Basic information from miRBase |
hairpin accession number: MI0010573 |
Located between position 6190604 and 6190701 on chromosome Gm17 strand + |
mature miRNAs for MI0010573: |
gma-miR1507b (MIMAT0010080): TCTCATTCCATACATCGTCTG |
References |
[1]Wang Y, Li P, Cao X, Wang X, Zhang A, Li X, Biochem Biophys Res Commun. 378:799-803(2009)., "Identification and expression analysis of miRNAs from nitrogen-fixing soybean nodules" |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
TTGTCACCCTCTCGGAATTTTTGGAGTTAGCCAAGGCTAAGGCAGTTCCTGGCATTTTGGTCAACATACAAGTGAGCAAC
ATTCGTAACTTCCCTATAATGCTTCTGCTGTTAGCAACACACTCTTTCAAAACATAATCTCTACTATTAGTTAAACTTTA
TAAAATCACAATTTTTTGTTAGATTTTTTTTCCTAATTTTAATAAATTTCAACCAATAGTAAAGTGTGTTATAGTATTCC
TCAAACTTCTATTAGAAAAAATTGCTATTATTGCTAACTCTATTTTTCTCACAGAATGCCCCCTACCTTGCATCCAAAAA
GGGTCTTGACATTGTAGATGCTGTCAGCATTGCTTTGATCAATGCCACCTTTGACAAGCAAACCAAACAACAAGTTCTGA
TTCAATCAGATGACAGCTCGGTCCTATCCAGGTTTAAAGACATCCCATCTTACAAAAGGGTTATGTTATTGATTGATAAA
ATGGGCGATGTACCAAAACAATCAGCAGAAGAAATAAAGAAGCATGCGGATGCAGTGAATCTTCCAAAAACCTCAATTCT
CAAAATATCTAATGCCATCTTAGTAGGAATGACATCTATTGTTCAAGAGTTGAAAGATGCAAACCTCACAGTATTCGTCC
ATAGTCTTAAAAACGAATACACAACCCTGGCATTTGACTATTGGTCTGATCCTAATGTCGAGATTGCAACTTACATCCAA
ATTGCCAAGGTTGATGGAATCGTGACCGATTTTCCAGCCACTGCTAGTAGATTCATGAGTGAGTTATTCCAATCTCAATG
TCTTTTTCTTGATCTTACCAAACTATAATTTTAGTTACAGGTTTAATCTCTTCTACTAACAAAATCTAACAATTAACATT
TGCAGATAAAAATAAATAAATTTGTAAGCAAAAGTTGAAACTTGATCTAACTTTTTATAAATTGCAGGGAGTCCATGTAG
CATTCCAACCAATGATCCTTCTATCTTACCAGCTAAGCCTGGTGATCTATTGAACACTATTCCAACTGAAATTCAGCCAC
CAGCACTGGCTCCACTTCCTCCTCTTGAGGTTGCAAACGTTGTTGACCCACCTCTTCCCGCTGTGACTAAAAGTTCTAAA
AATTCCACTGTAGCTGAGCCTGCTGATGCTGGTGCTACACCTGCCTCCCCTCCTCTCCCTTCAGGTGCCAGGGCAAATGT
TGCTAGCAGTGGCCTTTCTATAATAACTATTTTGGTGTTTGCTATGCTCTTCGCTGCTCATCAATGATTATTGTGATTAA
CCCCTAGCACAATCTATAGATCGCTAATTTTCCTCTAACTAACATCGTCTTGTATTTCAATTTATATTTATAGATTATAG
AATGCACACATTTCTTCTCAGAAAATATTGGGGTTTTCATTAGGCAAAGTTTCCTTGCCACTGGTTGCGTTTGGATTATT
TGTCATTTGTGCTTTAAAAGCACATTCGATGCCTAACTCCACAATTGTATTCAGGACTTAAAAATTCGGGGATAAATTAT
TGAAATGGGTTTTTTTTTTTAAAGAAATTTACCATAATATTTTTAAAAAAAATTATCAAAATGGGTAAATGATACTTTGA
TATACAATTTCACAATGAAGAAATCGTATATCAAAGTAGGATTTCCCTTTTAATTTATGAAGGTAATAACAATCTTGTGG
CCTATAAGGGATTCCAGTCAACTTCTTAGACAAAGACAATAACATGCTAAACCATCTCAACAACGTGAAAAAAATTCCAA
TATTTTACATTAGCCAGCCAAAACTTATGTTGAAATACACGATTTCTTAAATAAATTTTTAAAAAATGAAATCATGTTGA
AATGCACAATTTCTTAAATAATTTAAAACTGTACGATTTAAAACTGTACGATTTCAACATTTATTAATAAAAAATAACCA
AAATCATATGATAATATACAATTTTGATATAAAATTTCTCAACAAAAAAAACAAAATCGTGCATTAAAGTTCAATTTCTC
TAAAATAAAATCATACTTCAAAAACACAGTTTACTTATTTTCATAAAATTTTTAAAATTCACCCGATATGATAATTTTTT
AAAAAATTACACCAAATAGGTGCAATAGCCAAAATTCAGCGTCTGACAAGTGACAACTAAATTTGAACCACTGAATTTAT
TGGAATGAACATTTATTAATCATAATGGTGGCTTAGCAAAAAGCCCCAGGCTTAAAATACTTGACGTTTCTGAACTCCAA
AAGTACACGAATGAGTAAGACGATATAAATTCGGACTCTTGATTCTTTTAAGACAAAATCCGGACTCTACTTGAATCTTT
ATTACCGAGTCAAACAACAGGTCCATAGTTATTTAATTTCATTCTAAAAGACCATACTAACAAATTTTAAAAATAAATTG
GAAAAACATTGATTTTAAACTGATCCCGATTTTGAAACTAATCCAAACAAATTCAGTTTGAAATGGAAGGTCAACGGTGA
TTTACTTTAACAAATTCAATTTGCTGAGTGAAACCATCCAAACATAAAGTACTCTCACAATCACATGGGTTTCTTAAAAT
TGGAAAAACATAAATGCATTGCAGTAAGTCTTCATTACTTGCCTCAAGACTCGAAACCAAACCGTTGACCATTATACAGA
AAATCAGAAAAATAAACTCTGATAAAGATTATAAAATGGCAAATAGGTAATAGTACAAAAATCATTCTCCCAGTTCTATA
AATCGCTTAACACACGATAACTAGTGTTAACACATGACTCAAGTTCATCACCAAAAGCAGAACATTACTACCGAATTTCA
GAGCATTTACGCACCAGTCCTTAATGAAGCTAATCCTGCCATAAGAGCTGCTTGCATGACACAATATTTCAACATCAACA
AACATCAGAAATTAGAAAAAATAAGTAACAACAGACATTCATTACTTTCACGGGAAGAAAATAAAGCTTTCTAGGCTGAA
ACAAACAGTAAACTAAACATGCAGAACAAATCAACGCTAG