaacttatcaacatcaacttaggtattttcaatgaaattaaaatttaaat
tttctaactcgatagatggatcaattcgatatgaattaattaactcgtgtatttgaaagattttctctcctaaatacttt
attgttattatctttaacaatttgaacatgacttttaagtttggttttcactacatataaccaatcaattttattatgat
tttttgtataaaaaaagtgtataatacacttggtggaattgtttggaaaaaaataaaaacatcattaatgttatgaagac
catttcttttatttatttaaaccaaatcattgtgaaaatctattctaattttttatcggtatgatatcaatagtatttga
ataataaatattatatcttgcgatctattacatcgcaactcaataacttcatgtaacttgcaataataattaattttaaa
ctcattgaaagtcaaatcttttacataaatcttattattatagattttttttacccttgtcatattgttcgatatcaaag
actttcattaataaaatattcattataacactgaactattctcttccaagacTAAAAGATAGGAATTCAATCTACTAGCA
TTGACTCTTATGTTGAACATTGTGTAAAAGTTAACAAACATTAACGATCAAAGAAAAAACCTAATTAAATCTAAACTTTA
GAGTTATGAAATATTAAATACTTTCTTGTGTTTTAAACACATAATAAATTTTTTATCTTGTAACTAGAAAATTCAAGATT
CACTAGCATTTGAATTTTGAAATAACAGTAATTTATAATATTGTCTAAAAGAAAGTTTATTGAATTTAGCTTAAAAGAGA
AAATATAAGATAAAATGATTTAAAAATATATAATTATAAAATTtacttaatgaacaaaaagtattaatttatcacagtta
aatagtacaaaattatatacttgtttcaatttgatgatttcaatgaatcttcATTGACAATCGTTATTTTCATCGAAAAT
TACCGATGAAATATTTTATGTCGGTGCTTTTATTGCTATTTATTAATTTTTTAATAGTGATTGATATGGAATTTATAAGG
ATTTGATTATTATCTTGAAATAAAAAAAAGAGATAGAAATAATGAAAATGTCTCTTTATATTTTTTATTTTAAAAGTAAG
TTTTTGACTTTAAATTTTTAACCAAATATATATATTTTTAATTTTTTTTAGTTTTGCTATTTATATAATGTTTATGTCTT
GTCTTGTCCTAGAATACTAACAAAACACATCTTAAAAAACACAAAAAACAATTGCCCCGTTAATTACTGCTAGAATCGTG
TGCAGAAAAAATGGAGCCGAATAATATAAAATGGAATCCCAATTATTAAGGAGCCCATGAAAATCTAGCAAGTGAACAAA
TCACATTCCAAGTGCTTTTTTCTTTTGATTGCAACCGCACTAATCACTTGAAAAATCATGTGAAGGTACTGGAAAAGCAG
CTTTGCTAGGAGTATGAAAGAATACTTACAAGGTGAATTAGTAGTTAATCCCGTCCTGCATGCTTTTAAAAAACAATCAA
TATTCAAACCAAATAGATGGGAACTCCTAACATATTCTTTAGAATATCATGTTTCCCACCTTTTGAGACCTGGATTTGGA
TATATTGGGATTACTCTGCGTCCATCTGCTGGTTCCACTTGCACAAACCTACCACGGGGATCAAAACAACTTGAAAGAAA
ACAGAATGTCAAAATCAACAACATACTTTATCAGAATTTATATCATTTTCTTGTTTTTCCTTTGTCAGATGGACTGTTCA
CTTTACGGATTAGATTACCAAATGTTTGCTTAATAATGCCTTCAAAGATAACTTTTAACATGTTCCTGACAGATATTAGA
TGCATGAGGACCTAGTCTCTGACAAATGGCATGCCGCATTATTCATAAAGAAAGAAGCTAAAGCTTCTATCTCAAAAAGA
ACAAAAAGAGAGAAAGAAATTAAAGCAAGGAAGAAATGCTATCTATCTATTCTTCATTTAGAACAATATTAAAGGGAAGA
TTCTTCCATGGAATAAAAGGGTATGCATCAAAATATATACCACTGGAGTACATGACATGAAAGACAAAGAATATCGTATG
ATCCTTCCCTTTCTCTTGGCCTGAGCAAATAGAGCACATGGTTTTGTTAGGTCATGAGATTTCTAATTTCCCCAAGTAGC
CATGAAAAACAGGGCCCCATATATAGATTAATTACTATAGTTATGCTTAGCACTCTTTTTTAGGTTCATGGAGGATGATA
GTACTTGCATATTGAAGGAGTGAGAGGTGGATAAAAGTGATAAGGGTGGTAGGGGAGAGAATTTGGAAGAACTCGCTTCC
TTGTCTGCATGGTGGTGGCGTGGGCATGATAATATTCATTTTGTCTTCGCTTTGGACCACTGCCATCTGTTTTCTTCCTA
ATTTATTACTATATCCTCATAATATAAGCTTTTCAGTCTCCTTATTATAATCAAAAAGATTAAATAAGCTAATCACACTA
ACACCAAGAGACGAGGCATTCTTGTCTAGGCCCTTGGCCGCTATATATATCCTTCTCTTCCTCTCTTCCCTAGCAGCAAC
CCCATATGCAGAGAGAACTCAAAACTAGTTACATTTACATCTCTCTACCTCCCTCTGCCCCCCTCTCTCCCTGTCTCCCC
AGATCGCTGGATATTGATCCGTTGATCATCTCTCGTGCAC