| Basic information from miRBase |
| hairpin accession number: MI0005381 |
| Located between position 11159660 and 11159845 on chromosome 2 strand + |
| mature miRNAs for MI0005381: |
| ath-miR825 (MIMAT0004241): TTCTCAAGAAGGTGCATGAAC |
| References |
| [1]Rajagopalan R, Vaucheret H, Trejo J, Bartel DP, Genes Dev. 20:3407-3425(2006)., "A diverse and evolutionarily fluid set of microRNAs in Arabidopsis thaliana" |
| [2]Fahlgren N, Howell MD, Kasschau KD, Chapman EJ, Sullivan CM, Cumbie JS, Givan SA, Law TF, Grant SR, Dangl JL, Carrington JC, PLoS One. 2:e219(2007)., "High-throughput sequencing of Arabidopsis microRNAs: evidence for frequent birth and death of MIRNA genes" |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
ATAACTTTCTTTTAGTTTTCATAAGGATCCGAATTGAGGAAGAAGAAGAAAAAGAAATCGAGAAGGTGGAGAATTGGAAA
GAAACGAAAATTGCGAATTGAAGAGGTGGGCTGAGATTGTTTTTAGAGATCTCAACCGTTTGTTAACTTGTTTTAATCTT
ATTGACCCCGTGTTTAAGTAGATACCACATCAAACAAAACCAATCGAACCGGTTTAGCAATTAATGATTCAATTTGGGAA
GGATAGAATTGTCTTTATTTTCTCCAGAAACAAGAAAAAGTGTCTGAACAATAGAAAGTGCCTCAAACATAAAAACATTT
CTTAAAAGTGCCTAATAATGCAACATTCCTTTTTTTTAATTTTCTTTTGTAAACTTTTTCCTCGCCGATTGAGATACTAA
TAATGATATGACTTTTTTAATTAATGTATTGTTACCGAAGAAAAAAACAAAAAAAGATTAGAGATGTGTACAAAGAAATT
AAGGAAGGGTTATTGGTTTGTACATTTATAAGGAATTGAAAATCCAAACAAAAATTATTTGTTATTCAATTACTGATTTT
AAAATTCTAATTAAAATTATGTGTTATTGATTCGATGATTTATAAATACTAGTTAAAATCTTTTGTTATTCGTTTAGTCA
TTTATTTTTGGATTTGAGAATTCATGTTATGTTTTAAATGGAATTGAATGGATTTAAAAGAGAAAAATAGAAGGATTCAA
ATCTATGGGTAAACACATGTTATTTCAAAATCCATATATCTTAAAATTTTCAAATTCTACGTAGATTTACAAATCAATAA
ACCAATAACAAGTCCTAAGTATACGTTTACGTAATTTAACTTTTGGCAGGGTATTTTACCGAAAATGGCCATTGAGATTT
TTGGAAAGGAAGTATACGTTTGTTTCTTTGCTCTGAGGTATCTTCGTTTGATACAAGGCGAAATCGATCTTCTTCTTCTT
CTTCTTCATCCCCTTGCGTTTTCCATCTCCATCGTCTGCTGAAACCATTTGATCGATCTCTCAGGTGATCCCTGTTTTTC
TTTTTGTCTTTCTCTCTGCTAGCAATTCCTGGGCTAAATTGGATGATGATATTGTGTTAAAGAACTCGAAGATGATTTGT
CAAAATTAAACTTGATTCTGTAGATCCGTGAGTTGAATCAGATATTAACGTGTCTCTATGTTTCTATGTATCAATTTGGT
TTGATAAGGTTACTTAGAATGGCACAAGAAGCCGATGGGATCAGATTGGACCAAAGACATGGGAAGGCTCGAGTGAGAGT
TGGAAGAGTTTGGCGTCATGCTCATGATGGATCTCATCACTTTGTTGAATGGAATGTTAGCATCAGTCTTCTCTCTCACT
GTCTCTCTTCTTACCGTCTTGATGATAACTCTGATATTGTCGCCACAGATACCATTAAAAACACTGTAAGTCAACCAAAA
TATTTGTTGGTCTTAGAGTCATTCTAGTGAACAAATGTTTCTGTTCTTATTCATGGTTATATCCTAGTGTCTGACAAATG
TTTTATGTTGGAATGAAGGTTTATGTGAAAGCCAAGGAATGTGGAGATCGGCTCTCGGTGGAGGAATTTGCCATACTTAT
TGGGAAACACTTTTGCTCATTTTATCCACAGGTATGTATGCACTATGCACTATCACCATATCTTTTTTAGTAAGCAATTG
GATATATTCACCTTAAAGATGTTTTATTCATTTTGCTGTTTTGTTTCCTCTCTGTTTAACCAGGTATTTACTGCTATCGT
GAATATCATTGAGAAGCCCTGGGAGCGTGTCTCCATCGATGGAAAACCACATTTACATGGTTGGTTCTGACACTTTTTTC
TGGAACGAATATTTGCTATAGTTTAATGGTTTTTCTAAATCAATCTTTTGTTTTGAAGGTTTTAAGCTTGGGTCAGAGAA
CCATACTACAGAGGCAAGAGTAGAAAAGTCTGGTGCATTAAACTTAACTTCCGGTATTGGAGGACTAGCTCTACTGAAGA
CAACCCAGGTATATAAACATCTTTCTGTAGATATATGTTTTTTTGTTAGAAAGGTGTTGAATTGTCAGTGTTATCACTGT
TATATTTTGGATAATGGCGAGTTAGATGTGTTCCACGGTCTTTGGACAAGCGTTTTCCAGTTTTTTCTCGTCAATAAAGA
AGCTCCAGTAGTGTTTCCATATTTTGTAAACCACTAGATCTCGGAGACAAATATTATACCTGGCAATCTGTAGTTTTAGA
GATAGAAGTCTACTCTAACTTAGGAACTTTATGGAGAGGAATTTCAAAGAAGAATGATATGAACAATGAGTGAAGATCTA
GATTTGATGTTATTATTGTCTATCTAGTTTGTATCTTAATCCTAGGATATTGACAATAATGGATGTCAAAAGACAAGATC
TGATAATTGATTGTTCACAAAAGCCGCTCTTATGCAAATGAACAGTCAGGATTTGAGAGGTTTGTCAGAGACAAATACAC
CATTCTGCCTGAAACTCGTGAGCGAATGCTGGCCACAGAGGTTAATGCATCTTGGAGGTATGTGTTAATTAGTGATGTTA
CATTTCTTATTTGTGATTGATTCTTGAAACCGACATACACGTTCATGATGACAGGTACTCGTATGAGTCAGTTGCAAGCA
TTCCAACAAAAGGACTCTACTTTAGCGAGAAGTTCATGGACGTTAAGAAAGTTCTGATGGATACTTTCTTTGGTCCACCA
GAAACTGGTGTGTATAGCCCTTCTGTCCAACGCACTCTCTACCTCATGGGAAGCGCCGTACTGAAAAGGTATCACATATC
AGTCTATATTTATTTCGCTGTTTGTGTGATGATGTGATTCTTGCCATGATAAAGGTTCTTATTAACATGATCAGGTTCGC
TGATGTATCATCGATTCACCTAAAAATGCCAAATATTCATTTTCTACCAGTAAATCTTTCAACGAAGGAAAACCCTTCAA
TGGTGAAGGTAAGAACCTCTATGTGATGTTGTCTTTATGA