| Basic information from miRBase |
| hairpin accession number: MI0005402 |
| Located between position 22577375 and 22577733 on chromosome 1 strand + |
| mature miRNAs for MI0005402: |
| ath-miR846 (MIMAT0004269): TTGAATTGAAGTGCTTGAATT |
| References |
| [1]Rajagopalan R, Vaucheret H, Trejo J, Bartel DP, Genes Dev. 20:3407-3425(2006)., "A diverse and evolutionarily fluid set of microRNAs in Arabidopsis thaliana" |
| [2]Fahlgren N, Howell MD, Kasschau KD, Chapman EJ, Sullivan CM, Cumbie JS, Givan SA, Law TF, Grant SR, Dangl JL, Carrington JC, PLoS One. 2:e219(2007)., "High-throughput sequencing of Arabidopsis microRNAs: evidence for frequent birth and death of MIRNA genes" |
| [3]Rajagopalan R, Vaucheret H, Trejo J, Bartel DP, Genes Dev. 20:3407-3425(2006)., "A diverse and evolutionarily fluid set of microRNAs in Arabidopsis thaliana" |
| [4]Moldovan D, Spriggs A, Yang J, Pogson BJ, Dennis ES, Wilson IW, J Exp Bot. 61:165-177(2010)., "Hypoxia-responsive microRNAs and trans-acting small interfering RNAs in Arabidopsis" |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
CAGTTCACAATGGTTGAAATGTTGGAAGCGATAGGCATACCGGGAGGCGATAAGTGGGATGATGGATCCGAACATGATGG
AATTTATAAGATTCATGTACGTGGTGGTCATACCGGTATCCACAGAGCCGTGCCTATGGGTAATAAAAAAGGCATTTGCC
TCATGTTTTCAAAATCTAAAACTTTTTTAAGGCCCCCAAGATGCTGTAACATAATGGTTTTGAAAGACACTGTTTTCCAT
TCATATAATTTTTTTATTATTTCTCTTAAAAGTGACTAATCTATTTTTAATGGTTTTATTTATTCACTTTATTTATTTTA
AAACAGTTGGAATCTGTTTTAGCACTTCTAAATATTTATTAACTTAACATATACTAATTCATCTTTATAGTAGTTTTGTT
TATAAATAATGATTGTGGTGACTTGATAATTAAAAAAAATTATAAATCTTTAGCAACATGTTTTTGAGATTATAAAACAA
CAATAAGATTATGATAATTTGGTAAAAGCTTTAATTAAAGATGAAGGAAGAAAAATTATGTTTTAGTTATATTATTGTTT
TGTTTTCAATAATTTATTTAGTTACGAAATTATTTTATTAAAGAAAAAATTGGTAAGGCTATTAATCTCAACTTCGCCTT
AAGCCCTGATAAGTGTGGGCACTGCACTGGGTATCCAGACCATCCATTTTGAATATTTCAAGAACGGACAGCTGAAAAGT
GGAGAACTGTTTGGTGTTTGGGAGTGGTTTCACACAAACGGTATGACTTTAAAATATATTAGGCTATAGAGAGCATAACA
ATTCGAAACATAAATAAAACTTGTTTTATCCGATTTCATGTGACTAATCTCGACGAAAATCAGATTGTTGCGAATAACGG
AATGACAATATTTGTTTCTTTTATTTTTCTAATGCAGATTGAGATTGACCATCTTAACAATGAGCATCTTGAATCTGTTG
