Basic information from miRBase |
hairpin accession number: MI0000218 |
Located between position 6220646 and 6220841 on chromosome 1 strand + |
mature miRNAs for MI0000218: |
ath-miR159b (MIMAT0000207): TTTGGATTGAAGGGAGCTCTT |
You can find this miRNA in EMBL: (accession: AJ496805) |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
ACACCATTGTTTTCATCTGCATATATTAACACCAAAATTTGGTACCATAGAAATAAGAAGGAAACAAAAATACAGTTAAA
GCTAGTTGTCTCTATTACCTGCCGATTCAAGCTGTAATGCGCGGATCTCAGCCTCAAGATCTGCACGGCGTAAAAATGTA
TAGGAAATAAGAATTATCACCTCCAACAAAAAACGTACAGACATTTAGCAAAGAATTCCACAAAATACCCAATCCCTCGC
TAACTGAGAGTTAAATTCACTCGAATTCCAAAGAGAAATAGCTAGGTCAGTTCTACGCAAGCCAATTAAAACCAACCAAT
CAGCTAAACCCTAATCCGATTTCTAATCCAAAAGCCGATAACCCTCCTTCCGATTTAAGATTAACTACCAGAGCAACAAA
TCAATCAGCTTCATAATCGAAGTTAACACAGTAAAACGCAAAAATTCAACAAAAATTGAAGAAAAGATCCGATCGACCAA
CAAAAGTAGTAAGCGCATAATCGAGAAATCGAGAGAGAAAGAAGACACATAGACCAATGACTAGAAAGAGAGAGCTCGAG
AACCCGTACCCATGGCGGATTGAAGAAGCGAACGAAAGGAAAAGGGTTTCTAGGTTATCTCGCGAAAGAAGAAGAAGAAG
CGCGTTAAGGGATCCACCAAACGAACTAGTGCCGCTTCTATGAGGCTCTCATTTTTGCCCAGGTGGATCTTTTATATTCC
CTTTTTTTGCGTAATCAAATTTTTCTTATTTCACATCCCAAAACTCACGTGTCAGGTTTAACGTAAATACGACGTCGGTT
AGCTAATATAAGGCCATAATGAAAGCCCAACTAATGGGCCTTAGTTACCCTTGTGTATGATTGTTGGAAGGCCCATATTC
ACTATTGTGAGCAATATTTATTTTGTACAACAATTGGAAAAGCCTTTGTAAAAAGACACTAGATTTTCAACCGCGGGGAC
TAATTATATTTTAAAGTTAATATATATAAAAGTTTGTAATTTGTAACTATCTATGTAACTTTCTATAAAATATTTTTATT
TTATAGTTTAGAATTGTTATTAAGTAACGTCCTGCCAAACCCGTCCCGCCAACCCGTCCCGTAAAAAAAACTCATTTATT
TTATTAATGTTGATCTTATTTATCATATGTTTATGAATCATTGTCTAAATATTTTGTAATTTTGTAGTAATTAAATGCTA
TCAAATATCTCTGCGGTTTGATGATTATAATTGAATTGTAATAGTCATGCAGAAAAACAATATCAATAATGATAATTTTG
TAGTAATTAAATGATATTAAATATTTTGAAAGTTTTATTTTAGTAACCAATCGTGTAGTTAATGTAGAGAGATTTTAGGA
AAATTGTTAAATGTCAAATATTTAATTCGAAGATTTTTTTCTAATTATCAAAAACAAATATTAATCTAGTGGCAACCATT
GTAAATAAATCCCAACTACAGGATTTATTTCATAAAATGGCTGCAAAAATGTATATATAGATAGATGTGTATAAAAAACA
GAAGAATTTGCTTGTAATTTTTATTTTATTTTTTTAACACACCCTTATAATTTTCAAAAGTTTGTATCTTTTACATAATT
TCTTTCAGTTAAAGAAAGTTAAAAGTTGAATGCAAAAAACACAAAAGCACTAATGAGACTAAGTTCTTTTCTGTAGGAAA
TCTACCCATAGATTCTTTTTGGGGTTATTATCATCTGTTATATCCATCCTTCAATCTTGACCGCACAATGTTATCTTCTT
GTTTTGTATGTTCCCGATAGACCGATACTTTGGAATTTTAATCCAAAAAAGAAATTGAATGTTGCAATCAGATTTAAGAA
TGACAAAAGAAGGAGTGGGGTTACACAAAAGCCAATGAGGAGGCATGTGACGTTTTTATGTAAAAGGGAATCTAATAGCT
AAACAATGTCAGTCCATTTCCCTAAAGTCCTTTTCATTACCACCCCCACCCATTCTATTTTCTTTATTTTGAATTTGGTA
TGATGATATTTTCATCATTTCATTTCATGTACTAATCAAGCTCCATATTCCATATGAATAAATGTTACTTTAATAGCAAA
AATCGTTATCAGACTCGTCTATTCATTAGTTGCGTGTCCACTCTCTTATTATATTCTTATTCAATTGAATTTTTCCAATC
TAAAGTAGGTTAGAAAAAGATTGGCAAGATTTGTTTCATGATTAACAATTTAAATAAATAAATTAATTAAATTAACAGAC
TAAAAAGAGTGAATTAGAAAAATAACTAGAAAAAAGTAAGTTCTTGAGTAGTAATGAAAGTGACAATTGCTAGTAAATAA
GTGGTTTATGAAATCATATATATGAAGTGACAATTGCTGTAAATATGTGATTTAATAGCTTTTCATTAAATATCACAACA
AAAAATCTGTGAAATGAATCAATAGCTATTAAATCACAAAAGTAAAAAAATCTGTGAAATGAATCAATAATCCTAACTAT
TAATGGGTTTAAGAAAAGTCCTCGAAATGAATACCATCTTTGACTCCCTCTTTCTTTCTCATTAGGGCTACAGATTTTTG
TCTTTAAAAAGCCATTCAAGTTTCAATGGTTTTTCACTTTTGTTCTCCTCCTCCCTTTTTTTCTTTTCAGGATTCTTCTT
TTCTATGTTTTATCTTTCATAATAGATCTGATAATTTTGATTTTTCACTATATATATTATGGTTAATACTAGTAGCTTTT
TCATTTCAAGTTTTATCCTTCCATTGGTTCTTTCTGAGTCAAATTGTCTCCTGTTTCGAACCATATATAAGTTTTCAATG
GTTTTGTATTAACTCAAGTATTCAACATTATGTCTCTCTTTTTCTTGCTTGGATCTCTAATGCTGTTCATATTTTAAAGC
ATAGGTTTAGGTTAGATGCATGTAACTGCCAATTAAAAGAAGGTCAAGAGTTTTTTGATTGTATGAATATATGAGTTAGT
CAAAGCAGATCCACACGATTATATAGAAAAACAAAGGAAG