Basic information from miRBase |
hairpin accession number: MI0001021 |
Located between position 23345377 and 23345511 on chromosome 1 strand - |
mature miRNAs for MI0001021: |
ath-miR399b (MIMAT0000952): TGCCAAAGGAGAGTTGCCCTG |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
ATTGGCAAAAAAACAATTTTGTGACTACTAAAGCAACTTGTCTTGGCTGCTTCTTTTTATCAATCATATATCATTGACTC
CACTAAGATCTAGTATTTATATAATATTTTGTGTAGGCCTTATTACCTTCATGCTAAGCTCGTGTCTTCTGATCTATTTG
TAATTATTTTAATCTATTTTTTTTCAGAGATTTAATCTGTATAAGAAGATCTCAAGATCAGCTTTTGTGTATTGAAGAAG
AACTAGGAAGAACGAGGATAGATACAGGTATTATTTTTATATATCAAGATCTCTGCTTTTGGCTTATTTGTTTATCATCT
TTTTCACTTGAAATGCACGAGTTTTAAAGTATAAATAAGCTTTGTGTTCTTGTTCTTGAGGCTTTGTGTTGTGTGAAGTA
GAAATAAGCTGAATTTGGATTTGATTTGATTTGGTATTAAATTGTCCTCACTGGTTTTGCGTGATTATATCATCTATGCA
CATGGCTTGTAGCGCTGACTTGCTTATAAGTATTTTTATAAAACGTGTTGCGTTCTTGTTTTGGCTTCTATAATTGTAGT
TTTAGAATTGTGCTTGAGCACTAATCAGATTCACAGCAATTCAAAAATCCATTTAGAGGTATAATTCCTTTTAGATGCTC
TTTGATCTTTTCGTGCTTGAGTCAGTTTGTACTTTTGTCCTTGACTCTTTCTAAAACAGGTTTTGTGTTAATCCCTTGAA
TCTGCTTTATCGCTTATGTCTCTTGAAATCTATCTATGTTGCTCTCTTTGTGACTGTCTGATCATTAGTTGCAAAATGTG
AAATTGTCTGTGTAATGATCAGGTCGAGTTTTATGAAATGTTGTTAGCTTCCATTGAGTAAGGCTTATTGTGGATTGGTG
GATTGAAATCTTCATGTAACTATAAGTATTGAGGAGCTTTGAATGTGGATTTAAAACTGTTCTGGAGTGTCATTGACTTT
GGATACTATTATTATGTATTTGTATTAAATTCATATTATGTATGCCACAGACCCATTCTCTATTTCCTTCAACAAGTTGA
CAGAGAGCAAAATCTTTATATACGTGATATCAAAGTGTTCTAATTTCCACATTCTTCTCACTTCTCAGGCTTTAATCTAA
ACTTTGCTCTCTGCTTTCTGCGATTAAAAGATGGTGGCTTTTGGGAAATACTTGCAGCGGAAACAAATCGAAGAATGGAG
TGGGTATGCATTTGCTTACGACATCTCGGTTCTAGCCATATCTTTTGATCATCTGATTTTTTTTTCCTAATGAAGTTTTG
ATAATTCCCTTGTAGCTATTATATCAATTACAAATTGATGAAGAAGAAAGTGAAGCAATATGCTGAACAAATCCAAGGCG
GATCTCAACATCCTCGCCATGTTCTCAAAGATTTCTCGAGGATGCTCGATACTCAGGTATGTTATAGATAATTGTCGAGA
TGATCTTGTTTGAGTATTATCCTCACTGAATTGTTATTTTCTGTGCATCTCCGAGGTTATATATGGCTACATACGAGTAA
TCTCAGTCCAGTGTTTGTCATTGTTTCTCTTAATTAGATAAGACATTTAAGAAATAAACCATTCTGATGATCAGATGGAA
CTCCTCTAAAATGTTGTTCGAGATATTGAAAGTGAATCATTGTTTGCAGATTGAGACAACTGTCCTTTTCATGTTGGAAC
AACAAGGGTTGCTTTCAGGGCGATTAGCCAAATTGAGGGAATCTCATGATGCTATACTTGAGCAGCCTGACATATCAAGA
ATTTTCGAGCTACGTGAAGCATACAGAGATGTTGGACGAGACCTTCTTCAGCTCCTGAAATTCGTTGAGTTGAACGCCAT
TGGTCTGCGCAAGATACTTAAGAAATTCGACAAAAGGTTTGGATATAGATTCGCTGATTATTACGTGAAGACCCGCGCTA
ATCACCCTTACTCTCAGCTTCAACAAGTTTTTAAGCATGTGGTAAATGAATTTTTCTTACCACCCTTTCACTGGTTTCAT
CTGTAGGCTCTTCTTGTTAGGAATCTTAAATGTTCTGTGTATGGAATTTGTAGGGTGTTGGAGCTGTTGTTGGAGCAATT
TCCCGCAATCTTCATGAGCTTCAAGAAAATGAAGGAAGCTTTTATTCAATTTATGACCAACCCGTTCTTCCGGCTCAGGT
ACTACATTTCAAATATATCAAATCAGAATCCTCTATACAGGCTTTGTAAATCCTAATCTTTTCCTCAAAACTCCACAGGA
TCCAGTGGTTGAGGCAATAAATAACGCGGTGGACAAGTTAACCTTCTCGACGAATTTCCTCAACTTCTTGGCACAACATG
CTCTTATCATGCAAGATGATTTGGTGACTCCTTCAGAGGATACAATCGATGAGCGGTCTTACCATTTTAATTCGTTACTC
CTGAATCTAGGAAACACATTTTTGTACATGGTCAACACTTATATCATCGTCCCTACAGCGGATGACTATTCGATGAGCCT
TGGAGCTGCAGCAACGGTTTGTGGTGTTGTCATCGGATCTATGGCTGTGGCTCAAGTATTTTCATCGGTTTATTTCAGCG
CATGGTCCAACAAATCTTACTTCAAACCTCTTGTGTTTAGCAGCATCGCACTCTTTATCGGAAATTTGATGTATGCGTTG
GCATATGATGCCAATTCCATAGCGCTTCTTTTACTCGGCCGTGTCTGTTGTGGGTGAGTTAAAAGTTCAATCATTTTCCT
ATATATCGTGTCAAAGAGGAAACCTTTTCCTCAACTGATTTCAACCCTTTAAATTTGCAGGTTGGGATCAGCAAGAGCTG
TTAACCGGAGATATATCAGCGATTGTGTGCCTTTGAGAATCCGAATGCAGGCATCGGCGGGTTTTGTGAGTGCAAGTGCT
CTTGGAATGGCTTGTGGCCCTGCGCTTGCCGGTTTACTCCAAATCAAATTCAAGTTTTACAAGTTTACATTTAACCAATC
TACTTTGCCGGGATGGGTTATGGCTGTGGCTTGGCTGTTC