AGAGTTATTACGACGATGCACCCTGTTACATTCAAGCACTTCAATTTAAAACCAATTTCAAGGTTTCCGAACTGATTGGA
TATGGCAAGGGTACCAAATTTTCACTTTCAGTCAAGGGAAAGATTATCATTGGGTTTCATGGATATATAAAAAGCCAGAA
CAATCCACTAGTAAAATCTCTTGGAGCATATTTCACATGGATTCCTGATTGTAGATTAGAAGCAAAAGGCAGCAAGGGAG
GCATACAATGGGATGATGGAGCAGACCATGAAGGTATAACAAAGATTCATGTAAGAGGTGGTTTTGAAGGCATTCAATAC
ATCAAGTTCGACTATGTCAAGAGTGGACAGCCTAAAATTGGCTCAGTCCACGGTCTCTCGGGTAGAGGTTTCTCGCAGGC
GGTATGTATTGGAATTTCCCATGTTCTCATTATTGGCATGATTTCTAACCTCTCTTTTCTCCACCATTTTCTTTTTCTTA
TTTGTTTTCAGTTTGAGATGACCATCTCAACAATGAACATTTGGTATCTGTAGAGGGTTACTATGATGACGAGTCTACAG
CCATTCAAGCACTTCAATTCAAAACTAACATAAAGACTTCTGAGCTGCTAGGATATGAAAAGGGTAAGAAGTTTTCACTT
GCAGACAAGGGAAAGAAAATTATTGGGTTTCATGGATATGCTGAGAAGAACCTCATTTCTCTTGGAGCATATTTCACAAC
AGTTTCTGTTACTAAATCGGTATGTCACGGTAGTAAGATAATCGAGTCTTGGGATGATGGTGTTTTTGACGGCATAAGAA
AGGTGTATGTTAGTTATTCTATCAATCATGTAGCGTGTATCACGTTTGAGTACATCAGTAATCACTCAGTTGTGAAGCGT
CAGCACGGGAATAACACATCATTAGTAGAAGAGGTCAGATTCCTTGATAGCTTATACTTGTTGATTATATACTTCTTGTT
CTTGACTTGTATCTAAAATAAGAAGTTTAATACAGTTTGAGTTAAACTATCCCAATGAATTTATCACATCTGTGGATGGT
ACTTTCAAAAACTCTGGCATGAGGAAAGTGATGTGCGTTACGTCTTTGGTTTTCAAAACATCAAAAGGGAGAATTTCTCC
GACATATGGAAGCGTGACTGGGACTAAATTTGTGTTGGAGACCAAAGATTGTGCTCTAGCTGGGTTCCATGGATGGACTT
TTCTTGGTTTTCTTACTGCTATTGGTGCATATTTTTCTCTGCTGCCTTGTCCTCCTAATGCGGAGAAACTAGAAGCACGA
GGTTATGATCGAGGAGCTTTTTGGGATGATGGTGTTTACGATGGTGTTAGAAAGATATATGTAGGACAATGTGAAAATGG
TATCGCATTCCTCAAGTTCGTTTACGACAAGGACACTCGGATGGTTATTGGAGACGATCATGGAAACAAAACACCACTTG
AAGTCAAAGAGGTAATTCTAATTATCAAACTTGTTCTTACATTTATCTTTGGGAACATATTAGCTTAATATTTTTGTTGA
TCTGGCACAGTTGGACCTTGAGTATCCTGGTGAATATGTCACAGCGGTGGAGGGCTGTTACAATAAAGGAATTGAGGGTG
ACGTGGAATCTATAACCATGCTTAAGTTTAAGACTAACAAACGAACATCTATATCCTTTGGATTCGAATCTAGTTCAAGC
TTTCTACTCGAGAAAGAAGGCTTCAAAATCGTTGGGTTCCATGGAAAAGCAAGTAACATGATTCATCAGCTTGGGGTTCA
TGTCATTCCCATCACCCACTGATCATCTTAATACTATATCCTTAATCTCTCATGTAATAAGAATCATCCTAGTTTTTATT
TTGTTTTTTCTCTTTTTATATCAACAACATGCAAACGTAATTTGCTGCAAGTCCTTGTTAAACATCACATAAAAATTATT
TTTTAAAAATAACTACTCAATTATAAAAAACATTTGTCTAAATAAATTGATAGCATTAAACATTAATTTCCTGAATTGTC
TAACATCCAATAAAAGCAGTATTTTTCAATCCAATAACAA