| Basic information from miRBase |
| hairpin accession number: MI0005385 |
| Located between position 11834022 and 11834226 on chromosome 1 strand - |
| mature miRNAs for MI0005385: |
| ath-miR829.1 (MIMAT0004245): AGCTCTGATACCAAATGATGGAAT |
| ath-miR829.2 (MIMAT0004246): CAAATTAAAGCTTCAAGGTAG |
| References |
| [1]Rajagopalan R, Vaucheret H, Trejo J, Bartel DP, Genes Dev. 20:3407-3425(2006)., "A diverse and evolutionarily fluid set of microRNAs in Arabidopsis thaliana" |
| [2]Fahlgren N, Howell MD, Kasschau KD, Chapman EJ, Sullivan CM, Cumbie JS, Givan SA, Law TF, Grant SR, Dangl JL, Carrington JC, PLoS One. 2:e219(2007)., "High-throughput sequencing of Arabidopsis microRNAs: evidence for frequent birth and death of MIRNA genes" |
| [3]Moldovan D, Spriggs A, Yang J, Pogson BJ, Dennis ES, Wilson IW, J Exp Bot. 61:165-177(2010)., "Hypoxia-responsive microRNAs and trans-acting small interfering RNAs in Arabidopsis" |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
TGCATAACAGCAGAATTTGTCCGGACAGAATCTAGATTAACACCAAAATATGGATTTATAGACATGATTAAGTTATTTGT
CATTATTTTTGGTACTATGGCCAGTTCCACACAAGACACAACGACCAAACTAAATATGTCTGGTCACTTTTGAGAATTGA
GATTTTATCTCGTAATTATATCAGAAACTCTTATGATGTAATTAATCTAATCTTCAAACTGACGATGAAAAACAAGTACT
TTACGAGAGAAGAATTTTTTTGGAGTCAAAATAATTGTTCGATCTTTAGTTCTTATAAGAAATAATAAAATATTGAGAAT
ATTACACGTAAAGACACTATTTCGAAACTTTGGCCACAAATAGGCACTTTAAAAGCATTAGTCACTTTAACTCAGTAGAA
TTACCCTTTTACCCTGAAATCGTTTGTTTAACAAAACCTAACAAATTTAGCCGGTTTTCGGTTTAATTTTTTAATCTCAA
TCTCTAAACTAAAACCAATTTGTGAGAAACTTCTCTTTCTCACCCAATTCTTCACGACGATTTTACAGTTTCATTTATCT
GGGCAGTTAAAATCATCACAACGCCGATAACATCATCTCGACTCCGGCGATCATCCCGACGAGTTTTCTACCGGCAAAGT
CATTTCCTCGTCCCTCTCCCGTCGTTATCGTCAACAAAGCTTTCAATCGGCTGACATTAATTCGTCCTCTCCCGTCGTCG
TCGTCAACAGTTGTTCTCCCGTCATCGTCTTCATTTTCTTGTCTCTCAATCGATTCGTCGTCTCCGGCGTGTGCTAGTAA
CTTCTACTCGGTCCTCAAATGTAAGGTATTAATCTTCTCCAATCATTTTATTTGCTCCAATTATTCAATCGTGTGCTAAT
TTTATTTATAATATCCAACATTGTGAAGAGCTAATAGGTGAAGACATAAATGCTACGTTAGGTGATATTTCAAAAATGTT
AATCACAAGACCTTATCTTCTTACCATAGACTTCGGCTTGCTTATCTCCTCATTGTTGACGGTGTCCTCATATCCTCAAA
CCAACCTATTACGTCTACATTAAAATATGTAGAGATGTTGGCAGATTTGGAGAAGTTCCTTAACTGACTGAGGTCTACAT
AACTGACTGTCTATACACATGTGGATAAATGGTCAAAGAAACATGGATAATATACTTTGGATTGACGTTTATTGTTCATG
TATAAACTTATGTATTAGTATGAAACTATCATGTGAGTCTTTAGATGATCATGGACTGGACTGCTTGGACAATCATTAAT
GGATAAGTATGTCTTTGATTTGCTGCGAATGTGTTTATATCTCGATAAAATTGTATCAACATGTCTATATACATGTGGAT
AAATGGTCAAAGAAACATGGATAATGTACTTTGGATTGATGTTTATTGTTCATGTATAAACTTATGTATTAGTATGAAAC
TACCATATGACTTATTAGATGACCATATGTACTGGACTGCTTGGACAATCATTAATGGACAAGTCTGTCTTTGATTTGCT
GTGAATGTGTTTATAACTCGATAAAATTGTCTCAACATGTCTATACACATGTGGATAAATGGTCAAATAGACATGGATAA
TGTACTTTGGATTGACGTTTATTGTTTATGTATAAACTTATGTATTAGTATGAAACTACCATGTGAGTCATTTGATGACC
ATATGGACTGGACTACTTGGACAATCATTAATGGACAAGTATGTCTTTGATTTGCTGCGAATGTGTTTATAGATCGATAA
AATTAGCACTTTTTTGTTTGCTCATCTAACATTATCACTGGAGCCCAACTTGACACAACCTCTCTAGCTTCTCTTCTTCC
TCTCTTACAATAAACAGAATAATCATTATCTTCTCTTTCAACCTCTCTACATTCCTCCCTCGACGTCACAGTTACATCAG
CCGATGAAAAAATCGGAGTTACAAATCCATCAACACCAATCGGTATATCAAGCCTTGTAGGTCGTTTCCTTTTTAAAACT
TCTTCCGGAGGAGACGATGCAGAAACAGAGTCAGATCCAAACGATAACCCGAATCAGGGGGAGATTCCTAATCGACTTCT
ACGTCATCTCTCCAATCACAGTGGCGGTTAATTCGCTGCAAAAAACATCGTCACAATGCCTTGGTTAAGCCGGAGGCAAC
TCAATTTAAATTGTTCCAGAGGTTTTGTTTGAAGGGAGAGAGATCGTTGCACAGTAATATTAACCAATTCAAGAAACAGT
GACCTGGAGATTCCGAGACTTTCCATAGTAATTGCTTGGTCGGAAGAATTAACAACCATCGACATTGATATTGTGAGATA
ATTTCAGTCGGCGAAGGTAACTTCCTTTTCTCATCTGTAAATATCAACTGTCGATTTATTAGAAGGGAACCAAATCAAAA
CAAAACCTTTTTAACCGGTTAAGTAAATTTTTGGTTTAGATGGGTGGGGATATAATTGTCCATTTATTTTTCAAAAACAA
GGAAAAGTGCCTTGTAGGTGAGAAGTGTTTCAAAAGGAATAAAAGTTTGTAAAAGTGCCTAAACATGTCCAATTCCCTAA
AATATTATGAAAGCTTTTTCTCACCAAATCTTCGGGGCACATTGGACGTACTTGATCTAATGATCTCTTAAGTTGTTGCA
ACTTGCAATTGCAATTATTCGCATCTCTTCCGTTTTTTCTCAATACACCTTCGTCTTAAACAAAAAAAGTATTTTCGTTA
ATATACTAATGACGCACTTTAATTATATATTTAGTGGTATGTGACCAAATTTAAAACTTGATTACTAATTGTTAAAGCCC
AACAATGTGACACATGACAAGTCCAATACAAACCCACAAATCTATGTTTCTTAGCCCATGTAATTAGGGTTACTCTAGAA
AATACATTCATTCACATATATATATAGACATGTTATGAACATCAACTGAAGTAGTTTAGGGTTGCTGGCAACTTTCTTTC
TTCCTCAATTATTCATTAGAACGTCAAAATTGATTAACAA