Basic information from miRBase |
hairpin accession number: MI0002409 |
Located between position 1523306 and 1523503 on chromosome 4 strand - |
mature miRNAs for MI0002409: |
ath-miR447c-5p (MIMAT0020346): CCCCTTACAATGTCGAGTAAA |
ath-miR447c-3p (MIMAT0002115): TTGGGGACGACATCTTTTGTTG |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
TTCCGCTTCATGTGGCTGCTCGTGATGGTCATTTAACAGTTGTTAAAGCTCTTGTAGCATCGGTAACATTTTGTTCAGAT
AGACTGGCTGAAGAAGATAGGGAGAGGCTGAATCCATATATTCTAAAGGACAAAAATGGAGATACTGCTCTCCACTCAGC
CTTGAAAGACCTCCATGAAAAAACAAAAGAACTCCATGAAAAAACAAAGGTATCGCACATAATATCAGTTAAATGACCTA
AGAGACTCTTTAGTTAATAGTATTTATCACGACAAAACCTTCTGTACATCAAAGCAAAATTTATATCGAATGTTATTGCA
CCAATTTTCTCTCAAGTGATCCATGTCTAATCCTGACCTTAACTCGTACTATTTTCACTCGATGGTAATTTTTTTTTTTT
TGCTTGTATCCCTTGTTATATTAGGATTCGACTCTTGGTTACCTCTGTTGGTCTTATAATTCTCTTAATACCTCCAACAG
TTTTACCAATCATTATTTTCCTAACTTTTGATGTATCAGCAACAATCCATAAACTTAGGATCCTTGATTCCCTATCTATT
CTACAGGATATGCATTGGCTACGACGTAGCAAATCCAAGTCACTTTCTAATGAATCTACACACCTAATGGAGACAGCTGC
TTGTCTAGTCAATGCGAACCAAGATGTTTCGTTTCTTGCAAATAAAGATGAAATCTCCCCCTTGTATTTGGCAGTTGAAG
CTGGTAACGTATCACTTGTAAATGCAATGTTGAACAGCCATGTTAATAACGTTCAAGACAAAACCTTTAACTTAGCCACA
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CTTCTTTACTCGAAGAACCTAACCAAGTTCCTACTTGTTTCTGCAGATGTTCTTGATGTTATTCTCGGTAAATACCCGAG
TCTTGTCAAAGAGCGAGACGAAAAAGGACGAACTTGTCTTTCGGTTGGAGCATCTGTAGGGTTTTATCAAGGCATATGCA
AGCTGTTAGACACATCAACGCTAAGCATCTTTGATTGCGACGATGATGGTTCATTTCCCATCCATAAGGCAGTGGAGAAA
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TTTCCACATATCAGCAAAGAGTGGCAAATCCACATTGTTTCTTATGGAACATATCAATAAAGTCGATACGAAGAATCATC
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CTTACTAAATTTCTTTCCATCAGAAAAAAACTCTTGGATAAACATAACTCCGTTGGCTTGAGACCTCTGGATATCGCAGA
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GGTTTTACAATGCCCGGTGGCTTTAGCAGCTCTGCTCCAAACACTGGCATGGCTATTTTGGTCGATGACCGTTACCTCAC
AACATTTATTATGAATGACACTATTGCAATGCTTACCTCAGTTTTAGCAATAGTTGCTCTTATCTGGGCACAGTTAGGAG
ATCCAGAACTCGCGCACAGAGCGTTTCATTTGGCTTTACCAGCACTCTTCGTTGCTCTACTCTTCATGTGTTTCACATTC
TTTTATGGCGTTCTGGCTACAATACAGCATAACATCGTGCTTTCACGCATCATAAGCTTTGTATTTATTATCTTATTTAT
TATGACCGGAACCCTCCTTACCCCTTACGTGATCCCGCAGGTTTACGGCCTTCCTATTATTGGAGTTTTGACTAGTTCAT
ATCTTGATTTTCTATTGCTGTTTGTTAATGAAGATGATGATGAAAAACATTACACCACCGGCTCATCTCACACGTGTGTG
AAGAGTGGGGAGTCCATGGGATCTTCAAGCGGGGTCCAAGCGGAAAAGTCGAAAGTGCTTTAAAGAGATTGCATCGTTTC
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TTTTTCTTGGTTGTTTGTACAATTGTACTTAGTAATGTAATAGCAACAAAAAAAAAAGAAATCGAAGCGAAAAAAGATGT
AGAAAAGTCTGGATTTTTAATTGCTACTAGTCTCGACCTCTATATTCGAGGACTTATGTATGTTTAGAGTAATGGAATTT
TTGAGTGAAGCACGGAGAGATGTTGAAAATTGGATACTATATGGTTGTTATTAGACTACGCAGGAGCTGATTTGGTACAC
ACATACATATGTTCTGCTTCTTTCAAAACTAACATATCAAGTTCAAGAAACCAGTAAGTCGTTTATCTATTCCATGCTTT
CTTCTTTTGAATCATGCCTTGTTGTTTGTTTGAACATATCTTCTTACTTAGTGGATGGACTATATTTAAAAAGCTGCAGC
CCTCTTTTTAGCATAGTATAACCGCTGATGTACACCTACCAGCTTGATAACTCTTTTTCGTGGTTTCTGTGTACTCGTTT
CTGTTTGTACAGATACTTCTTGTTCAATTTCAGATGCTTTAGAAGGTTTTCGGAGTGGCTAGAGATCTGTTATCTGTATG
AACAGCTACTTGGTATCAGCTTCGTCATTTTATCAACACA