miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse



Basic information from miRBase
hairpin accession number: MI0006971
Located between position 4765320 and 4765559 on chromosome 01 strand -
mature miRNAs for MI0006971:
         osa-miR1431 (MIMAT0005965): TTTGCGAGTTGGCCCGCTTGC

References
[1]Lu C, Jeong DH, Kulkarni K, Pillay M, Nobuta K, German R, Thatcher SR, Maher C, Zhang L, Ware D, Liu B, Cao X, Meyers BC, Green PJ, Proc Natl Acad Sci U S A. 105:4951-4956(2008)., "Genome-wide analysis for discovery of rice microRNAs reveals natural antisense microRNAs (nat-miRNAs)"
[2]Sunkar R, Zhou X, Zheng Y, Zhang W, Zhu JK, BMC Plant Biol. 8:25(2008)., "Identification of novel and candidate miRNAs in rice by high throughput sequencing"




>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
TCGGCTTGCTAGCTCCTCGGCCATGTGCTCTAATGGCGATTTCTCGGTTTGTTCGCAGGTGAGAGCGCTCTCCTGAGGCC
TGAGGGCGGCCTTCGACGGGAACCTCGGACGCCTCAAAGGTTGCTACTACCTCTCCTCCTCCTCCTCCCCTTCTTCTTCT
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