| Basic information from miRBase |
| hairpin accession number: MI0005112 |
| Located between position 5500037 and 5500147 on chromosome 3 strand + |
| mature miRNAs for MI0005112: |
| ath-miR782 (MIMAT0003941): ACAAACACCTTGGATGTTCTT |
| References |
| [1]Lu C, Kulkarni K, Souret FF, MuthuValliappan R, Tej SS, Poethig RS, Henderson IR, Jacobsen SE, Wang W, Green PJ, Meyers BC, Genome Res. 16:1276-1288(2006)., "MicroRNAs and other small RNAs enriched in the Arabidopsis RNA-dependent RNA polymerase-2 mutant" |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
TGCTAACAAATTTGAAAAATCAAATTTGCCCCCTTATCCACTACCAATTTACAAAATTGGCAAAGGATATGCAACATAAC
TTCTTGGGGTAATATCTCCAGAAAGTGGCAATAACATTTTTTAATCGTAGAGAGGAGAAGTGGGAGGCTAAAGAGACTAA
ACGAGACCATAGGGTTTTTATAAGATGGGGAAAATTTAGGGTTTTGATTTGTTCAAATTTTATTAGTTATAAAAATAAAC
TAAAAATCAAAAGGATCCCGTGTAAAAGGGGAAGCAAATATAAAAATATTTTTAATATTTGATTTCTATATTCCGATTTC
AGTTTTCCAAGTTTCCTTACATGAATACCAATTAAAACCGAGTTTCTATTTTCTTCGAGTGATTTGCCACAACTATAAAA
CTTTTTAAAAAAAAAATACTCAAAATACTATTAACGATTTGTTAAAACCAAACTTGTGCTTGCTAGCTTATGCGAGAGAG
AGAGGCTTTGTGTGGTCGTCATTGACCACGTCTCTTGCAATTTATTTGTATGTTCGAAGAAAATGTCATTAAATGTAAAA
AAATAGTCTCAAACGACGGCAAAAAGTCTCTCTCCATTGAGTATCCTCTACGGTTCTTGAATTGGTTTGGATACATATTT
CGTGTATGAAAACTGAGGCGTATCAAGGCTATGGAGAATTTAAATCATAAGTGGGATCGTTGTTCCTCTTCTCATCAAAC
TCCTCTTTCTTTCAAAGGCAATCAGAAGCAGGTTTGTTGATTAATTTTCGAGATTCTTTGTTATAGCGTAGAGAAAATGT
CAATCTTTGACATTTTAATATGTTGCTATACTTTGGATCTTTTTTTACTTGCTGTGTACACTTGAATTCTCAAATTCTTT
GTAGATTGGACAAGGTCAGAGAGAAGTGTTCACACATTTTGTGTCACTTCCATTAGCCATATACCCTGACTTGACGAAAA
ATATCGAGGCTTTTCAGAATTCTGTATTGGGAAACAATGATAAGGATCCATTGAAGTTTCAGAGTACTTTAGCTGGTAAG
ATCACAAACCAAATAAAGAAATGTTTTAAGTGTAGAACATGTTTCTATGACATGTTTTTGGATATTGGACAGAAATGGGA
ATAGAAAAATCGATCTTTGTAACTCCCAAAACTTTCCATTTGACTGTGGTTATGTTAAAGTTAGAGAACAATGAATCTGT
GGTTAAAGCTCAGAATATCCTTCAGGTATAAGTGATTCCTATTCTAAGAGACATAGTGTACTTGTTCTTCTTCTTAGGAT
TGCTTTGATGATTGAGGTGTTGTCTTTTTCTGAAAAGCAGAGTATTTTTTCTAATGTGAGGCAAGCTTTGAAAAACAGAC
CTGTCTTCATAAGACTCAGAGGATTGGTAATTGCTACAATTTCTAGTGGCTTGAAACATAATCTTTGAATCAATCCCAAT
GGTTTTTTGTCTTGTTAAGGAATGTATGAGTGGATCTTTAGACAAAACTCGCGTTCTCTATGCTCCTGTTGAAGAAGTTG
GTCGTGAGGGCCGCCTGCTAAATGCTTGTCGTATCCTAATTTCTCTAAGCGCTTATTTTTACTTGTGTGAAGACATGACT
TCAAATTACTATGCAAGTGCTTCTGAACTCTTTAACTCTCTAGTTTAGATGTTATCATTGATGCATTTGAGAATGTTGGA
TTTGCTGGTAAAGATGCAAAGTCACGCTTGAAGGTAATGCTTGTCACTTTTCTGTTGTTTACGTCTTTGACTAGGACAAA
GAAAAAGATGGATATAACAATGTTTCAGCTTCTCCTTCATGCTTGTTCCTTATTTGCAGCTACACGCCACGTTGATGAAT
GCAAGCTACAGAAAAGATAAAAGCAAAAAGATGGATACTTTTGATGCTCGAGAGATACACAAAGAGTTTGAGAACAAGGA
TTGGGGAACATATCTAATCAGAGAAGCTCACATCTCACAACGTTATAAGTATGACCCCAATGGCTACTTCCATTGCTGCG
CTTCACTACCTTTTCCACATAAGTGACATTGACAACGATCAAATCTCCTCCACATGATTTGCATTAGGAAAATTAATGTC
AAAACTTAGGTAAGTATGGTATGTCACTGTGTAACTGTTTTTATATGTGTGTGTCACAGCGATTGGTAACTATGTGTTGT
GTAACTTTTGTTTGTAAGTTAAGTTTTGGACAGTAATATTCTTCCTTCCGATGATTGGATTAGAAAATTCGTGAAAAGTG
TTTGATTTTGTATTATTTCTGTTTATATCGCATGTTACTTCTTTTGGTAATTTTGTAGAATTGATGGTGTATTAGGGTTT
ACGAGTAGATGTTTTCTAGAAACAAAAGTATTTCTCCTAATGTGAGGCAAGCTTTGAATAACCAACCCATCTTCATAAGA
CGCATCCTTGAGTTATACATATTTAGTGGCTTGAATCATCTTTGACTTTGATTATCTATCCAACTTTTAATTCCTAAAAC
ATAGAGATTCATAATAAATCTGTAACTTTAATTCGTCTCTTTACCAATTGAATGCCAAATCTAGATAGATCAAAAAGCGA
ACCAGCTCTTTCTAGACGAATAAGCTCTTTAAACTCTGTCGTATGTGTTGTTTCATAGGACCTTTCATCTTTTTCTTCTT
CTCATAATTAGTTACCAGTGGCAAAAAGGGAAAAGTCTAAAAGGAACTCTAGAGTGAATTTAGTATGCAATTAAATAAAT
CATTTACTAGATAAGGGTTTGATTACAAACCTTAGGATAAATATTTGATTGTATCTCAAAGTATAAGAAATGTGTCAAGC
AGATTCTGTGTTTTTTTTGTTTCGATTAAAACCGCTAAAACCTTGACAAGGTTGTCTCCACAAACAATATTCATATCAAT
CTCAAAGAATGCAACATGCAAAATGTTGTGCATATTGTTTGTGGAGGACCACCATCGTAAGAGGATTTATGTAACATAAC
TTAAAAGAAAGTGGCTATATATAACTTTTTTTGAAACCTT