miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse



Basic information from miRBase
hairpin accession number: MI0007222
Located between position 31518908 and 31519000 on chromosome Gm16 strand +
mature miRNAs for MI0007222:
         gma-miR1510a-5p (MIMAT0017338): AGGGATAGGTAAAACAATGACTGC
         gma-miR1510a-3p (MIMAT0007368): TTGTTGTTTTACCTATTCCACCC

References
[1]Subramanian S, Fu Y, Sunkar R, Barbazuk WB, Zhu JK, Yu O, BMC Genomics. 9:160(2008)., "Novel and nodulation-regulated microRNAs in soybean roots"
[2]Wang Y, Li P, Cao X, Wang X, Zhang A, Li X, Biochem Biophys Res Commun. 378:799-803(2009)., "Identification and expression analysis of miRNAs from nitrogen-fixing soybean nodules"
[3]Joshi T, Yan Z, Libault M, Jeong DH, Park S, Green PJ, Sherrier DJ, Farmer A, May G, Meyers BC, Xu D, Stacey G, BMC Bioinformatics. 11 Suppl 1:S14(2010)., "Prediction of novel miRNAs and associated target genes in Glycine max"




>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
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